FuNGI

I3EI74

Protein Details

Accession

I3EI74

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
162-184	KTGFKFFHRVHRLKKHDTQKEIE	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 8, cyto 8, cyto_mito 8, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5

Amino Acid Sequences

MHREYIPREISRIKFEILTEKEIRGMSVLSVTSRDLYSSENKAPATTGPLDLRLGPSTKDAVCSTCGEKMAECVGHFGHIELALPVYHPGLLKNTHKVLQSVCKQCSSILLPAEVQAQLLIKLRARKGNRTLEQRVIKKVFDESKKTVECFSCNSINGIVRKTGFKFFHRVHRLKKHDTQKEIERTLYSASVKDNPELTNWINNTPDEYLSPITVQEVLRNITEDAKSLLGVSCDVVSLMITCLPVPPGTIRPSVMSLDSSSNEDDLTIKLSEISYTSQLIRDEIAKGASLHALAENWDLLQSQCAQLISSDSRPDAAKIRSLVQRLKGKHGRFRGNLSGKRVEFSGRTVISPDPNLSVEQVGIPEEMAKTLTVPIPITEGNKNKMSALSKNGCSTYPGANYLLKQDRRIFLRKDNNIVLEEGDILERHMQDSDVVLFNRQPSLHRLSIMAHKVKVLPGRTLRFNECVCSPYNADFDGDEMNIHLPQTVEARVEALELMGVKNNLSVPRNGQPLIAATQDFITGSYLITKKSTFFTKKQFGQFITYALPNSTERIRAKPTILRPAVIYTGKTLFSTALNLSISVEIRTRNYTPSTVPSAQNEGVFVMRDGEILFGRADKRIVGAEEGTIFHYELREGGPLVVVKALDAIARLCSRYLGESGFSIGLDDVFAEPDLYQLITKAVDACEVEAASKPADSTISILSRAREDAGKHCIERLSPHNSPVIMQACGSKGSLINVSQMVACVGQQVVGGQRISLDFGDRTLPHFQGDTNASRGFVRSSFCAGLLPTEFFFHAVSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKVLEGVYVAYDGTVRRGKQIIQMQFGDDGLDPVVLQKGTLTTDMPIAHSWAISTCTKLSEDKNSNGLSSLDRVHPSVVLIYDAVQSIWNSIYNSYAGIVTNDLWSMVNKSVGYTLFRHNNTHLIKLMNTFTKTHAMTAPVKQLFISKMLFQALKSQIEYGTAVGALAAQSIGEPGTQMTLKTFHLAGTSGASITLGVPRLKEIINASTAISTPLIKIIPLDGHFKYIPDRVQPILISDLAESVSINKTSAVFKISSSLIMKYNVDKEIKSLGGVKKDDTYYWEAPLEKYLPSEVDKLLKTKVKGISSVTRVITTDTEIIAEGTGLLDILGVEGVNSARTSTNNIYETYKTLGIEAARESIVKEIQYTIGQHGISVDTRHIGLLADVMCFTGEICGMTRFGLQKMGGSSVLTLASFEQTGEHLFTASYSGYEDQINGVSECIISGQRIPIGTGSFKILFDCNTKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.39
3	0.44
4	0.4
5	0.44
6	0.39
7	0.37
8	0.39
9	0.36
10	0.35
11	0.26
12	0.23
13	0.16
14	0.16
15	0.16
16	0.13
17	0.15
18	0.15
19	0.16
20	0.15
21	0.15
22	0.13
23	0.16
24	0.22
25	0.27
26	0.31
27	0.33
28	0.33
29	0.33
30	0.33
31	0.31
32	0.31
33	0.26
34	0.26
35	0.24
36	0.26
37	0.27
38	0.27
39	0.28
40	0.26
41	0.25
42	0.21
43	0.22
44	0.24
45	0.24
46	0.26
47	0.25
48	0.23
49	0.25
50	0.27
51	0.27
52	0.27
53	0.28
54	0.25
55	0.24
56	0.25
57	0.27
58	0.26
59	0.23
60	0.22
61	0.2
62	0.21
63	0.21
64	0.18
65	0.15
66	0.13
67	0.13
68	0.11
69	0.11
70	0.09
71	0.1
72	0.1
73	0.09
74	0.1
75	0.1
76	0.11
77	0.15
78	0.21
79	0.26
80	0.32
81	0.36
82	0.39
83	0.41
84	0.42
85	0.43
86	0.46
87	0.51
88	0.52
89	0.51
90	0.49
91	0.48
92	0.45
93	0.46
94	0.41
95	0.37
96	0.3
97	0.29
98	0.27
99	0.27
100	0.29
101	0.23
102	0.19
103	0.14
104	0.12
105	0.12
106	0.16
107	0.17
108	0.18
109	0.25
110	0.3
111	0.38
112	0.43
113	0.5
114	0.56
115	0.64
116	0.69
117	0.72
118	0.73
119	0.74
120	0.78
121	0.74
122	0.74
123	0.67
124	0.59
125	0.52
126	0.53
127	0.53
128	0.51
129	0.54
130	0.49
131	0.55
132	0.58
133	0.57
134	0.55
135	0.49
136	0.44
137	0.41
138	0.42
139	0.37
140	0.35
141	0.35
142	0.33
143	0.35
144	0.35
145	0.33
146	0.3
147	0.27
148	0.31
149	0.32
150	0.37
151	0.36
152	0.37
153	0.43
154	0.44
155	0.53
156	0.6
157	0.64
158	0.66
159	0.73
160	0.77
161	0.78
162	0.82
163	0.82
164	0.81
165	0.8
166	0.77
167	0.76
168	0.77
169	0.71
170	0.64
171	0.55
172	0.47
173	0.42
174	0.39
175	0.3
176	0.22
177	0.22
178	0.26
179	0.27
180	0.28
181	0.29
182	0.25
183	0.26
184	0.29
185	0.28
186	0.28
187	0.28
188	0.28
189	0.27
190	0.27
191	0.27
192	0.24
193	0.23
194	0.17
195	0.18
196	0.17
197	0.16
198	0.16
199	0.13
200	0.13
201	0.15
202	0.15
203	0.15
204	0.16
205	0.17
206	0.17
207	0.19
208	0.19
209	0.19
210	0.19
211	0.18
212	0.16
213	0.15
214	0.15
215	0.14
216	0.14
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.09
234	0.11
235	0.15
236	0.18
237	0.2
238	0.21
239	0.22
240	0.24
241	0.24
242	0.22
243	0.19
244	0.17
245	0.18
246	0.18
247	0.19
248	0.17
249	0.16
250	0.14
251	0.13
252	0.12
253	0.1
254	0.12
255	0.1
256	0.09
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.12
262	0.11
263	0.13
264	0.14
265	0.16
266	0.16
267	0.16
268	0.16
269	0.15
270	0.15
271	0.14
272	0.14
273	0.12
274	0.12
275	0.13
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.14
296	0.16
297	0.17
298	0.18
299	0.16
300	0.18
301	0.18
302	0.2
303	0.22
304	0.2
305	0.22
306	0.22
307	0.28
308	0.31
309	0.36
310	0.39
311	0.41
312	0.47
313	0.45
314	0.53
315	0.56
316	0.56
317	0.6
318	0.64
319	0.65
320	0.61
321	0.65
322	0.65
323	0.67
324	0.66
325	0.64
326	0.64
327	0.55
328	0.52
329	0.46
330	0.38
331	0.3
332	0.28
333	0.29
334	0.21
335	0.21
336	0.23
337	0.24
338	0.24
339	0.24
340	0.22
341	0.16
342	0.17
343	0.17
344	0.15
345	0.14
346	0.12
347	0.1
348	0.1
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.06
357	0.06
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.1
363	0.12
364	0.13
365	0.15
366	0.2
367	0.23
368	0.26
369	0.28
370	0.29
371	0.27
372	0.3
373	0.3
374	0.27
375	0.32
376	0.33
377	0.33
378	0.35
379	0.35
380	0.32
381	0.3
382	0.29
383	0.25
384	0.22
385	0.21
386	0.21
387	0.22
388	0.22
389	0.27
390	0.33
391	0.3
392	0.32
393	0.35
394	0.37
395	0.41
396	0.47
397	0.44
398	0.45
399	0.54
400	0.54
401	0.55
402	0.54
403	0.5
404	0.45
405	0.41
406	0.32
407	0.22
408	0.18
409	0.12
410	0.1
411	0.07
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.11
424	0.12
425	0.13
426	0.15
427	0.14
428	0.14
429	0.16
430	0.22
431	0.23
432	0.23
433	0.23
434	0.23
435	0.3
436	0.35
437	0.33
438	0.26
439	0.26
440	0.27
441	0.29
442	0.31
443	0.26
444	0.25
445	0.28
446	0.32
447	0.35
448	0.38
449	0.38
450	0.38
451	0.37
452	0.33
453	0.28
454	0.26
455	0.23
456	0.22
457	0.2
458	0.18
459	0.19
460	0.17
461	0.17
462	0.15
463	0.14
464	0.12
465	0.11
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.05
473	0.06
474	0.08
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.08
491	0.11
492	0.12
493	0.12
494	0.15
495	0.2
496	0.23
497	0.22
498	0.21
499	0.18
500	0.19
501	0.19
502	0.16
503	0.12
504	0.09
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.07
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.09
513	0.1
514	0.1
515	0.12
516	0.12
517	0.12
518	0.14
519	0.22
520	0.23
521	0.28
522	0.36
523	0.43
524	0.48
525	0.52
526	0.53
527	0.47
528	0.47
529	0.42
530	0.35
531	0.29
532	0.24
533	0.19
534	0.16
535	0.16
536	0.11
537	0.13
538	0.12
539	0.16
540	0.17
541	0.2
542	0.24
543	0.24
544	0.26
545	0.3
546	0.34
547	0.38
548	0.37
549	0.34
550	0.31
551	0.31
552	0.31
553	0.26
554	0.22
555	0.14
556	0.15
557	0.15
558	0.14
559	0.13
560	0.1
561	0.09
562	0.11
563	0.09
564	0.1
565	0.09
566	0.09
567	0.09
568	0.09
569	0.09
570	0.08
571	0.09
572	0.08
573	0.09
574	0.12
575	0.13
576	0.14
577	0.15
578	0.16
579	0.16
580	0.19
581	0.24
582	0.24
583	0.25
584	0.24
585	0.27
586	0.26
587	0.25
588	0.21
589	0.15
590	0.13
591	0.11
592	0.1
593	0.07
594	0.06
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.07
600	0.07
601	0.06
602	0.07
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.05
624	0.05
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.04
635	0.05
636	0.06
637	0.06
638	0.07
639	0.06
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.09
644	0.07
645	0.07
646	0.07
647	0.08
648	0.08
649	0.07
650	0.07
651	0.05
652	0.05
653	0.04
654	0.04
655	0.03
656	0.03
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.05
666	0.04
667	0.05
668	0.05
669	0.05
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.07
676	0.06
677	0.07
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.05
682	0.06
683	0.05
684	0.06
685	0.08
686	0.09
687	0.1
688	0.11
689	0.11
690	0.12
691	0.12
692	0.11
693	0.11
694	0.12
695	0.14
696	0.19
697	0.21
698	0.2
699	0.21
700	0.21
701	0.19
702	0.21
703	0.22
704	0.24
705	0.24
706	0.25
707	0.26
708	0.25
709	0.25
710	0.26
711	0.23
712	0.16
713	0.15
714	0.15
715	0.14
716	0.14
717	0.14
718	0.09
719	0.08
720	0.09
721	0.1
722	0.09
723	0.1
724	0.1
725	0.1
726	0.09
727	0.09
728	0.08
729	0.06
730	0.06
731	0.05
732	0.05
733	0.04
734	0.04
735	0.05
736	0.06
737	0.08
738	0.08
739	0.07
740	0.08
741	0.07
742	0.09
743	0.08
744	0.08
745	0.06
746	0.07
747	0.1
748	0.1
749	0.13
750	0.15
751	0.15
752	0.14
753	0.14
754	0.14
755	0.15
756	0.18
757	0.17
758	0.17
759	0.17
760	0.17
761	0.17
762	0.18
763	0.15
764	0.13
765	0.13
766	0.11
767	0.14
768	0.14
769	0.14
770	0.14
771	0.13
772	0.13
773	0.12
774	0.12
775	0.09
776	0.09
777	0.09
778	0.09
779	0.09
780	0.08
781	0.08
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.09
786	0.09
787	0.08
788	0.08
789	0.08
790	0.07
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.07
798	0.07
799	0.1
800	0.13
801	0.18
802	0.2
803	0.23
804	0.23
805	0.24
806	0.24
807	0.22
808	0.21
809	0.16
810	0.17
811	0.14
812	0.13
813	0.11
814	0.1
815	0.09
816	0.06
817	0.06
818	0.05
819	0.09
820	0.12
821	0.12
822	0.15
823	0.16
824	0.17
825	0.24
826	0.32
827	0.32
828	0.33
829	0.34
830	0.32
831	0.31
832	0.3
833	0.24
834	0.16
835	0.12
836	0.08
837	0.07
838	0.06
839	0.06
840	0.07
841	0.06
842	0.06
843	0.05
844	0.06
845	0.07
846	0.09
847	0.08
848	0.07
849	0.11
850	0.11
851	0.12
852	0.12
853	0.12
854	0.11
855	0.11
856	0.1
857	0.08
858	0.11
859	0.1
860	0.12
861	0.11
862	0.12
863	0.14
864	0.16
865	0.18
866	0.25
867	0.3
868	0.31
869	0.36
870	0.35
871	0.34
872	0.32
873	0.3
874	0.21
875	0.18
876	0.18
877	0.16
878	0.16
879	0.17
880	0.16
881	0.15
882	0.14
883	0.13
884	0.11
885	0.09
886	0.08
887	0.08
888	0.08
889	0.08
890	0.08
891	0.08
892	0.07
893	0.08
894	0.08
895	0.09
896	0.09
897	0.09
898	0.1
899	0.09
900	0.09
901	0.09
902	0.09
903	0.08
904	0.08
905	0.08
906	0.08
907	0.08
908	0.08
909	0.08
910	0.07
911	0.08
912	0.1
913	0.1
914	0.11
915	0.11
916	0.11
917	0.13
918	0.14
919	0.16
920	0.16
921	0.22
922	0.28
923	0.29
924	0.32
925	0.31
926	0.39
927	0.38
928	0.38
929	0.34
930	0.28
931	0.27
932	0.28
933	0.3
934	0.26
935	0.26
936	0.24
937	0.24
938	0.28
939	0.27
940	0.26
941	0.24
942	0.24
943	0.27
944	0.29
945	0.35
946	0.3
947	0.3
948	0.28
949	0.29
950	0.26
951	0.25
952	0.23
953	0.15
954	0.16
955	0.19
956	0.2
957	0.17
958	0.24
959	0.25
960	0.26
961	0.25
962	0.24
963	0.21
964	0.22
965	0.23
966	0.15
967	0.11
968	0.08
969	0.08
970	0.06
971	0.06
972	0.05
973	0.04
974	0.04
975	0.03
976	0.03
977	0.03
978	0.04
979	0.03
980	0.04
981	0.04
982	0.06
983	0.07
984	0.07
985	0.08
986	0.11
987	0.11
988	0.13
989	0.14
990	0.12
991	0.12
992	0.13
993	0.12
994	0.12
995	0.12
996	0.1
997	0.09
998	0.09
999	0.08
1000	0.08
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.11
1004	0.11
1005	0.12
1006	0.14
1007	0.14
1008	0.16
1009	0.17
1010	0.17
1011	0.18
1012	0.18
1013	0.18
1014	0.16
1015	0.16
1016	0.15
1017	0.13
1018	0.1
1019	0.09
1020	0.11
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.1
1025	0.14
1026	0.15
1027	0.2
1028	0.18
1029	0.22
1030	0.22
1031	0.23
1032	0.25
1033	0.25
1034	0.26
1035	0.26
1036	0.28
1037	0.25
1038	0.28
1039	0.27
1040	0.26
1041	0.24
1042	0.22
1043	0.18
1044	0.15
1045	0.14
1046	0.11
1047	0.11
1048	0.09
1049	0.08
1050	0.11
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.11
1054	0.12
1055	0.14
1056	0.15
1057	0.16
1058	0.14
1059	0.14
1060	0.17
1061	0.17
1062	0.19
1063	0.2
1064	0.2
1065	0.2
1066	0.22
1067	0.24
1068	0.24
1069	0.28
1070	0.29
1071	0.29
1072	0.27
1073	0.27
1074	0.29
1075	0.28
1076	0.25
1077	0.28
1078	0.27
1079	0.33
1080	0.34
1081	0.33
1082	0.33
1083	0.34
1084	0.34
1085	0.32
1086	0.35
1087	0.29
1088	0.31
1089	0.32
1090	0.28
1091	0.28
1092	0.31
1093	0.27
1094	0.2
1095	0.2
1096	0.19
1097	0.18
1098	0.19
1099	0.22
1100	0.2
1101	0.24
1102	0.25
1103	0.26
1104	0.32
1105	0.35
1106	0.33
1107	0.37
1108	0.42
1109	0.39
1110	0.41
1111	0.44
1112	0.46
1113	0.45
1114	0.5
1115	0.44
1116	0.38
1117	0.36
1118	0.35
1119	0.3
1120	0.24
1121	0.22
1122	0.16
1123	0.15
1124	0.14
1125	0.14
1126	0.11
1127	0.1
1128	0.07
1129	0.05
1130	0.05
1131	0.04
1132	0.04
1133	0.03
1134	0.03
1135	0.03
1136	0.04
1137	0.03
1138	0.03
1139	0.04
1140	0.05
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.07
1144	0.08
1145	0.09
1146	0.16
1147	0.19
1148	0.26
1149	0.27
1150	0.29
1151	0.32
1152	0.32
1153	0.34
1154	0.32
1155	0.3
1156	0.23
1157	0.21
1158	0.22
1159	0.19
1160	0.2
1161	0.18
1162	0.17
1163	0.15
1164	0.15
1165	0.15
1166	0.16
1167	0.17
1168	0.15
1169	0.15
1170	0.14
1171	0.16
1172	0.19
1173	0.2
1174	0.19
1175	0.21
1176	0.21
1177	0.2
1178	0.19
1179	0.19
1180	0.18
1181	0.18
1182	0.17
1183	0.14
1184	0.14
1185	0.14
1186	0.14
1187	0.11
1188	0.1
1189	0.12
1190	0.12
1191	0.11
1192	0.1
1193	0.1
1194	0.1
1195	0.1
1196	0.09
1197	0.07
1198	0.06
1199	0.07
1200	0.08
1201	0.1
1202	0.1
1203	0.11
1204	0.15
1205	0.16
1206	0.17
1207	0.21
1208	0.19
1209	0.22
1210	0.23
1211	0.25
1212	0.22
1213	0.21
1214	0.2
1215	0.16
1216	0.17
1217	0.13
1218	0.12
1219	0.1
1220	0.11
1221	0.1
1222	0.1
1223	0.09
1224	0.09
1225	0.12
1226	0.13
1227	0.12
1228	0.11
1229	0.1
1230	0.11
1231	0.12
1232	0.11
1233	0.09
1234	0.1
1235	0.11
1236	0.12
1237	0.13
1238	0.13
1239	0.13
1240	0.15
1241	0.16
1242	0.14
1243	0.13
1244	0.12
1245	0.11
1246	0.11
1247	0.11
1248	0.1
1249	0.09
1250	0.11
1251	0.14
1252	0.16
1253	0.16
1254	0.17
1255	0.18
1256	0.2
1257	0.21
1258	0.2
1259	0.23
1260	0.22
1261	0.22
1262	0.23
1263	0.23
1264	0.22

I3EI74

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer