Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179H7V9

Protein Details
Accession A0A179H7V9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
333-379ETPATEDGDKKKRKKHEGETPDEKAERKRRKAEKKAAKAAKKAGKGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
342-377KKKRKKHEGETPDEKAERKRRKAEKKAAKAAKKAGK
Subcellular Location(s) mito 9.5, nucl 9, cyto_mito 9, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR002478  PUA  
IPR015947  PUA-like_sf  
IPR036974  PUA_sf  
IPR004802  tRNA_PsdUridine_synth_B_fam  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG plj:VFPFJ_07908  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01472  PUA  
PF01509  TruB_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50890  PUA  
CDD cd21148  PUA_Cbf5  
Amino Acid Sequences MSANPPHRCEKTGHSGTLDPKVTGCLIVCIDRATRLVKSQQGAGKEYVCVIRMHDKVPGGQAAFARALETLTGALFQRPPLISAVKRHSTTTATWASSGSAARPVPTSEPCACTWVCCWVWVPTCRSCAACEAVPWTRRSSWSPCTTCWTRSGPWTTPVTSHTCARSFLRSRRSLRRTSALSSRTAPSTPCATAPSSCSPVSCDMVGSGIEHHEEVVLMTTKGEAIALGIAQMSTVEMSTCDHGVVAKVKRCIMERDLYPRRWGLGPVAAEKKKLKADGKLDKFGRPNDATPAKWTAGYQDYSMTDASAAAAAAATTPQKVVEETKMEIVQAETPATEDGDKKKRKKHEGETPDEKAERKRRKAEKKAAKAAKKAGKGEAADDDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.53
4 0.57
5 0.51
6 0.4
7 0.34
8 0.33
9 0.29
10 0.25
11 0.21
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.2
20 0.2
21 0.2
22 0.23
23 0.28
24 0.32
25 0.33
26 0.38
27 0.39
28 0.4
29 0.42
30 0.4
31 0.35
32 0.3
33 0.3
34 0.25
35 0.23
36 0.19
37 0.19
38 0.25
39 0.26
40 0.26
41 0.28
42 0.28
43 0.28
44 0.31
45 0.31
46 0.23
47 0.24
48 0.23
49 0.22
50 0.22
51 0.2
52 0.17
53 0.13
54 0.12
55 0.1
56 0.09
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.17
68 0.22
69 0.23
70 0.29
71 0.37
72 0.38
73 0.4
74 0.4
75 0.39
76 0.37
77 0.36
78 0.35
79 0.33
80 0.27
81 0.27
82 0.26
83 0.24
84 0.23
85 0.22
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.19
94 0.24
95 0.22
96 0.25
97 0.25
98 0.27
99 0.26
100 0.23
101 0.22
102 0.23
103 0.21
104 0.19
105 0.19
106 0.21
107 0.27
108 0.3
109 0.34
110 0.3
111 0.32
112 0.33
113 0.32
114 0.28
115 0.26
116 0.24
117 0.2
118 0.17
119 0.2
120 0.24
121 0.27
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.28
126 0.32
127 0.33
128 0.35
129 0.42
130 0.43
131 0.41
132 0.47
133 0.47
134 0.44
135 0.42
136 0.39
137 0.31
138 0.34
139 0.39
140 0.33
141 0.35
142 0.36
143 0.32
144 0.3
145 0.31
146 0.3
147 0.26
148 0.27
149 0.25
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.3
154 0.3
155 0.35
156 0.42
157 0.47
158 0.52
159 0.6
160 0.64
161 0.62
162 0.61
163 0.6
164 0.55
165 0.5
166 0.52
167 0.44
168 0.4
169 0.36
170 0.33
171 0.28
172 0.26
173 0.22
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.19
188 0.19
189 0.15
190 0.13
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.13
233 0.18
234 0.21
235 0.23
236 0.25
237 0.27
238 0.29
239 0.32
240 0.3
241 0.31
242 0.3
243 0.38
244 0.44
245 0.43
246 0.44
247 0.4
248 0.38
249 0.34
250 0.31
251 0.24
252 0.22
253 0.22
254 0.25
255 0.33
256 0.31
257 0.34
258 0.35
259 0.36
260 0.35
261 0.39
262 0.37
263 0.37
264 0.46
265 0.53
266 0.57
267 0.62
268 0.6
269 0.59
270 0.6
271 0.54
272 0.53
273 0.45
274 0.4
275 0.4
276 0.43
277 0.38
278 0.38
279 0.4
280 0.33
281 0.3
282 0.29
283 0.24
284 0.24
285 0.25
286 0.21
287 0.2
288 0.2
289 0.21
290 0.21
291 0.16
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.07
296 0.06
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.09
308 0.12
309 0.17
310 0.2
311 0.21
312 0.25
313 0.25
314 0.24
315 0.23
316 0.21
317 0.19
318 0.16
319 0.15
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.21
327 0.31
328 0.4
329 0.47
330 0.55
331 0.65
332 0.74
333 0.81
334 0.83
335 0.84
336 0.85
337 0.88
338 0.88
339 0.84
340 0.8
341 0.72
342 0.65
343 0.63
344 0.64
345 0.64
346 0.65
347 0.69
348 0.73
349 0.82
350 0.9
351 0.91
352 0.92
353 0.92
354 0.94
355 0.94
356 0.91
357 0.88
358 0.87
359 0.85
360 0.81
361 0.74
362 0.69
363 0.65
364 0.58
365 0.53
366 0.5
367 0.46