Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175WBK5

Protein Details
Accession A0A175WBK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-257GSVRSRSRSRSASRSRPRSRSRSAGERSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-151RKLRRKG
235-252RSRSRSASRSRPRSRSRS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
IPR024767  PRP38_C  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
PF12871  PRP38_assoc  
Amino Acid Sequences MSKSAYHRADERRFLDERGSTGPLAPNGLNPATIMEKAVRERIVESYFYKEQCFGVNEADIVDRVVDHVDFIGGVYGTVQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDAILDEYLNFGGEKFKYLRALAVFYIRLTRPDRDVYTLLEPFLEDRRKLRRKGRNGTTLTYMDVFVDDLLTKDRVCATSLWKMRKRDILEDLEILEPRVSPLGNLEDLLEEEDEAMQNDDEANGDGHEEDSGSVRSRSRSRSASRSRPRSRSRSAGERSDHDRMDIDGKESRRSSGERSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.43
4 0.38
5 0.34
6 0.34
7 0.28
8 0.29
9 0.31
10 0.25
11 0.26
12 0.23
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.19
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.17
24 0.19
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.22
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.28
34 0.31
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.1
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.06
60 0.04
61 0.04
62 0.05
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.15
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.17
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.18
80 0.19
81 0.18
82 0.17
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.09
87 0.1
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.07
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.15
103 0.17
104 0.15
105 0.17
106 0.15
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.16
111 0.13
112 0.16
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.21
117 0.22
118 0.23
119 0.24
120 0.22
121 0.23
122 0.22
123 0.19
124 0.16
125 0.14
126 0.12
127 0.16
128 0.16
129 0.12
130 0.16
131 0.26
132 0.33
133 0.4
134 0.48
135 0.53
136 0.61
137 0.71
138 0.76
139 0.75
140 0.72
141 0.68
142 0.63
143 0.54
144 0.45
145 0.35
146 0.27
147 0.17
148 0.13
149 0.11
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.14
163 0.22
164 0.28
165 0.37
166 0.42
167 0.44
168 0.47
169 0.53
170 0.52
171 0.49
172 0.5
173 0.46
174 0.42
175 0.39
176 0.37
177 0.31
178 0.28
179 0.22
180 0.16
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.08
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.1
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.2
221 0.25
222 0.31
223 0.36
224 0.43
225 0.48
226 0.57
227 0.66
228 0.71
229 0.77
230 0.82
231 0.84
232 0.86
233 0.89
234 0.87
235 0.85
236 0.84
237 0.81
238 0.8
239 0.78
240 0.76
241 0.72
242 0.69
243 0.68
244 0.65
245 0.57
246 0.48
247 0.42
248 0.36
249 0.36
250 0.31
251 0.27
252 0.27
253 0.29
254 0.35
255 0.35
256 0.35
257 0.34
258 0.36