Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175WAE1

Protein Details
Accession A0A175WAE1    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-59LSLPEPPSKKARRALKKGKALPAKPHydrophilic
329-353GDDNTNSKKKQQTPKEPPRTRTRKWHydrophilic
374-399RYHKRFGKGAAKQRNHQEQNPKPRSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-59PSKKARRALKKGKALPAKP
77-78KK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034225  Nop13/Rnp24_RRM1  
IPR034226  Nop13/Rnp24_RRM2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12396  RRM1_Nop13p_fungi  
cd12397  RRM2_Nop13p_fungi  
Amino Acid Sequences MAAKHPTPTAAEEQQTASSSSKKRKSALTEIQVDLSLPEPPSKKARRALKKGKALPAKPASSDDEGDGKTDGTKSSKKKERSPHGVWIGNLRFSITKAELRKWLVDNSGGSITDDAITRVHMPTTKKPAGAPNKTATENRGFAYVDFASFEANVAAIALSETEMNGRKLLIKDSKSFEGRPKKEEAEVAADAAGGDATTGKNTSESNANKKTPGSTKIFVGNLSFNTTEDDLHAHFEKCGKIRWIKVATFEDSGKCKGYGWVNFEEPEAAQWAVKGFVKMRETVESVEDFMDVDGEQPAPTGEDSTTKDNNNKDAENDNGGDDGEDEDGDDNTNSKKKQQTPKEPPRTRTRKWWVNQLLGRNLKIELAEDDQTRYHKRFGKGAAKQRNHQEQNPKPRSGGGNHDGQDGSTTAKMEKPKKEIHYHNDISVARLTGAAVAHQGKKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.31
4 0.26
5 0.28
6 0.33
7 0.41
8 0.47
9 0.51
10 0.54
11 0.59
12 0.66
13 0.69
14 0.71
15 0.7
16 0.69
17 0.65
18 0.62
19 0.54
20 0.46
21 0.35
22 0.26
23 0.2
24 0.14
25 0.18
26 0.18
27 0.22
28 0.32
29 0.38
30 0.45
31 0.51
32 0.6
33 0.66
34 0.75
35 0.83
36 0.83
37 0.87
38 0.87
39 0.88
40 0.88
41 0.79
42 0.78
43 0.75
44 0.68
45 0.59
46 0.55
47 0.5
48 0.44
49 0.42
50 0.34
51 0.31
52 0.28
53 0.27
54 0.24
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.17
60 0.25
61 0.31
62 0.41
63 0.5
64 0.56
65 0.64
66 0.72
67 0.77
68 0.79
69 0.79
70 0.78
71 0.78
72 0.74
73 0.66
74 0.65
75 0.56
76 0.48
77 0.42
78 0.33
79 0.25
80 0.22
81 0.27
82 0.2
83 0.24
84 0.25
85 0.29
86 0.34
87 0.36
88 0.4
89 0.37
90 0.37
91 0.33
92 0.33
93 0.29
94 0.26
95 0.25
96 0.21
97 0.19
98 0.16
99 0.14
100 0.12
101 0.12
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.14
109 0.18
110 0.25
111 0.35
112 0.37
113 0.36
114 0.38
115 0.46
116 0.53
117 0.55
118 0.53
119 0.49
120 0.5
121 0.51
122 0.5
123 0.44
124 0.4
125 0.35
126 0.3
127 0.26
128 0.22
129 0.2
130 0.23
131 0.19
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.05
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.19
157 0.24
158 0.25
159 0.29
160 0.33
161 0.38
162 0.37
163 0.39
164 0.41
165 0.46
166 0.45
167 0.44
168 0.45
169 0.42
170 0.41
171 0.4
172 0.34
173 0.28
174 0.26
175 0.22
176 0.17
177 0.15
178 0.13
179 0.11
180 0.09
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.14
192 0.17
193 0.25
194 0.31
195 0.32
196 0.32
197 0.33
198 0.35
199 0.32
200 0.34
201 0.32
202 0.27
203 0.28
204 0.31
205 0.31
206 0.27
207 0.24
208 0.2
209 0.15
210 0.16
211 0.14
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.15
225 0.15
226 0.18
227 0.2
228 0.22
229 0.25
230 0.32
231 0.34
232 0.32
233 0.37
234 0.37
235 0.35
236 0.33
237 0.32
238 0.27
239 0.24
240 0.25
241 0.2
242 0.17
243 0.15
244 0.16
245 0.21
246 0.22
247 0.25
248 0.26
249 0.26
250 0.27
251 0.26
252 0.24
253 0.18
254 0.14
255 0.12
256 0.09
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.19
268 0.21
269 0.22
270 0.21
271 0.22
272 0.17
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.1
277 0.08
278 0.08
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.1
291 0.13
292 0.18
293 0.22
294 0.23
295 0.28
296 0.29
297 0.35
298 0.34
299 0.32
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.29
304 0.27
305 0.22
306 0.19
307 0.18
308 0.15
309 0.12
310 0.1
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.1
320 0.15
321 0.15
322 0.21
323 0.29
324 0.37
325 0.48
326 0.58
327 0.66
328 0.73
329 0.84
330 0.89
331 0.89
332 0.87
333 0.88
334 0.86
335 0.79
336 0.79
337 0.78
338 0.77
339 0.73
340 0.77
341 0.74
342 0.74
343 0.74
344 0.7
345 0.69
346 0.64
347 0.6
348 0.5
349 0.43
350 0.34
351 0.29
352 0.23
353 0.17
354 0.16
355 0.19
356 0.19
357 0.2
358 0.21
359 0.25
360 0.29
361 0.29
362 0.32
363 0.36
364 0.39
365 0.44
366 0.52
367 0.58
368 0.62
369 0.7
370 0.74
371 0.73
372 0.76
373 0.79
374 0.8
375 0.76
376 0.74
377 0.75
378 0.74
379 0.79
380 0.8
381 0.73
382 0.63
383 0.62
384 0.6
385 0.53
386 0.53
387 0.45
388 0.46
389 0.44
390 0.47
391 0.41
392 0.36
393 0.33
394 0.24
395 0.23
396 0.16
397 0.16
398 0.14
399 0.18
400 0.27
401 0.33
402 0.4
403 0.45
404 0.53
405 0.6
406 0.69
407 0.74
408 0.73
409 0.76
410 0.71
411 0.66
412 0.65
413 0.57
414 0.5
415 0.43
416 0.36
417 0.26
418 0.22
419 0.2
420 0.15
421 0.15
422 0.13
423 0.15
424 0.19
425 0.23
426 0.25
427 0.27