Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HVI0

Protein Details
Accession A0A179HVI0    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MPKNKGKGGKNRRRGTKENDDQRRELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-16KNKGKGGKNRRRGT
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 4, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG plj:VFPFJ_00496  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01176  eIF-1a  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MPKNKGKGGKNRRRGTKENDDQRRELTFKEDGQEYAQVIKMLGNGRLEALCFDGSKRLANIRGKMRKKVWINQGDIILLSLRDFQDNKGDVILKYTADEARTLKSYGELPEHAKINETDTFGQGEDGEAYFEFGDADSDEESDVEGGKKEVDIDDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.84
3 0.84
4 0.84
5 0.84
6 0.85
7 0.8
8 0.74
9 0.69
10 0.65
11 0.55
12 0.46
13 0.4
14 0.33
15 0.29
16 0.31
17 0.29
18 0.24
19 0.25
20 0.26
21 0.21
22 0.19
23 0.18
24 0.15
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.1
36 0.11
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.21
46 0.25
47 0.31
48 0.37
49 0.46
50 0.49
51 0.55
52 0.55
53 0.56
54 0.57
55 0.59
56 0.59
57 0.56
58 0.56
59 0.51
60 0.49
61 0.4
62 0.35
63 0.27
64 0.18
65 0.1
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.15
78 0.17
79 0.17
80 0.11
81 0.1
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.12
86 0.11
87 0.12
88 0.14
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.15
93 0.15
94 0.18
95 0.17
96 0.19
97 0.22
98 0.24
99 0.23
100 0.22
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.18
107 0.19
108 0.17
109 0.18
110 0.14
111 0.11
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.07
122 0.06
123 0.08
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.1