Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HED4

Protein Details
Accession A0A179HED4    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-243LPNFRRKTLSKRRVPHKVTDKBasic
276-321KERAAQNERKEKQKERKEEKQREREAEFVPPEEGGRPKKKRKKTAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-245RKTLSKRRVPHKVTDKAK
276-320KERAAQNERKEKQKERKEEKQREREAEFVPPEEGGRPKKKRKKTA
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_06347  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MPSTHKKEKPWDTDDIDKWKIEQFTAKDNLGGTFAEESSFATLFPKYREVYLKEAWPLVTKALEKHGIACTLDLVEGSMTVKTTRKTFDPAAILNARDLIKLLARSVPAPQAVKILDDGVACDVIKIRNLVGSKDRFVKRRQRILGPNGSTLKALELLTQTYILVHGNTVSAMGPYKGLKEVRRVVEDCMNNVHPIYHIKELMIKRELAKDPELANESWDRFLPNFRRKTLSKRRVPHKVTDKAKKVYTPFPPAPEKSKVDKQIESGEYFLGKEAKERAAQNERKEKQKERKEEKQREREAEFVPPEEGGRPKKKRKKTAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.69
3 0.62
4 0.53
5 0.49
6 0.46
7 0.41
8 0.34
9 0.35
10 0.3
11 0.35
12 0.4
13 0.39
14 0.35
15 0.34
16 0.33
17 0.27
18 0.23
19 0.17
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.11
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.12
30 0.14
31 0.16
32 0.21
33 0.19
34 0.23
35 0.3
36 0.32
37 0.37
38 0.39
39 0.41
40 0.38
41 0.39
42 0.35
43 0.32
44 0.29
45 0.24
46 0.23
47 0.2
48 0.2
49 0.23
50 0.26
51 0.23
52 0.26
53 0.26
54 0.25
55 0.24
56 0.22
57 0.18
58 0.14
59 0.14
60 0.1
61 0.08
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.1
69 0.12
70 0.15
71 0.17
72 0.19
73 0.24
74 0.26
75 0.3
76 0.32
77 0.31
78 0.34
79 0.33
80 0.31
81 0.26
82 0.27
83 0.22
84 0.17
85 0.17
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.12
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.1
116 0.11
117 0.13
118 0.18
119 0.2
120 0.22
121 0.3
122 0.34
123 0.34
124 0.4
125 0.49
126 0.51
127 0.58
128 0.6
129 0.6
130 0.64
131 0.68
132 0.7
133 0.61
134 0.57
135 0.49
136 0.45
137 0.37
138 0.3
139 0.22
140 0.15
141 0.13
142 0.1
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.1
165 0.13
166 0.14
167 0.21
168 0.27
169 0.29
170 0.33
171 0.34
172 0.33
173 0.37
174 0.36
175 0.3
176 0.28
177 0.26
178 0.21
179 0.2
180 0.18
181 0.12
182 0.14
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.21
188 0.22
189 0.26
190 0.25
191 0.23
192 0.22
193 0.29
194 0.31
195 0.27
196 0.28
197 0.26
198 0.25
199 0.27
200 0.28
201 0.21
202 0.21
203 0.21
204 0.2
205 0.18
206 0.18
207 0.16
208 0.14
209 0.22
210 0.29
211 0.35
212 0.39
213 0.41
214 0.47
215 0.48
216 0.59
217 0.63
218 0.64
219 0.64
220 0.68
221 0.75
222 0.8
223 0.81
224 0.81
225 0.79
226 0.79
227 0.79
228 0.8
229 0.79
230 0.74
231 0.73
232 0.68
233 0.62
234 0.6
235 0.58
236 0.57
237 0.52
238 0.52
239 0.56
240 0.54
241 0.56
242 0.55
243 0.52
244 0.5
245 0.56
246 0.58
247 0.57
248 0.56
249 0.53
250 0.55
251 0.53
252 0.47
253 0.4
254 0.32
255 0.27
256 0.24
257 0.23
258 0.17
259 0.13
260 0.15
261 0.18
262 0.21
263 0.25
264 0.27
265 0.34
266 0.42
267 0.48
268 0.54
269 0.62
270 0.63
271 0.67
272 0.73
273 0.75
274 0.75
275 0.79
276 0.81
277 0.8
278 0.86
279 0.88
280 0.91
281 0.92
282 0.92
283 0.91
284 0.88
285 0.82
286 0.77
287 0.68
288 0.66
289 0.58
290 0.49
291 0.4
292 0.33
293 0.3
294 0.28
295 0.32
296 0.33
297 0.4
298 0.48
299 0.58
300 0.68
301 0.78