Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W7U4

Protein Details
Accession A0A175W7U4    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-134WETAPVHKDLKRRRRRATTASGSAKHydrophilic
270-294IAPPNKFPERKRRLRGRRSVSNSQHHydrophilic
511-534TGPLGPKAKWLDRRKVCQTEKCTIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-125KRRRRR
263-287RKHPPHRIAPPNKFPERKRRLRGRR
Subcellular Location(s) extr 11, golg 6, mito 4, plas 3, vacu 2, cyto_mito 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009291  Vps62  
Pfam View protein in Pfam  
PF06101  Vps62  
Amino Acid Sequences MIYNLRRATIASFSLASLLFLIWLLPRLLNPTPPNKEERERDKHWVNSSPYWLDRQACRWLSLCGIQHIRWDAPALPDDGSHSTLDAMRMLALGWSEERIFIEKPETSTWETAPVHKDLKRRRRRATTASGSAKILEEVPDYVLAHAPLVHLYSGENFWPSDIAEHIRQTRPFKNGSLVDTGKPLHLGNLASLNAGNGTVFLTSHDDVEMRPEWLHSRKGFPVPFEDDDEASDGPSGEDKEHWGSHGQPQRPQDGTTWWDADRKHPPHRIAPPNKFPERKRRLRGRRSVSNSQHPIVGSAPQDGGSSPSGYAKSPAVLILVDKGAGILDAFWFFFYSYNLGQTVLKIRFGNHVGDWEHCMVRFQHGVPRAMFLSEHAGGKAYAWRALEKRPQKDGKPARPVIYSAVGSHAMYASPGMHPYVLPFKLLKDITDKGPLWDPALNNYAYWYDYEADQDEAQNPPTQERTSLTPAASNPDVPTSWFHFEGPWGDDVYPLSDRRQWRLFGEYHYITGPLGPKAKWLDRRKVCQTEKCTILDSIEEGKKSAWY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.17
4 0.13
5 0.11
6 0.08
7 0.07
8 0.08
9 0.06
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.16
15 0.18
16 0.25
17 0.3
18 0.38
19 0.44
20 0.47
21 0.52
22 0.53
23 0.6
24 0.62
25 0.67
26 0.66
27 0.65
28 0.71
29 0.74
30 0.74
31 0.72
32 0.71
33 0.67
34 0.64
35 0.64
36 0.6
37 0.53
38 0.51
39 0.49
40 0.45
41 0.42
42 0.42
43 0.45
44 0.42
45 0.42
46 0.39
47 0.37
48 0.35
49 0.37
50 0.35
51 0.33
52 0.35
53 0.33
54 0.37
55 0.39
56 0.36
57 0.3
58 0.3
59 0.25
60 0.23
61 0.24
62 0.21
63 0.18
64 0.17
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.13
74 0.11
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.13
88 0.13
89 0.17
90 0.17
91 0.2
92 0.22
93 0.25
94 0.26
95 0.27
96 0.26
97 0.3
98 0.29
99 0.31
100 0.32
101 0.31
102 0.34
103 0.36
104 0.44
105 0.46
106 0.57
107 0.63
108 0.7
109 0.76
110 0.8
111 0.85
112 0.86
113 0.86
114 0.84
115 0.83
116 0.79
117 0.71
118 0.61
119 0.53
120 0.44
121 0.34
122 0.25
123 0.17
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.12
151 0.13
152 0.17
153 0.21
154 0.25
155 0.3
156 0.35
157 0.38
158 0.39
159 0.39
160 0.37
161 0.4
162 0.38
163 0.37
164 0.38
165 0.34
166 0.31
167 0.31
168 0.3
169 0.23
170 0.21
171 0.18
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.14
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.15
201 0.18
202 0.24
203 0.21
204 0.25
205 0.27
206 0.34
207 0.34
208 0.31
209 0.33
210 0.33
211 0.33
212 0.32
213 0.3
214 0.23
215 0.23
216 0.23
217 0.18
218 0.12
219 0.11
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.2
233 0.26
234 0.27
235 0.28
236 0.31
237 0.35
238 0.35
239 0.34
240 0.28
241 0.24
242 0.24
243 0.22
244 0.22
245 0.18
246 0.2
247 0.2
248 0.24
249 0.3
250 0.33
251 0.38
252 0.42
253 0.45
254 0.49
255 0.58
256 0.63
257 0.63
258 0.65
259 0.66
260 0.68
261 0.71
262 0.7
263 0.64
264 0.65
265 0.66
266 0.67
267 0.68
268 0.71
269 0.76
270 0.8
271 0.86
272 0.83
273 0.84
274 0.82
275 0.83
276 0.78
277 0.76
278 0.7
279 0.6
280 0.53
281 0.43
282 0.36
283 0.27
284 0.24
285 0.15
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.12
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.17
331 0.15
332 0.18
333 0.17
334 0.18
335 0.21
336 0.23
337 0.25
338 0.18
339 0.22
340 0.2
341 0.21
342 0.22
343 0.2
344 0.19
345 0.16
346 0.18
347 0.14
348 0.16
349 0.17
350 0.15
351 0.19
352 0.23
353 0.26
354 0.25
355 0.27
356 0.24
357 0.22
358 0.21
359 0.16
360 0.17
361 0.15
362 0.15
363 0.13
364 0.14
365 0.13
366 0.14
367 0.16
368 0.12
369 0.13
370 0.13
371 0.17
372 0.18
373 0.25
374 0.33
375 0.38
376 0.43
377 0.5
378 0.56
379 0.55
380 0.64
381 0.69
382 0.69
383 0.71
384 0.7
385 0.64
386 0.59
387 0.57
388 0.49
389 0.43
390 0.34
391 0.24
392 0.23
393 0.21
394 0.19
395 0.18
396 0.14
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.17
408 0.16
409 0.17
410 0.17
411 0.18
412 0.24
413 0.25
414 0.24
415 0.23
416 0.25
417 0.27
418 0.34
419 0.33
420 0.29
421 0.33
422 0.33
423 0.3
424 0.3
425 0.27
426 0.24
427 0.27
428 0.25
429 0.2
430 0.21
431 0.19
432 0.16
433 0.16
434 0.14
435 0.11
436 0.11
437 0.14
438 0.13
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.15
443 0.16
444 0.17
445 0.19
446 0.19
447 0.19
448 0.22
449 0.22
450 0.22
451 0.23
452 0.27
453 0.3
454 0.33
455 0.3
456 0.3
457 0.3
458 0.34
459 0.33
460 0.28
461 0.23
462 0.22
463 0.22
464 0.2
465 0.24
466 0.23
467 0.26
468 0.26
469 0.25
470 0.23
471 0.25
472 0.27
473 0.26
474 0.21
475 0.19
476 0.18
477 0.19
478 0.19
479 0.2
480 0.2
481 0.19
482 0.2
483 0.25
484 0.28
485 0.34
486 0.39
487 0.38
488 0.38
489 0.43
490 0.43
491 0.43
492 0.48
493 0.42
494 0.39
495 0.36
496 0.33
497 0.26
498 0.27
499 0.24
500 0.2
501 0.23
502 0.21
503 0.26
504 0.33
505 0.42
506 0.49
507 0.55
508 0.61
509 0.66
510 0.76
511 0.8
512 0.84
513 0.85
514 0.84
515 0.82
516 0.8
517 0.75
518 0.68
519 0.62
520 0.52
521 0.44
522 0.36
523 0.32
524 0.32
525 0.31
526 0.29
527 0.27