Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175VY78

Protein Details
Accession A0A175VY78    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-291GALKKAQERVRRERERGKGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-288KKAQERVRRERERG
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012479  SAP30BP  
Gene Ontology GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07818  HCNGP  
Amino Acid Sequences MGLVQYDSSDEDEGSPTQTHPPEPEPSAKALPSNIKSDFQPHPTTTATAEPPLPPQPPAPEPGPLLGPALGPSRPPPEASQTAAVAAAAEEVDLSFLDADRPPNPSQPAEPPRSPYTTTRTLLRDLTLPSVANMDIPPSPPGSPPPGHDALTAKFDSFLRLKRTKGVHFNERLASSAGLRNPALMDKLLAFSGVETGFGDDDDDGGGGGGGGGGGSGGGAAAADNDDGGGGDDGRSQMGRKGGARRATEQYATVLSGEVWDPHCFPSWGFKGALKKAQERVRRERERGKGEAVEFVSATSVTAASSAGSGTPAEVGGGSRAGTPAGGGAGGSKRKGRFDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.21
5 0.23
6 0.24
7 0.26
8 0.3
9 0.33
10 0.36
11 0.42
12 0.38
13 0.41
14 0.42
15 0.39
16 0.37
17 0.36
18 0.4
19 0.37
20 0.4
21 0.37
22 0.36
23 0.36
24 0.4
25 0.41
26 0.38
27 0.41
28 0.36
29 0.37
30 0.37
31 0.37
32 0.33
33 0.33
34 0.29
35 0.25
36 0.26
37 0.23
38 0.25
39 0.29
40 0.28
41 0.24
42 0.25
43 0.28
44 0.28
45 0.31
46 0.29
47 0.28
48 0.28
49 0.28
50 0.26
51 0.21
52 0.2
53 0.16
54 0.14
55 0.12
56 0.14
57 0.12
58 0.12
59 0.14
60 0.17
61 0.18
62 0.2
63 0.21
64 0.26
65 0.29
66 0.31
67 0.3
68 0.26
69 0.26
70 0.24
71 0.21
72 0.13
73 0.1
74 0.07
75 0.04
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.04
82 0.03
83 0.04
84 0.05
85 0.07
86 0.09
87 0.1
88 0.15
89 0.16
90 0.21
91 0.24
92 0.23
93 0.25
94 0.33
95 0.39
96 0.41
97 0.42
98 0.43
99 0.43
100 0.45
101 0.45
102 0.39
103 0.38
104 0.39
105 0.39
106 0.39
107 0.37
108 0.36
109 0.35
110 0.32
111 0.28
112 0.22
113 0.23
114 0.19
115 0.17
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.13
129 0.16
130 0.17
131 0.17
132 0.23
133 0.24
134 0.24
135 0.24
136 0.24
137 0.21
138 0.23
139 0.22
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.16
144 0.16
145 0.19
146 0.23
147 0.25
148 0.26
149 0.31
150 0.36
151 0.38
152 0.45
153 0.46
154 0.47
155 0.47
156 0.49
157 0.45
158 0.41
159 0.37
160 0.29
161 0.23
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.02
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.01
201 0.01
202 0.01
203 0.01
204 0.01
205 0.01
206 0.01
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.12
226 0.15
227 0.18
228 0.25
229 0.31
230 0.38
231 0.4
232 0.42
233 0.45
234 0.46
235 0.43
236 0.36
237 0.32
238 0.25
239 0.23
240 0.18
241 0.13
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.22
254 0.23
255 0.25
256 0.25
257 0.28
258 0.34
259 0.38
260 0.45
261 0.4
262 0.43
263 0.48
264 0.56
265 0.6
266 0.61
267 0.66
268 0.71
269 0.75
270 0.78
271 0.79
272 0.8
273 0.79
274 0.75
275 0.7
276 0.64
277 0.56
278 0.54
279 0.46
280 0.38
281 0.3
282 0.26
283 0.21
284 0.15
285 0.14
286 0.08
287 0.07
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.08
316 0.14
317 0.18
318 0.21
319 0.27
320 0.29