FuNGI

A0A175W400

Protein Details

Accession

A0A175W400

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-60	GSSREYQSSRRDRDDRRDRGDTRDRGGGRRRSRSPDYRSGRSRRED	Basic
134-155	ERDRERRRSVSPPPKKREPTPD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-57	DRRDRGDTRDRGGGRRRSRSPDYRSGRSR
82-150	SGRDRRGGDRGDREWERDRGGRSRRDDDDRRDRRSDRDLIDDRRGGRRDRDFERDRERRRSVSPPPKKR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk IPR006529 U2AF_lg
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12231 RRM2_U2AF65 cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MNGDNYSSRDSGRHGSSREYQSSRRDRDDRRDRGDTRDRGGGRRRSRSPDYRSGRSRREDGDIDAYSSSRSHRDREREDRYSGRDRRGGDRGDREWERDRGGRSRRDDDDRRDRRSDRDLIDDRRGGRRDRDFERDRERRRSVSPPPKKREPTPDLTDVVPILERRRRLTQWDIKPPGYDNVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQAMDPTKLQAFMNQPGGAVNSAALKPTNSRQSKRLIVSNLPASATEEGLVNFFNLQLNGLNVIENPDPCLLCQIAPDRTFSMLEFRSSADATVALAFDGVMMEADDSNDANGNVEDPNYDPDSDVPSSVVVDSPNKISVTNIPTYLTDDQVMELLVSFGKLKSFVLVKDNGTQESRGIAFLEYADSTVTNVAIQGLHNMMLGEKALNVQKASIGITQVAGEMGVNAMSMLAGTTSTDSGVSRVLQLLNMVTPDELMDNDDYEEIRDDVQEECEKSGKILSIKIPRPVGGSRQSAGVGKIYVKFETPEMATKALRALAGRKFADRTVVTTYFPEENFDVNAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.42
3	0.5
4	0.56
5	0.6
6	0.59
7	0.58
8	0.62
9	0.7
10	0.71
11	0.71
12	0.72
13	0.73
14	0.78
15	0.83
16	0.82
17	0.8
18	0.83
19	0.76
20	0.77
21	0.79
22	0.73
23	0.67
24	0.66
25	0.6
26	0.59
27	0.66
28	0.66
29	0.65
30	0.69
31	0.72
32	0.71
33	0.78
34	0.8
35	0.79
36	0.8
37	0.78
38	0.78
39	0.81
40	0.81
41	0.81
42	0.78
43	0.75
44	0.68
45	0.67
46	0.59
47	0.54
48	0.53
49	0.45
50	0.4
51	0.34
52	0.31
53	0.25
54	0.23
55	0.2
56	0.2
57	0.22
58	0.26
59	0.35
60	0.45
61	0.53
62	0.63
63	0.7
64	0.68
65	0.72
66	0.72
67	0.7
68	0.71
69	0.68
70	0.65
71	0.6
72	0.57
73	0.58
74	0.59
75	0.58
76	0.55
77	0.57
78	0.52
79	0.57
80	0.55
81	0.54
82	0.53
83	0.5
84	0.47
85	0.44
86	0.45
87	0.46
88	0.52
89	0.55
90	0.55
91	0.59
92	0.61
93	0.66
94	0.69
95	0.7
96	0.73
97	0.73
98	0.73
99	0.73
100	0.7
101	0.66
102	0.66
103	0.64
104	0.55
105	0.57
106	0.58
107	0.56
108	0.61
109	0.58
110	0.53
111	0.53
112	0.54
113	0.47
114	0.47
115	0.5
116	0.5
117	0.52
118	0.59
119	0.56
120	0.61
121	0.68
122	0.7
123	0.69
124	0.72
125	0.72
126	0.66
127	0.66
128	0.66
129	0.66
130	0.68
131	0.71
132	0.72
133	0.75
134	0.81
135	0.82
136	0.8
137	0.8
138	0.76
139	0.74
140	0.7
141	0.66
142	0.58
143	0.52
144	0.46
145	0.35
146	0.28
147	0.21
148	0.16
149	0.16
150	0.18
151	0.2
152	0.23
153	0.3
154	0.31
155	0.36
156	0.45
157	0.5
158	0.55
159	0.64
160	0.65
161	0.6
162	0.59
163	0.54
164	0.48
165	0.41
166	0.32
167	0.23
168	0.2
169	0.24
170	0.23
171	0.21
172	0.17
173	0.14
174	0.13
175	0.12
176	0.1
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.11
182	0.12
183	0.13
184	0.15
185	0.14
186	0.15
187	0.16
188	0.18
189	0.21
190	0.24
191	0.26
192	0.25
193	0.26
194	0.26
195	0.27
196	0.25
197	0.22
198	0.22
199	0.2
200	0.23
201	0.21
202	0.2
203	0.19
204	0.2
205	0.15
206	0.12
207	0.09
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.09
214	0.13
215	0.23
216	0.26
217	0.29
218	0.32
219	0.38
220	0.44
221	0.45
222	0.46
223	0.4
224	0.37
225	0.38
226	0.37
227	0.31
228	0.25
229	0.22
230	0.19
231	0.16
232	0.13
233	0.1
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.11
258	0.08
259	0.08
260	0.1
261	0.11
262	0.15
263	0.15
264	0.17
265	0.16
266	0.17
267	0.17
268	0.15
269	0.17
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.13
275	0.12
276	0.12
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.02
289	0.02
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.06
305	0.09
306	0.09
307	0.1
308	0.09
309	0.1
310	0.14
311	0.14
312	0.13
313	0.11
314	0.1
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.12
326	0.16
327	0.19
328	0.2
329	0.19
330	0.18
331	0.18
332	0.22
333	0.22
334	0.18
335	0.14
336	0.13
337	0.12
338	0.11
339	0.11
340	0.07
341	0.06
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.08
351	0.1
352	0.11
353	0.15
354	0.18
355	0.19
356	0.25
357	0.26
358	0.26
359	0.25
360	0.24
361	0.2
362	0.19
363	0.18
364	0.13
365	0.12
366	0.1
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.08
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.06
391	0.05
392	0.08
393	0.1
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.12
398	0.13
399	0.15
400	0.13
401	0.12
402	0.11
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.09
407	0.07
408	0.05
409	0.05
410	0.04
411	0.04
412	0.03
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.12
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.1
455	0.11
456	0.15
457	0.19
458	0.18
459	0.2
460	0.22
461	0.22
462	0.22
463	0.23
464	0.23
465	0.21
466	0.25
467	0.31
468	0.38
469	0.42
470	0.48
471	0.48
472	0.44
473	0.47
474	0.45
475	0.45
476	0.43
477	0.43
478	0.37
479	0.37
480	0.37
481	0.35
482	0.33
483	0.28
484	0.22
485	0.2
486	0.24
487	0.24
488	0.23
489	0.23
490	0.23
491	0.21
492	0.23
493	0.23
494	0.25
495	0.25
496	0.28
497	0.27
498	0.26
499	0.27
500	0.25
501	0.24
502	0.2
503	0.23
504	0.26
505	0.34
506	0.35
507	0.36
508	0.37
509	0.36
510	0.42
511	0.37
512	0.35
513	0.35
514	0.35
515	0.33
516	0.32
517	0.35
518	0.31
519	0.3
520	0.31
521	0.24
522	0.24

A0A175W400

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer