FuNGI

A0A175VWL9

Protein Details

Accession

A0A175VWL9

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-42	ATIPSSQRSEKKHKRAKSEHKKRAREEEDDR	Basic
45-66	IEETPRKSKKTKSERTDDYSQS	Hydrophilic
74-98	TATVESSKKRTKKHTDYKVDDEKHD	Hydrophilic
105-129	PVGNGSRKGHKKSSKDKRDPGQTTV	Hydrophilic
142-170	VESPSHGPDRKRKEKKSKKQRLQEGEQAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
20-36	SEKKHKRAKSEHKKRAR
111-121	RKGHKKSSKDK
149-162	PDRKRKEKKSKKQR
184-191	KRKSKDKA

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 14.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSAPSAEGSQTATIPSSQRSEKKHKRAKSEHKKRAREEEDDRVVIEETPRKSKKTKSERTDDYSQSVHQSQSHTATVESSKKRTKKHTDYKVDDEKHDPAQALSPVGNGSRKGHKKSSKDKRDPGQTTVDAMEIDAVEGPGVESPSHGPDRKRKEKKSKKQRLQEGEQAAEGSPVANAAEVEGKRKSKDKAKGSSSAEAAPISEEKPTRELTTELAADSDFPFFTQSISLYVPFFPVGFDKPLTNVASQHLDPLLNHYSPLLRGVLLSYSNLNLSDRPAKASIRHPPTDQTPALLHSIDEYAVGFGWLTFDAHVFVPSRGKWMEGVLQLQSEGHIGVVCWNKFNASIEAKRLPSGWRWVDLAKGGAKMNISPPPSQDEKGQQDQESEDMLDGEELQVVEQIHTTGYWVNEHGRKVSGKLRFRIKNFDVGLAGEYGYLSIEGTCLDDDDERALAARDRELEQARRAKQNPSGLLRPFSRRVPEFSMTRFGREDEEEDGRQRTVLYKGSRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.19
3	0.23
4	0.29
5	0.35
6	0.43
7	0.53
8	0.62
9	0.71
10	0.78
11	0.8
12	0.83
13	0.88
14	0.91
15	0.91
16	0.92
17	0.91
18	0.92
19	0.94
20	0.91
21	0.91
22	0.86
23	0.84
24	0.8
25	0.79
26	0.76
27	0.67
28	0.59
29	0.5
30	0.44
31	0.36
32	0.33
33	0.3
34	0.26
35	0.35
36	0.38
37	0.41
38	0.46
39	0.54
40	0.6
41	0.64
42	0.71
43	0.71
44	0.77
45	0.81
46	0.83
47	0.83
48	0.76
49	0.69
50	0.6
51	0.52
52	0.47
53	0.41
54	0.35
55	0.3
56	0.29
57	0.29
58	0.31
59	0.31
60	0.26
61	0.24
62	0.25
63	0.27
64	0.33
65	0.34
66	0.37
67	0.44
68	0.49
69	0.57
70	0.64
71	0.7
72	0.72
73	0.78
74	0.82
75	0.84
76	0.86
77	0.88
78	0.88
79	0.81
80	0.73
81	0.66
82	0.59
83	0.51
84	0.46
85	0.36
86	0.27
87	0.27
88	0.25
89	0.22
90	0.18
91	0.15
92	0.14
93	0.16
94	0.18
95	0.15
96	0.18
97	0.27
98	0.34
99	0.4
100	0.48
101	0.55
102	0.62
103	0.71
104	0.79
105	0.8
106	0.83
107	0.86
108	0.85
109	0.88
110	0.82
111	0.76
112	0.72
113	0.61
114	0.53
115	0.45
116	0.37
117	0.26
118	0.21
119	0.17
120	0.09
121	0.09
122	0.06
123	0.05
124	0.04
125	0.04
126	0.05
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.06
131	0.07
132	0.12
133	0.17
134	0.2
135	0.24
136	0.32
137	0.43
138	0.54
139	0.63
140	0.69
141	0.76
142	0.84
143	0.91
144	0.93
145	0.94
146	0.93
147	0.93
148	0.93
149	0.9
150	0.86
151	0.83
152	0.77
153	0.66
154	0.56
155	0.47
156	0.37
157	0.28
158	0.2
159	0.12
160	0.06
161	0.05
162	0.05
163	0.04
164	0.03
165	0.04
166	0.09
167	0.09
168	0.13
169	0.16
170	0.18
171	0.2
172	0.24
173	0.29
174	0.33
175	0.42
176	0.48
177	0.54
178	0.57
179	0.64
180	0.63
181	0.62
182	0.55
183	0.47
184	0.38
185	0.29
186	0.24
187	0.17
188	0.13
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.15
195	0.15
196	0.15
197	0.16
198	0.14
199	0.16
200	0.16
201	0.13
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.06
208	0.06
209	0.07
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.08
225	0.09
226	0.1
227	0.09
228	0.1
229	0.14
230	0.15
231	0.14
232	0.13
233	0.13
234	0.16
235	0.15
236	0.15
237	0.12
238	0.11
239	0.11
240	0.14
241	0.16
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.13
248	0.09
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.09
262	0.14
263	0.13
264	0.15
265	0.17
266	0.18
267	0.21
268	0.27
269	0.33
270	0.34
271	0.36
272	0.35
273	0.36
274	0.38
275	0.41
276	0.35
277	0.28
278	0.22
279	0.22
280	0.22
281	0.19
282	0.15
283	0.1
284	0.1
285	0.08
286	0.08
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.03
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.06
299	0.06
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.12
304	0.12
305	0.15
306	0.14
307	0.15
308	0.14
309	0.14
310	0.18
311	0.17
312	0.18
313	0.15
314	0.15
315	0.14
316	0.14
317	0.13
318	0.08
319	0.06
320	0.05
321	0.04
322	0.04
323	0.09
324	0.15
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.16
329	0.17
330	0.19
331	0.19
332	0.2
333	0.22
334	0.26
335	0.31
336	0.31
337	0.31
338	0.29
339	0.27
340	0.25
341	0.31
342	0.28
343	0.25
344	0.27
345	0.26
346	0.27
347	0.26
348	0.25
349	0.19
350	0.19
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.16
355	0.19
356	0.21
357	0.22
358	0.2
359	0.21
360	0.25
361	0.29
362	0.29
363	0.29
364	0.32
365	0.37
366	0.43
367	0.45
368	0.4
369	0.38
370	0.38
371	0.35
372	0.28
373	0.22
374	0.14
375	0.11
376	0.1
377	0.08
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.1
394	0.11
395	0.17
396	0.21
397	0.23
398	0.24
399	0.25
400	0.26
401	0.28
402	0.34
403	0.37
404	0.41
405	0.46
406	0.55
407	0.59
408	0.61
409	0.67
410	0.63
411	0.63
412	0.56
413	0.52
414	0.43
415	0.36
416	0.34
417	0.24
418	0.21
419	0.12
420	0.1
421	0.08
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.08
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.12
440	0.13
441	0.15
442	0.16
443	0.18
444	0.25
445	0.3
446	0.34
447	0.39
448	0.47
449	0.5
450	0.57
451	0.57
452	0.57
453	0.59
454	0.63
455	0.63
456	0.61
457	0.63
458	0.57
459	0.61
460	0.59
461	0.59
462	0.55
463	0.52
464	0.54
465	0.49
466	0.52
467	0.53
468	0.54
469	0.52
470	0.51
471	0.56
472	0.48
473	0.49
474	0.44
475	0.38
476	0.36
477	0.35
478	0.33
479	0.29
480	0.34
481	0.33
482	0.34
483	0.36
484	0.31
485	0.29
486	0.27
487	0.25
488	0.24
489	0.29
490	0.31
491	0.36
492	0.43
493	0.47
494	0.49

A0A175VWL9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer