Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W558

Protein Details
Accession A0A175W558    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-32SDSFSKPRPRPPKSPAHSARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-34KPRPRPPKSPAHSARIR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 3, extr 2, pero 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040233  CCD97-like_C  
IPR018613  Ccdc97-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF09747  CCD97-like_C  
Amino Acid Sequences MARFDSPPATPDSDSFSKPRPRPPKSPAHSARIRVQNRRREYLQRHPSYLQSSEHEFADPLLYDFLIRRFQTPSEREAEGRAKGYARVLEGSLLRGEERLAKLRAETVDKSQAAASSPLTTVANSRAGERGGPAEAGTSFSSLSAELIPPPKTKDEGRRQWEDFLRDRFVRGEDEDFDYAAVDGDDEYDVLERGDREDVWFEEEDPGWASDTESGSDGEEVSGGGGRRRVRAEKLLQGETGVQDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.38
4 0.44
5 0.47
6 0.57
7 0.6
8 0.64
9 0.71
10 0.75
11 0.78
12 0.74
13 0.81
14 0.77
15 0.76
16 0.75
17 0.71
18 0.72
19 0.71
20 0.72
21 0.71
22 0.73
23 0.74
24 0.74
25 0.75
26 0.72
27 0.72
28 0.73
29 0.73
30 0.75
31 0.71
32 0.69
33 0.64
34 0.63
35 0.57
36 0.52
37 0.44
38 0.37
39 0.36
40 0.33
41 0.31
42 0.27
43 0.22
44 0.19
45 0.18
46 0.15
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.21
58 0.29
59 0.3
60 0.32
61 0.3
62 0.31
63 0.29
64 0.32
65 0.33
66 0.27
67 0.26
68 0.23
69 0.2
70 0.2
71 0.21
72 0.18
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.1
85 0.12
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.22
99 0.2
100 0.17
101 0.17
102 0.14
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.07
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.16
139 0.19
140 0.23
141 0.32
142 0.39
143 0.47
144 0.52
145 0.57
146 0.58
147 0.61
148 0.61
149 0.57
150 0.52
151 0.46
152 0.46
153 0.39
154 0.38
155 0.33
156 0.3
157 0.27
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.23
162 0.22
163 0.2
164 0.19
165 0.16
166 0.14
167 0.11
168 0.09
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.18
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.16
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.13
198 0.14
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.09
210 0.08
211 0.1
212 0.15
213 0.17
214 0.22
215 0.28
216 0.33
217 0.36
218 0.45
219 0.5
220 0.55
221 0.59
222 0.58
223 0.52
224 0.48
225 0.44