Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W1I5

Protein Details
Accession A0A175W1I5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
647-668DKQFQDRRRITRARNRPKHALFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13, nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026847  VPS13  
IPR031645  VPS13_DH-like  
IPR009543  VPS13_VAB  
Pfam View protein in Pfam  
PF06650  SHR-BD  
PF16909  VPS13_C  
Amino Acid Sequences MFSFNSDDHRNRALLKVGDSEWSKPQSFDAIGSTTEVVVNSPGRNAEVHLGVTVDSGQGKYKMVKTVTLAPRYVIQNKLDEDINIREPSSSSLLPIKSGSLRPLHYLQRGAIKQLCLCYPGVDNQWTAPFNISDLGTTHLKIARAGQRQRLIRVEILMEDATIFLNLSMEQKNWPFSMRNESDTEFTFYQVNPNIDEDGIEDRSGWRPVRYRLPPRSIMPYAWDFPAAKHKEVCINAYNKERHVKLAEIGNLMPMKFIGTNGQTKIIDINVTADGPTQTLILSNFKQSKSLYRQRSNAGSSSREGFEAKELDTGTTFRAQLRLSGIGVSLINSQLKELAYITFRDVQLRYSDSPLYQTVSLAVKWIQIDNQLYGGIFPMILYPSVVPKRAQEIEAHPSLHAMVTRVKDDSYGVEYIKYATILLQEMTVELDEDFIYAVLDFSRVPGASWSSSDEGDKLCDDNIDIPQPKQQQSGRDIYFEVLNIQPMQLDLSFVRTERVNVEDKTSSRNPVMFFFNVMTMALGNINDAPVRFNALMLENVRVSIPVLIQNISNHYSQEALYQIHKILGSADFLGNPVGLFNNISSGFADIFYEPYQGLIMSDRPEDFGLGLARGAGSFFKKSVYGFTDSLSKVTGSFAKGLAAATMDKQFQDRRRITRARNRPKHALFGVTAGANSLFTSVASGVGGLALKPLEGAEQEGALGFFKGIGKGVVGLATKPAIGVLDFASNVSEGVRNTTTVFDGSELDRVRLPRHVPADGIVRPYNQREALGQSWLKQVDNGKYFDEQYIAHLELPTEDMVVMVTYARILLIRSRRLQTEWDVPLKDIQTIAKERTGLSLTLRGGTNGPFIPIGQESGRTFIYKMVAVAVNEFNRRFKGLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.36
4 0.33
5 0.38
6 0.38
7 0.37
8 0.37
9 0.39
10 0.37
11 0.33
12 0.33
13 0.32
14 0.31
15 0.29
16 0.26
17 0.22
18 0.21
19 0.23
20 0.22
21 0.17
22 0.16
23 0.14
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.13
41 0.1
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.13
46 0.15
47 0.2
48 0.24
49 0.29
50 0.3
51 0.33
52 0.34
53 0.43
54 0.49
55 0.49
56 0.46
57 0.4
58 0.44
59 0.47
60 0.48
61 0.43
62 0.37
63 0.38
64 0.39
65 0.4
66 0.35
67 0.3
68 0.29
69 0.29
70 0.32
71 0.27
72 0.26
73 0.24
74 0.23
75 0.26
76 0.27
77 0.22
78 0.19
79 0.24
80 0.24
81 0.25
82 0.25
83 0.24
84 0.24
85 0.26
86 0.28
87 0.28
88 0.29
89 0.32
90 0.38
91 0.41
92 0.41
93 0.42
94 0.4
95 0.44
96 0.43
97 0.44
98 0.42
99 0.38
100 0.36
101 0.37
102 0.35
103 0.27
104 0.27
105 0.23
106 0.21
107 0.23
108 0.25
109 0.24
110 0.24
111 0.24
112 0.28
113 0.27
114 0.26
115 0.23
116 0.18
117 0.17
118 0.18
119 0.16
120 0.12
121 0.12
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.18
128 0.18
129 0.25
130 0.3
131 0.38
132 0.43
133 0.48
134 0.53
135 0.57
136 0.61
137 0.58
138 0.53
139 0.46
140 0.42
141 0.35
142 0.28
143 0.27
144 0.21
145 0.16
146 0.13
147 0.11
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.08
155 0.1
156 0.1
157 0.14
158 0.16
159 0.19
160 0.19
161 0.22
162 0.22
163 0.23
164 0.33
165 0.32
166 0.34
167 0.34
168 0.35
169 0.35
170 0.34
171 0.36
172 0.26
173 0.24
174 0.22
175 0.19
176 0.23
177 0.26
178 0.25
179 0.2
180 0.22
181 0.22
182 0.2
183 0.2
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.13
188 0.12
189 0.13
190 0.16
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.25
195 0.3
196 0.4
197 0.48
198 0.55
199 0.6
200 0.66
201 0.67
202 0.65
203 0.68
204 0.6
205 0.51
206 0.46
207 0.41
208 0.36
209 0.31
210 0.3
211 0.22
212 0.21
213 0.31
214 0.3
215 0.27
216 0.27
217 0.28
218 0.32
219 0.34
220 0.36
221 0.32
222 0.33
223 0.35
224 0.42
225 0.43
226 0.4
227 0.44
228 0.41
229 0.38
230 0.37
231 0.35
232 0.3
233 0.33
234 0.33
235 0.28
236 0.27
237 0.27
238 0.25
239 0.23
240 0.19
241 0.13
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.13
247 0.17
248 0.19
249 0.23
250 0.21
251 0.22
252 0.22
253 0.19
254 0.16
255 0.12
256 0.13
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.08
268 0.11
269 0.12
270 0.18
271 0.22
272 0.22
273 0.25
274 0.25
275 0.32
276 0.38
277 0.46
278 0.5
279 0.52
280 0.56
281 0.58
282 0.63
283 0.57
284 0.52
285 0.46
286 0.39
287 0.34
288 0.33
289 0.29
290 0.24
291 0.22
292 0.17
293 0.17
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.14
306 0.13
307 0.14
308 0.17
309 0.17
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.12
329 0.15
330 0.15
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.18
335 0.21
336 0.2
337 0.18
338 0.19
339 0.16
340 0.18
341 0.18
342 0.17
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.09
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.06
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.04
370 0.1
371 0.12
372 0.13
373 0.13
374 0.14
375 0.19
376 0.2
377 0.21
378 0.18
379 0.21
380 0.25
381 0.26
382 0.26
383 0.2
384 0.19
385 0.18
386 0.16
387 0.12
388 0.09
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.09
405 0.06
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.06
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.08
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.08
450 0.12
451 0.13
452 0.13
453 0.18
454 0.22
455 0.23
456 0.27
457 0.28
458 0.28
459 0.32
460 0.39
461 0.35
462 0.32
463 0.31
464 0.27
465 0.25
466 0.19
467 0.17
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.07
475 0.05
476 0.06
477 0.05
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.14
486 0.15
487 0.15
488 0.19
489 0.2
490 0.21
491 0.27
492 0.27
493 0.26
494 0.23
495 0.25
496 0.23
497 0.22
498 0.26
499 0.19
500 0.19
501 0.17
502 0.16
503 0.14
504 0.13
505 0.1
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.05
514 0.05
515 0.06
516 0.05
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.1
522 0.12
523 0.12
524 0.14
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.09
530 0.07
531 0.07
532 0.09
533 0.1
534 0.1
535 0.11
536 0.11
537 0.14
538 0.16
539 0.15
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.11
544 0.12
545 0.11
546 0.1
547 0.11
548 0.12
549 0.12
550 0.13
551 0.13
552 0.11
553 0.1
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.08
559 0.09
560 0.09
561 0.07
562 0.06
563 0.06
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.1
576 0.07
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.08
587 0.09
588 0.1
589 0.1
590 0.12
591 0.12
592 0.12
593 0.1
594 0.11
595 0.1
596 0.09
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.07
604 0.08
605 0.09
606 0.1
607 0.11
608 0.11
609 0.15
610 0.18
611 0.21
612 0.2
613 0.21
614 0.27
615 0.26
616 0.26
617 0.23
618 0.19
619 0.14
620 0.16
621 0.17
622 0.12
623 0.13
624 0.13
625 0.13
626 0.13
627 0.13
628 0.11
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.11
633 0.11
634 0.11
635 0.14
636 0.2
637 0.25
638 0.35
639 0.4
640 0.44
641 0.53
642 0.61
643 0.68
644 0.72
645 0.77
646 0.79
647 0.82
648 0.83
649 0.84
650 0.79
651 0.77
652 0.69
653 0.62
654 0.51
655 0.43
656 0.37
657 0.27
658 0.23
659 0.16
660 0.14
661 0.1
662 0.09
663 0.07
664 0.05
665 0.05
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.06
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.08
687 0.08
688 0.07
689 0.07
690 0.05
691 0.06
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.11
703 0.11
704 0.1
705 0.09
706 0.09
707 0.07
708 0.06
709 0.07
710 0.07
711 0.08
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.09
717 0.09
718 0.1
719 0.08
720 0.13
721 0.14
722 0.14
723 0.15
724 0.16
725 0.16
726 0.15
727 0.15
728 0.11
729 0.13
730 0.13
731 0.18
732 0.18
733 0.18
734 0.2
735 0.21
736 0.22
737 0.26
738 0.28
739 0.29
740 0.33
741 0.33
742 0.31
743 0.33
744 0.38
745 0.34
746 0.37
747 0.31
748 0.3
749 0.32
750 0.35
751 0.37
752 0.31
753 0.3
754 0.27
755 0.31
756 0.3
757 0.34
758 0.32
759 0.29
760 0.34
761 0.34
762 0.32
763 0.29
764 0.33
765 0.34
766 0.38
767 0.37
768 0.34
769 0.35
770 0.37
771 0.34
772 0.3
773 0.22
774 0.2
775 0.22
776 0.2
777 0.19
778 0.18
779 0.17
780 0.16
781 0.18
782 0.15
783 0.11
784 0.09
785 0.08
786 0.08
787 0.08
788 0.07
789 0.05
790 0.05
791 0.04
792 0.05
793 0.05
794 0.05
795 0.06
796 0.13
797 0.21
798 0.29
799 0.35
800 0.39
801 0.42
802 0.44
803 0.48
804 0.47
805 0.49
806 0.48
807 0.49
808 0.47
809 0.45
810 0.47
811 0.43
812 0.38
813 0.3
814 0.26
815 0.26
816 0.3
817 0.32
818 0.3
819 0.31
820 0.3
821 0.33
822 0.33
823 0.26
824 0.25
825 0.28
826 0.26
827 0.28
828 0.28
829 0.25
830 0.24
831 0.24
832 0.25
833 0.19
834 0.2
835 0.16
836 0.16
837 0.18
838 0.18
839 0.19
840 0.16
841 0.2
842 0.2
843 0.23
844 0.24
845 0.22
846 0.22
847 0.22
848 0.24
849 0.2
850 0.19
851 0.21
852 0.22
853 0.22
854 0.25
855 0.28
856 0.29
857 0.33
858 0.35
859 0.33
860 0.33