Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HHM6

Protein Details
Accession A0A179HHM6    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-160EPYLEDRRKLRRRGRNGTRLTHBasic
242-261VDARGGSRSRSRSRSRSRSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-153RKLRRRGR
249-259RSRSRSRSRSR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.5, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG plj:VFPFJ_06131  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKNPDVVRADARRFLDERGSSASLAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVSFIGGTHGASQKPSPFLCLAFKLLELAPSDDILREYLAFGGDEFKYLRALACFYVRLTRQAADVYTTLEPYLEDRRKLRRRGRNGTRLTHVDEFVDELLVGDRVCATSLWKMPKRDVLEDLEVLEPRVSPLGDLEDLLEEDDEEGEAEQEGSERQNGDDAGSEEGEDRDMDVDARGGSRSRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.43
4 0.37
5 0.35
6 0.35
7 0.35
8 0.3
9 0.3
10 0.31
11 0.23
12 0.23
13 0.21
14 0.16
15 0.17
16 0.16
17 0.15
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.22
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.27
41 0.26
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.08
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.18
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.18
74 0.2
75 0.21
76 0.2
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.08
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.11
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.17
129 0.17
130 0.19
131 0.23
132 0.33
133 0.41
134 0.51
135 0.58
136 0.6
137 0.67
138 0.76
139 0.83
140 0.83
141 0.81
142 0.77
143 0.72
144 0.65
145 0.6
146 0.51
147 0.41
148 0.31
149 0.25
150 0.21
151 0.16
152 0.13
153 0.08
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.1
165 0.15
166 0.24
167 0.3
168 0.32
169 0.34
170 0.41
171 0.44
172 0.43
173 0.42
174 0.38
175 0.36
176 0.34
177 0.33
178 0.28
179 0.23
180 0.21
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.1
224 0.1
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.15
235 0.22
236 0.3
237 0.38
238 0.46
239 0.55
240 0.64
241 0.74