Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HDW4

Protein Details
Accession A0A179HDW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
504-526EATRRPKRADSSKQRPRKPRAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-77RSARGGGRGRGARGPRKAAKPRG
507-554RRPKRADSSKQRPRKPRAKAADKAAAAGDGSKASVVPRRYRPKRLAGP
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.5, cyto 6, mito 4, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG plj:VFPFJ_06627  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MDISSHREYGSPERETRDSSDADSDLEELQGDIAKFDESVREFLASHHGASDAPRSARGGGRGRGARGPRKAAKPRGDITARLSKVNQAFLAGDYDQAVDLAFEVIRINAETHQAWTALSSIFRERGELDRALSAMVYAAHLRPKDVSGWMRCASFALDTIEEDEKTNLNTARLCYSAALRADPTHIDARLGKAAVCHRQGHHAAAVAEYKIVLRSRPYDLDLVRKLAESCVDSKNPSTALPAAIQAYRQFFDHEIRSPASPELESLWHDVGIYVELFAAGERYGEAVHELKALSRWLVGRGSEKYWDGYQEDDREWDTGADRRSQVPEYSAHPSDETLYGNALPLDLRVRLATYRLKLGHETEALRHLGWFDTTDSHTADFVGDFPFLIYELGTELARCGRQALAIKYFELLRTEVAEPDPATLLQLGRCYLTLGEQPAAEECFLAAIDADEDSIEARVELANMYERAREDEEALILAAEAMALREAREQSSSVPAGGAESPEATRRPKRADSSKQRPRKPRAKAADKAAAAGDGSKASVVPRRYRPKRLAGPDKRLQDEQARAVKLSHQYEAVRDLKRQILAGRHDLVPAWMATSKELVDDFRSLKRFYTWDKYLRFLGPRGPPQHPGAGEPQDSELMQMYERLTRSIAPQGDVHGRDFGLPGLMSHEGIAFDDWLDLFLDYAIGLAIAHRRDEAYQICQAAKDSTVFQSSEHEFAIYVAWSVCAIYTNDEERCVALARHLMRDGAITDSYRMFALLSRLCQSPVSWYTSGPAQKFILRQIKAIDARHEGTPAEALGRSGIIDAGGGERVTGFEVDVCLLMLYGHILFTSTSYAYSLGYFLRARSLDPTNSMVNLSLGLAYVHYGLKRQSANRQYLLLQGQAFLFQYLQGAPNAAEESNTAKAERFYNVGRLFQLLGISYMGSNYYSTALELCRGAEGGEDLSACILMNSIVSLLSVGNKALAFSVLKSNLKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.5
3 0.51
4 0.46
5 0.4
6 0.36
7 0.37
8 0.32
9 0.3
10 0.27
11 0.23
12 0.18
13 0.17
14 0.14
15 0.09
16 0.09
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.16
25 0.15
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.2
30 0.21
31 0.29
32 0.24
33 0.22
34 0.2
35 0.19
36 0.18
37 0.2
38 0.25
39 0.22
40 0.22
41 0.23
42 0.24
43 0.27
44 0.3
45 0.36
46 0.37
47 0.35
48 0.43
49 0.46
50 0.47
51 0.52
52 0.57
53 0.58
54 0.57
55 0.63
56 0.63
57 0.69
58 0.76
59 0.78
60 0.79
61 0.79
62 0.74
63 0.74
64 0.7
65 0.62
66 0.59
67 0.6
68 0.52
69 0.47
70 0.44
71 0.42
72 0.42
73 0.43
74 0.36
75 0.27
76 0.27
77 0.24
78 0.28
79 0.21
80 0.18
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.17
101 0.16
102 0.15
103 0.14
104 0.15
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.23
114 0.28
115 0.27
116 0.25
117 0.23
118 0.23
119 0.21
120 0.19
121 0.14
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.14
128 0.15
129 0.16
130 0.17
131 0.18
132 0.19
133 0.24
134 0.3
135 0.3
136 0.36
137 0.37
138 0.36
139 0.35
140 0.33
141 0.28
142 0.21
143 0.18
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.17
148 0.18
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.14
153 0.15
154 0.19
155 0.17
156 0.17
157 0.19
158 0.2
159 0.21
160 0.21
161 0.21
162 0.18
163 0.19
164 0.22
165 0.21
166 0.21
167 0.19
168 0.19
169 0.2
170 0.2
171 0.22
172 0.2
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.22
177 0.24
178 0.23
179 0.2
180 0.2
181 0.26
182 0.31
183 0.33
184 0.34
185 0.31
186 0.39
187 0.41
188 0.4
189 0.36
190 0.32
191 0.28
192 0.26
193 0.27
194 0.19
195 0.17
196 0.14
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.17
203 0.22
204 0.24
205 0.26
206 0.29
207 0.3
208 0.37
209 0.36
210 0.36
211 0.31
212 0.3
213 0.28
214 0.23
215 0.24
216 0.18
217 0.19
218 0.21
219 0.23
220 0.23
221 0.24
222 0.25
223 0.23
224 0.21
225 0.21
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.2
240 0.22
241 0.23
242 0.24
243 0.25
244 0.25
245 0.25
246 0.24
247 0.22
248 0.18
249 0.16
250 0.14
251 0.14
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.1
260 0.08
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.14
286 0.15
287 0.18
288 0.2
289 0.21
290 0.22
291 0.22
292 0.22
293 0.21
294 0.22
295 0.18
296 0.19
297 0.21
298 0.21
299 0.21
300 0.2
301 0.2
302 0.18
303 0.18
304 0.15
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.18
309 0.18
310 0.2
311 0.22
312 0.24
313 0.23
314 0.21
315 0.21
316 0.21
317 0.26
318 0.25
319 0.23
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.2
324 0.17
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.12
340 0.16
341 0.16
342 0.21
343 0.22
344 0.23
345 0.24
346 0.26
347 0.26
348 0.24
349 0.24
350 0.2
351 0.22
352 0.21
353 0.19
354 0.17
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.1
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.03
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.1
390 0.14
391 0.17
392 0.2
393 0.21
394 0.21
395 0.21
396 0.21
397 0.19
398 0.16
399 0.13
400 0.09
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.1
428 0.09
429 0.07
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.06
464 0.05
465 0.04
466 0.03
467 0.02
468 0.02
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.03
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.12
480 0.12
481 0.1
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.08
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.07
491 0.09
492 0.12
493 0.16
494 0.19
495 0.24
496 0.29
497 0.35
498 0.43
499 0.53
500 0.6
501 0.67
502 0.74
503 0.78
504 0.81
505 0.84
506 0.84
507 0.82
508 0.8
509 0.79
510 0.79
511 0.79
512 0.76
513 0.73
514 0.71
515 0.62
516 0.54
517 0.44
518 0.34
519 0.24
520 0.19
521 0.13
522 0.05
523 0.05
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.1
528 0.13
529 0.18
530 0.27
531 0.38
532 0.45
533 0.53
534 0.58
535 0.63
536 0.68
537 0.72
538 0.75
539 0.72
540 0.75
541 0.74
542 0.72
543 0.65
544 0.57
545 0.5
546 0.44
547 0.39
548 0.37
549 0.36
550 0.32
551 0.29
552 0.29
553 0.3
554 0.31
555 0.29
556 0.23
557 0.2
558 0.2
559 0.21
560 0.26
561 0.28
562 0.24
563 0.23
564 0.24
565 0.24
566 0.25
567 0.25
568 0.22
569 0.22
570 0.24
571 0.28
572 0.28
573 0.25
574 0.25
575 0.24
576 0.21
577 0.16
578 0.12
579 0.09
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.12
590 0.13
591 0.17
592 0.2
593 0.2
594 0.2
595 0.21
596 0.23
597 0.25
598 0.32
599 0.33
600 0.38
601 0.4
602 0.41
603 0.42
604 0.42
605 0.39
606 0.32
607 0.34
608 0.32
609 0.38
610 0.4
611 0.4
612 0.4
613 0.4
614 0.43
615 0.36
616 0.32
617 0.3
618 0.29
619 0.27
620 0.24
621 0.23
622 0.19
623 0.18
624 0.17
625 0.12
626 0.09
627 0.08
628 0.09
629 0.09
630 0.12
631 0.12
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.15
636 0.19
637 0.2
638 0.18
639 0.18
640 0.21
641 0.26
642 0.26
643 0.25
644 0.2
645 0.19
646 0.17
647 0.17
648 0.14
649 0.1
650 0.08
651 0.07
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.06
661 0.05
662 0.06
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.03
673 0.03
674 0.03
675 0.03
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.08
680 0.09
681 0.1
682 0.14
683 0.16
684 0.17
685 0.2
686 0.21
687 0.21
688 0.21
689 0.22
690 0.18
691 0.17
692 0.14
693 0.13
694 0.13
695 0.15
696 0.15
697 0.14
698 0.18
699 0.19
700 0.2
701 0.18
702 0.16
703 0.13
704 0.14
705 0.14
706 0.09
707 0.08
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.07
715 0.09
716 0.12
717 0.15
718 0.16
719 0.17
720 0.17
721 0.15
722 0.16
723 0.15
724 0.12
725 0.11
726 0.16
727 0.17
728 0.2
729 0.2
730 0.19
731 0.18
732 0.19
733 0.18
734 0.15
735 0.14
736 0.12
737 0.13
738 0.13
739 0.14
740 0.12
741 0.11
742 0.09
743 0.09
744 0.14
745 0.15
746 0.17
747 0.19
748 0.2
749 0.21
750 0.21
751 0.2
752 0.22
753 0.23
754 0.27
755 0.24
756 0.24
757 0.24
758 0.3
759 0.34
760 0.28
761 0.28
762 0.24
763 0.27
764 0.28
765 0.35
766 0.39
767 0.34
768 0.36
769 0.34
770 0.41
771 0.43
772 0.44
773 0.4
774 0.35
775 0.37
776 0.35
777 0.34
778 0.26
779 0.22
780 0.2
781 0.15
782 0.12
783 0.1
784 0.1
785 0.09
786 0.09
787 0.08
788 0.07
789 0.07
790 0.05
791 0.05
792 0.05
793 0.06
794 0.07
795 0.06
796 0.06
797 0.06
798 0.06
799 0.07
800 0.07
801 0.06
802 0.06
803 0.07
804 0.07
805 0.07
806 0.07
807 0.06
808 0.06
809 0.06
810 0.05
811 0.05
812 0.05
813 0.05
814 0.05
815 0.05
816 0.05
817 0.06
818 0.09
819 0.08
820 0.08
821 0.09
822 0.1
823 0.1
824 0.1
825 0.11
826 0.09
827 0.12
828 0.13
829 0.12
830 0.18
831 0.17
832 0.18
833 0.22
834 0.27
835 0.26
836 0.28
837 0.31
838 0.27
839 0.28
840 0.27
841 0.23
842 0.18
843 0.16
844 0.13
845 0.09
846 0.08
847 0.07
848 0.06
849 0.06
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.11
854 0.12
855 0.18
856 0.24
857 0.27
858 0.36
859 0.43
860 0.5
861 0.51
862 0.52
863 0.47
864 0.48
865 0.47
866 0.4
867 0.32
868 0.26
869 0.23
870 0.22
871 0.21
872 0.15
873 0.13
874 0.09
875 0.1
876 0.1
877 0.11
878 0.1
879 0.11
880 0.11
881 0.13
882 0.14
883 0.12
884 0.12
885 0.11
886 0.15
887 0.18
888 0.19
889 0.18
890 0.17
891 0.2
892 0.22
893 0.23
894 0.23
895 0.21
896 0.3
897 0.32
898 0.33
899 0.31
900 0.31
901 0.3
902 0.27
903 0.26
904 0.17
905 0.15
906 0.13
907 0.13
908 0.1
909 0.1
910 0.09
911 0.09
912 0.08
913 0.08
914 0.1
915 0.09
916 0.1
917 0.12
918 0.12
919 0.13
920 0.14
921 0.13
922 0.12
923 0.12
924 0.12
925 0.11
926 0.11
927 0.1
928 0.11
929 0.1
930 0.09
931 0.09
932 0.09
933 0.08
934 0.07
935 0.06
936 0.05
937 0.05
938 0.05
939 0.05
940 0.05
941 0.05
942 0.06
943 0.06
944 0.08
945 0.09
946 0.09
947 0.11
948 0.11
949 0.11
950 0.11
951 0.13
952 0.12
953 0.13
954 0.21
955 0.25