Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175VSS0

Protein Details
Accession A0A175VSS0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-111AEDRNKTRERHKQEQQKRAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-143EKRRKRAA
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007667  Hypoxia_induced_domain  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04588  HIG_1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51503  HIG1  
Amino Acid Sequences MSDRPLSSRPLPSSFEDDEEFYNESGRQKILRKLKEEPLVPFGALLTVAAFTSAYRASRKGDHHKVQRMFRARVAAQAFTVVAMVAGGAYYAEDRNKTRERHKQEQQKRAEEHHQKWIRELEARDAEEKEFLEKLEKRRKRAAEKAGLETGTDGVAAQARAALKEAKGVKDAKEEKQDATNQNTTQKPIQTPDSQAKPESAILTALGGWLAGSRKTPEEPTQRPGDQKPDSEATRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.37
4 0.34
5 0.3
6 0.29
7 0.27
8 0.2
9 0.2
10 0.18
11 0.19
12 0.19
13 0.2
14 0.22
15 0.26
16 0.35
17 0.43
18 0.48
19 0.51
20 0.56
21 0.63
22 0.66
23 0.64
24 0.59
25 0.54
26 0.48
27 0.42
28 0.35
29 0.27
30 0.19
31 0.15
32 0.11
33 0.06
34 0.05
35 0.04
36 0.05
37 0.05
38 0.04
39 0.06
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.13
44 0.16
45 0.22
46 0.3
47 0.38
48 0.47
49 0.54
50 0.62
51 0.7
52 0.74
53 0.74
54 0.75
55 0.73
56 0.65
57 0.59
58 0.56
59 0.47
60 0.46
61 0.42
62 0.34
63 0.26
64 0.24
65 0.21
66 0.14
67 0.14
68 0.07
69 0.04
70 0.04
71 0.03
72 0.02
73 0.02
74 0.02
75 0.02
76 0.02
77 0.03
78 0.04
79 0.05
80 0.07
81 0.09
82 0.15
83 0.21
84 0.25
85 0.33
86 0.42
87 0.51
88 0.58
89 0.66
90 0.71
91 0.75
92 0.8
93 0.8
94 0.78
95 0.71
96 0.66
97 0.67
98 0.65
99 0.58
100 0.59
101 0.57
102 0.5
103 0.49
104 0.47
105 0.39
106 0.34
107 0.32
108 0.28
109 0.26
110 0.27
111 0.26
112 0.24
113 0.23
114 0.19
115 0.19
116 0.14
117 0.1
118 0.09
119 0.14
120 0.17
121 0.25
122 0.35
123 0.4
124 0.43
125 0.51
126 0.59
127 0.61
128 0.67
129 0.68
130 0.67
131 0.66
132 0.65
133 0.6
134 0.52
135 0.43
136 0.34
137 0.25
138 0.15
139 0.11
140 0.07
141 0.04
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.08
151 0.15
152 0.17
153 0.17
154 0.21
155 0.23
156 0.23
157 0.31
158 0.36
159 0.35
160 0.42
161 0.42
162 0.4
163 0.44
164 0.49
165 0.44
166 0.46
167 0.46
168 0.39
169 0.44
170 0.45
171 0.43
172 0.4
173 0.4
174 0.36
175 0.35
176 0.39
177 0.35
178 0.39
179 0.44
180 0.47
181 0.45
182 0.43
183 0.4
184 0.36
185 0.35
186 0.3
187 0.22
188 0.16
189 0.14
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.13
201 0.16
202 0.19
203 0.25
204 0.32
205 0.41
206 0.45
207 0.49
208 0.55
209 0.56
210 0.6
211 0.6
212 0.6
213 0.56
214 0.54
215 0.54
216 0.53