Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179HSW6

Protein Details
Accession A0A179HSW6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-74LVWRGGRRFKPAKKEVPVEKPNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-65RRFKPAKK
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 7, plas 6, cyto 3, pero 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG plj:VFPFJ_01812  -  
Amino Acid Sequences MGTPTPRIRRTAQNTQFTYNLSRRISDVKTYPVQSPQGATVLIYGHENGVTLVWRGGRRFKPAKKEVPVEKPNGKADDAVMIIDSDDDELPAKTHATPKFEDKPEFEDVAEQTPYAEIIQTLDLTLGTAVLNVAVMPMAPCTSEEAAAGDAPILAEKMVFAVSCITSDVYVISLPLTPPSPESKARPDLRTDLLSGRAGSGAWGESLVLLGGQTRHSDGLAMTLLRPKSPERRGAGRAVVAACSRQASGTLHLWDVSLDDKNKPDRAVEPFQTEFLPEPLSAISFNPTRNTQLLTVSPHQAARIYDFAVSSLPPDSDATGPFPSQGSWLLSLYQPFARPSAARKPILDAAWVSHGRAVFALLADGMWGIWDVDGVSPSSPSAAMATRLKSGVRGAALTAFSVSGYVEGTGALRSVAAQAKENQTGEFAPMTPHTRRQATASLSAATSLDRLSTVRGGVSTVALPSTGRTAQDESLVLWVGGYEHVCVIPGVSRFWESQLRRGSGGGVNLFSGAQPTRMVKLLDLSTGLLGERCCGVSLVADPSRSGDHVDSDGGLPVDVLLRGETRIVIVGQGDDGPGKRVGGVVDAQRKRLFSKGERSDAIIVHGRDGRKPSFSYNLSTSKPGTLRLKALNGQGDLEASPGAGDSPSVAPRRRVGFDFMNTLEDAADVSADLSRDVEAEMLDIMEIDQALESMEGSRGNARKRVFFEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.7
3 0.67
4 0.59
5 0.58
6 0.52
7 0.5
8 0.42
9 0.39
10 0.38
11 0.43
12 0.43
13 0.42
14 0.41
15 0.41
16 0.46
17 0.47
18 0.48
19 0.47
20 0.48
21 0.42
22 0.4
23 0.35
24 0.3
25 0.27
26 0.24
27 0.19
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.12
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.11
40 0.14
41 0.17
42 0.2
43 0.3
44 0.34
45 0.42
46 0.52
47 0.58
48 0.64
49 0.71
50 0.78
51 0.77
52 0.82
53 0.81
54 0.82
55 0.81
56 0.79
57 0.75
58 0.71
59 0.69
60 0.63
61 0.54
62 0.44
63 0.37
64 0.33
65 0.27
66 0.22
67 0.16
68 0.13
69 0.12
70 0.11
71 0.1
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.19
82 0.23
83 0.27
84 0.3
85 0.37
86 0.46
87 0.5
88 0.53
89 0.49
90 0.5
91 0.5
92 0.48
93 0.4
94 0.35
95 0.3
96 0.3
97 0.27
98 0.21
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.11
103 0.1
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.09
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.04
147 0.05
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.11
166 0.15
167 0.19
168 0.22
169 0.27
170 0.33
171 0.41
172 0.47
173 0.47
174 0.47
175 0.47
176 0.48
177 0.45
178 0.39
179 0.32
180 0.29
181 0.28
182 0.24
183 0.2
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.17
215 0.25
216 0.31
217 0.38
218 0.38
219 0.45
220 0.49
221 0.51
222 0.5
223 0.42
224 0.39
225 0.32
226 0.28
227 0.21
228 0.18
229 0.14
230 0.12
231 0.11
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.15
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.13
247 0.16
248 0.2
249 0.22
250 0.22
251 0.22
252 0.23
253 0.29
254 0.34
255 0.33
256 0.34
257 0.32
258 0.33
259 0.31
260 0.28
261 0.21
262 0.16
263 0.15
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.13
274 0.14
275 0.16
276 0.17
277 0.18
278 0.16
279 0.17
280 0.18
281 0.21
282 0.22
283 0.22
284 0.22
285 0.2
286 0.19
287 0.19
288 0.17
289 0.15
290 0.14
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.08
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.15
327 0.23
328 0.28
329 0.28
330 0.28
331 0.31
332 0.33
333 0.33
334 0.29
335 0.2
336 0.15
337 0.18
338 0.18
339 0.15
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.11
344 0.11
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.08
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.12
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.03
400 0.04
401 0.06
402 0.09
403 0.09
404 0.11
405 0.14
406 0.18
407 0.21
408 0.21
409 0.18
410 0.17
411 0.17
412 0.16
413 0.13
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.15
418 0.15
419 0.2
420 0.23
421 0.24
422 0.25
423 0.27
424 0.31
425 0.3
426 0.32
427 0.28
428 0.25
429 0.23
430 0.23
431 0.19
432 0.14
433 0.11
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.08
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.08
453 0.09
454 0.09
455 0.11
456 0.13
457 0.14
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.1
464 0.08
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.06
474 0.05
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.12
480 0.12
481 0.15
482 0.24
483 0.22
484 0.29
485 0.35
486 0.35
487 0.34
488 0.34
489 0.34
490 0.28
491 0.3
492 0.23
493 0.17
494 0.15
495 0.15
496 0.14
497 0.11
498 0.11
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.12
504 0.15
505 0.15
506 0.13
507 0.17
508 0.17
509 0.16
510 0.16
511 0.14
512 0.12
513 0.12
514 0.11
515 0.09
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.09
525 0.15
526 0.16
527 0.16
528 0.16
529 0.17
530 0.18
531 0.18
532 0.18
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.14
537 0.13
538 0.13
539 0.14
540 0.11
541 0.1
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.12
570 0.15
571 0.2
572 0.29
573 0.31
574 0.35
575 0.36
576 0.37
577 0.37
578 0.39
579 0.39
580 0.37
581 0.46
582 0.5
583 0.55
584 0.55
585 0.56
586 0.54
587 0.47
588 0.44
589 0.39
590 0.31
591 0.28
592 0.31
593 0.28
594 0.29
595 0.34
596 0.32
597 0.3
598 0.32
599 0.33
600 0.38
601 0.39
602 0.41
603 0.42
604 0.46
605 0.44
606 0.45
607 0.42
608 0.39
609 0.38
610 0.4
611 0.4
612 0.38
613 0.41
614 0.43
615 0.47
616 0.45
617 0.49
618 0.47
619 0.41
620 0.38
621 0.33
622 0.29
623 0.23
624 0.19
625 0.14
626 0.08
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.05
631 0.05
632 0.06
633 0.09
634 0.15
635 0.21
636 0.24
637 0.27
638 0.33
639 0.39
640 0.41
641 0.41
642 0.42
643 0.44
644 0.45
645 0.48
646 0.43
647 0.4
648 0.35
649 0.33
650 0.26
651 0.19
652 0.15
653 0.09
654 0.07
655 0.05
656 0.05
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.08
663 0.08
664 0.08
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.06
681 0.08
682 0.08
683 0.1
684 0.17
685 0.22
686 0.27
687 0.33
688 0.35
689 0.41
690 0.46