Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175VPJ2

Protein Details
Accession A0A175VPJ2    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-365EEQQSRKRKRGSDRPNPKEKPTBasic
618-641AEVMRSFRSRVRPRRTPKQEEDAEHydrophilic
753-774FGVPTRSKMRWDKRHSKYVARAHydrophilic
798-818FQSGRFDKWRRANRLGRLPQVHydrophilic
837-856GGPRYKHKMEKAPKDADKYRBasic
888-916KNASDIRKARQLKEKKREKNARPSKKAKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
349-362RKRKRGSDRPNPKE
838-916GPRYKHKMEKAPKDADKYRDDYHIRKKRVAEAKEKRVGKYKDGEGSRRELKNASDIRKARQLKEKKREKNARPSKKAKR
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 12.333, nucl 10.5, cyto_mito 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012541  DBP10_C  
IPR033517  DDX54/DBP10_DEAD-box_helicase  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08147  DBP10CT  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17959  DEADc_DDX54  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MLRRAPSPALSENEVDIAGSLFANEADSDIEVNTKKPGDGAFDLDFDSLLNTTGDGDSDGDGGDEAFIALQQRSSNRKASNLQGKSVKKGGGFQAMGLNANLLRAITRKGFSVPTPIQRKAIPLILEKRDVVGMARTGSGKTAAFVIPMIERLKAHSARVGARGLILSPSRELALQTLKVVKELGKGTDLKTVLLVGGDSLEEQFGLMAANPDIVIATPGRFLHLKVEMSLDLSSIKYVVFDEADRLFEMGFATQLTEILHALPPSRQTLLFSATLPSSLVEFARAGLQEPSLVRLDAETKVSPDLESAFFSVKGGEKEGALLHILRDVIKMPLGPPEGAQREEEQQSRKRKRGSDRPNPKEKPTEHSTIIFTATKHHVEYLATLLRHAGYAVSHVYGSLDQTARKIQVDSFRRGRTNILVVTDVAARGIDIPVLANVVNYDFPPQPKVFVHRVGRTARAGQRGWAYALVRESDLPYLLDLQLFLGRKLVLGQEVKEPSYAQDVVVGSLVRSELENNTEWVNKVLHEDDDISALKRVTVKAEKLYMKTRNSASSQSAKRAREVIVSKGWTQVHALFGESAADAEEARDSLLSKISGFKPQETIFEIGPKGKSSQNKAAEVMRSFRSRVRPRRTPKQEEDAEMVDADDLPAHANGGNIESSEEAQDDGDGEEAWEDAEDSDSELEVTITSSAKSKKGQTSFEDPEIFMSYTPRTTSVAEERAYGVHSGAQSSHFVEAARDATMDLANDEGAKAFGVPTRSKMRWDKRHSKYVARANDDDGSRGAKMIRGESGVKIAASFQSGRFDKWRRANRLGRLPQVGEAEKANLVRNFGSHGGGGGPRYKHKMEKAPKDADKYRDDYHIRKKRVAEAKEKRVGKYKDGEGSRRELKNASDIRKARQLKEKKREKNARPSKKAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.22
3 0.16
4 0.12
5 0.09
6 0.08
7 0.07
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.08
17 0.12
18 0.12
19 0.14
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.19
24 0.2
25 0.22
26 0.24
27 0.29
28 0.26
29 0.26
30 0.27
31 0.25
32 0.24
33 0.17
34 0.15
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.07
56 0.07
57 0.09
58 0.12
59 0.18
60 0.24
61 0.29
62 0.36
63 0.37
64 0.44
65 0.48
66 0.55
67 0.6
68 0.56
69 0.59
70 0.6
71 0.61
72 0.6
73 0.6
74 0.53
75 0.44
76 0.46
77 0.44
78 0.44
79 0.4
80 0.36
81 0.36
82 0.33
83 0.33
84 0.28
85 0.23
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.12
93 0.15
94 0.16
95 0.18
96 0.2
97 0.23
98 0.24
99 0.32
100 0.34
101 0.4
102 0.46
103 0.47
104 0.47
105 0.46
106 0.48
107 0.42
108 0.42
109 0.36
110 0.36
111 0.42
112 0.43
113 0.45
114 0.41
115 0.38
116 0.34
117 0.3
118 0.24
119 0.19
120 0.16
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.14
128 0.12
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.14
136 0.15
137 0.13
138 0.13
139 0.17
140 0.24
141 0.25
142 0.25
143 0.25
144 0.28
145 0.3
146 0.34
147 0.32
148 0.24
149 0.23
150 0.22
151 0.19
152 0.19
153 0.16
154 0.14
155 0.13
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.22
165 0.22
166 0.22
167 0.23
168 0.21
169 0.21
170 0.22
171 0.22
172 0.21
173 0.23
174 0.23
175 0.29
176 0.28
177 0.22
178 0.21
179 0.19
180 0.15
181 0.13
182 0.12
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.15
211 0.19
212 0.2
213 0.18
214 0.21
215 0.19
216 0.2
217 0.2
218 0.15
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.07
238 0.07
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.09
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.13
253 0.15
254 0.14
255 0.15
256 0.16
257 0.19
258 0.19
259 0.17
260 0.17
261 0.15
262 0.15
263 0.13
264 0.11
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.14
290 0.13
291 0.11
292 0.12
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.07
320 0.12
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.19
325 0.21
326 0.22
327 0.22
328 0.19
329 0.21
330 0.25
331 0.28
332 0.27
333 0.32
334 0.42
335 0.48
336 0.53
337 0.55
338 0.6
339 0.66
340 0.71
341 0.75
342 0.75
343 0.79
344 0.82
345 0.87
346 0.83
347 0.77
348 0.75
349 0.66
350 0.62
351 0.56
352 0.52
353 0.43
354 0.42
355 0.39
356 0.31
357 0.32
358 0.26
359 0.2
360 0.19
361 0.2
362 0.19
363 0.18
364 0.17
365 0.15
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.08
377 0.04
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.2
396 0.25
397 0.3
398 0.35
399 0.37
400 0.38
401 0.38
402 0.38
403 0.32
404 0.31
405 0.26
406 0.2
407 0.18
408 0.16
409 0.16
410 0.15
411 0.12
412 0.08
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.12
432 0.12
433 0.14
434 0.15
435 0.2
436 0.21
437 0.27
438 0.31
439 0.31
440 0.36
441 0.36
442 0.37
443 0.34
444 0.36
445 0.32
446 0.32
447 0.3
448 0.27
449 0.27
450 0.25
451 0.24
452 0.21
453 0.17
454 0.13
455 0.14
456 0.12
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.11
480 0.15
481 0.17
482 0.17
483 0.17
484 0.16
485 0.13
486 0.16
487 0.15
488 0.1
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.11
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.1
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.1
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.12
524 0.14
525 0.18
526 0.2
527 0.21
528 0.28
529 0.3
530 0.31
531 0.38
532 0.4
533 0.38
534 0.41
535 0.4
536 0.37
537 0.37
538 0.37
539 0.34
540 0.36
541 0.36
542 0.4
543 0.45
544 0.42
545 0.41
546 0.4
547 0.37
548 0.35
549 0.35
550 0.31
551 0.29
552 0.31
553 0.29
554 0.32
555 0.31
556 0.24
557 0.24
558 0.21
559 0.18
560 0.16
561 0.15
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.08
566 0.07
567 0.05
568 0.05
569 0.04
570 0.05
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.05
575 0.05
576 0.06
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.13
581 0.14
582 0.21
583 0.22
584 0.23
585 0.25
586 0.26
587 0.28
588 0.26
589 0.27
590 0.2
591 0.22
592 0.22
593 0.2
594 0.2
595 0.19
596 0.18
597 0.2
598 0.25
599 0.28
600 0.37
601 0.4
602 0.42
603 0.43
604 0.44
605 0.44
606 0.4
607 0.37
608 0.32
609 0.28
610 0.27
611 0.3
612 0.36
613 0.42
614 0.51
615 0.57
616 0.63
617 0.7
618 0.8
619 0.86
620 0.85
621 0.82
622 0.82
623 0.76
624 0.7
625 0.65
626 0.55
627 0.45
628 0.35
629 0.28
630 0.18
631 0.14
632 0.1
633 0.06
634 0.04
635 0.05
636 0.04
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.07
642 0.07
643 0.06
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.11
677 0.13
678 0.17
679 0.21
680 0.27
681 0.34
682 0.39
683 0.45
684 0.46
685 0.53
686 0.54
687 0.56
688 0.51
689 0.43
690 0.39
691 0.37
692 0.31
693 0.22
694 0.2
695 0.16
696 0.15
697 0.16
698 0.16
699 0.15
700 0.15
701 0.2
702 0.25
703 0.28
704 0.27
705 0.28
706 0.27
707 0.26
708 0.26
709 0.21
710 0.14
711 0.12
712 0.12
713 0.11
714 0.11
715 0.12
716 0.12
717 0.13
718 0.14
719 0.12
720 0.12
721 0.11
722 0.13
723 0.12
724 0.11
725 0.1
726 0.09
727 0.1
728 0.1
729 0.1
730 0.08
731 0.07
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.05
737 0.05
738 0.05
739 0.06
740 0.08
741 0.13
742 0.14
743 0.19
744 0.27
745 0.28
746 0.36
747 0.46
748 0.54
749 0.6
750 0.7
751 0.75
752 0.75
753 0.85
754 0.82
755 0.81
756 0.8
757 0.79
758 0.77
759 0.73
760 0.67
761 0.6
762 0.61
763 0.52
764 0.44
765 0.35
766 0.29
767 0.22
768 0.21
769 0.18
770 0.15
771 0.16
772 0.17
773 0.18
774 0.19
775 0.21
776 0.21
777 0.23
778 0.21
779 0.19
780 0.17
781 0.16
782 0.14
783 0.15
784 0.15
785 0.14
786 0.22
787 0.23
788 0.26
789 0.33
790 0.38
791 0.44
792 0.53
793 0.61
794 0.61
795 0.7
796 0.76
797 0.77
798 0.83
799 0.82
800 0.79
801 0.74
802 0.67
803 0.61
804 0.58
805 0.5
806 0.4
807 0.33
808 0.28
809 0.25
810 0.25
811 0.26
812 0.22
813 0.23
814 0.21
815 0.21
816 0.23
817 0.22
818 0.22
819 0.16
820 0.16
821 0.16
822 0.17
823 0.18
824 0.2
825 0.22
826 0.25
827 0.32
828 0.35
829 0.4
830 0.46
831 0.55
832 0.6
833 0.68
834 0.72
835 0.76
836 0.79
837 0.81
838 0.8
839 0.76
840 0.72
841 0.67
842 0.61
843 0.6
844 0.59
845 0.6
846 0.64
847 0.67
848 0.66
849 0.66
850 0.68
851 0.69
852 0.72
853 0.71
854 0.72
855 0.72
856 0.77
857 0.8
858 0.79
859 0.74
860 0.74
861 0.7
862 0.67
863 0.65
864 0.61
865 0.61
866 0.64
867 0.66
868 0.6
869 0.64
870 0.65
871 0.59
872 0.55
873 0.49
874 0.44
875 0.48
876 0.52
877 0.5
878 0.51
879 0.51
880 0.55
881 0.62
882 0.66
883 0.63
884 0.65
885 0.7
886 0.71
887 0.79
888 0.84
889 0.84
890 0.89
891 0.93
892 0.92
893 0.93
894 0.93
895 0.93
896 0.93