FuNGI

A0A175VZQ0

Protein Details

Accession

A0A175VZQ0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-41	SRPGRVPRPSTRPTSRRRIG	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 16, cyto 3.5, cyto_nucl 3.5, nucl 2.5, extr 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019313 Mediator_Med17
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10156 Med17

Amino Acid Sequences

MVLAKAGPRSXNDVSVXLFGRVNSRPGRVPRPSTRPTSRRRIGAQHNDPGGGEDDDVDMAGAASEADSDVAETKDVVAARDDILRAIHMTHQTSMFALDFISLLLSKENPAQAVTTFSHGLREMVGVGTLGATMLQTPTPLTLSRVPDNKMVAIGKRLVDLNKAADTALAASKRLQQEIGSETKYWSEVLGVSQDGWRTFRLPHEPHTMGVKFGFSNTAPEFKANGIAPMRRAEDGSVRLEHGRMGGGSKRIQVTILENCRVVGRSSLPPPLAADAPLQDRVKESRDTIFAQELWHEINREGRTVLSRHVRLDKSAVSCALDSTRTISFRLATLGEADDAGPEPAGPQDAIAEALYVTLCLLLSAAHRMNEQRRSEPSANRGPPPAYSLLTPIVSYYEYDKNIQHFVRFITAFANVLRSAGLPASITMKEPPLTAPPGIPASPALAAILLRPPTTQFDLTITPESRLRILLKPSQLYGAQFAVHCLPPPQPGSQNPLASLCSPAGDEFDRIKELCWYLCRAVPRALTAHYHRAVSEPAVNGQGLVAPSSWAIHTSNAGLVDYRTREHKIHFDFSPSPDAGDRPALRVKADFLEAGKKVHREWAWHGHQGEANLDEIVRHVLSTVGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.3
3	0.27
4	0.24
5	0.26
6	0.23
7	0.29
8	0.27
9	0.31
10	0.35
11	0.42
12	0.5
13	0.54
14	0.62
15	0.65
16	0.71
17	0.74
18	0.76
19	0.79
20	0.79
21	0.79
22	0.81
23	0.78
24	0.77
25	0.77
26	0.78
27	0.78
28	0.79
29	0.79
30	0.77
31	0.72
32	0.64
33	0.57
34	0.49
35	0.41
36	0.31
37	0.22
38	0.14
39	0.13
40	0.12
41	0.12
42	0.09
43	0.06
44	0.05
45	0.05
46	0.04
47	0.03
48	0.03
49	0.03
50	0.04
51	0.04
52	0.04
53	0.05
54	0.06
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.08
59	0.1
60	0.11
61	0.11
62	0.11
63	0.12
64	0.13
65	0.16
66	0.16
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.13
71	0.13
72	0.16
73	0.18
74	0.2
75	0.21
76	0.22
77	0.21
78	0.21
79	0.21
80	0.17
81	0.12
82	0.1
83	0.08
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.06
89	0.07
90	0.08
91	0.09
92	0.12
93	0.13
94	0.13
95	0.13
96	0.14
97	0.13
98	0.17
99	0.17
100	0.17
101	0.18
102	0.17
103	0.19
104	0.18
105	0.18
106	0.14
107	0.14
108	0.11
109	0.09
110	0.09
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.05
115	0.04
116	0.03
117	0.03
118	0.03
119	0.04
120	0.04
121	0.05
122	0.05
123	0.06
124	0.08
125	0.09
126	0.12
127	0.17
128	0.22
129	0.28
130	0.33
131	0.34
132	0.36
133	0.38
134	0.34
135	0.32
136	0.29
137	0.25
138	0.24
139	0.24
140	0.21
141	0.21
142	0.22
143	0.2
144	0.2
145	0.21
146	0.2
147	0.18
148	0.18
149	0.16
150	0.14
151	0.13
152	0.12
153	0.14
154	0.11
155	0.11
156	0.12
157	0.18
158	0.2
159	0.2
160	0.19
161	0.16
162	0.19
163	0.23
164	0.26
165	0.22
166	0.21
167	0.21
168	0.21
169	0.21
170	0.18
171	0.13
172	0.1
173	0.08
174	0.09
175	0.1
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.12
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.12
184	0.13
185	0.18
186	0.26
187	0.27
188	0.32
189	0.39
190	0.39
191	0.38
192	0.44
193	0.39
194	0.31
195	0.28
196	0.24
197	0.16
198	0.15
199	0.16
200	0.1
201	0.14
202	0.14
203	0.17
204	0.17
205	0.17
206	0.18
207	0.16
208	0.2
209	0.15
210	0.18
211	0.17
212	0.18
213	0.19
214	0.21
215	0.22
216	0.19
217	0.19
218	0.16
219	0.18
220	0.2
221	0.21
222	0.19
223	0.18
224	0.18
225	0.18
226	0.17
227	0.13
228	0.11
229	0.08
230	0.09
231	0.11
232	0.13
233	0.15
234	0.17
235	0.18
236	0.17
237	0.18
238	0.17
239	0.18
240	0.22
241	0.25
242	0.24
243	0.23
244	0.23
245	0.23
246	0.23
247	0.19
248	0.13
249	0.12
250	0.15
251	0.18
252	0.21
253	0.2
254	0.2
255	0.2
256	0.2
257	0.17
258	0.13
259	0.11
260	0.1
261	0.11
262	0.16
263	0.16
264	0.14
265	0.15
266	0.16
267	0.19
268	0.19
269	0.18
270	0.16
271	0.19
272	0.21
273	0.21
274	0.2
275	0.18
276	0.16
277	0.15
278	0.13
279	0.12
280	0.11
281	0.1
282	0.09
283	0.14
284	0.15
285	0.15
286	0.14
287	0.13
288	0.15
289	0.15
290	0.19
291	0.2
292	0.21
293	0.22
294	0.28
295	0.28
296	0.27
297	0.28
298	0.28
299	0.23
300	0.23
301	0.21
302	0.16
303	0.15
304	0.15
305	0.13
306	0.1
307	0.08
308	0.09
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.1
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.04
349	0.07
350	0.08
351	0.09
352	0.1
353	0.14
354	0.19
355	0.27
356	0.29
357	0.29
358	0.31
359	0.39
360	0.43
361	0.44
362	0.45
363	0.47
364	0.47
365	0.45
366	0.45
367	0.37
368	0.33
369	0.32
370	0.28
371	0.19
372	0.17
373	0.17
374	0.16
375	0.16
376	0.15
377	0.12
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.12
382	0.14
383	0.15
384	0.18
385	0.19
386	0.2
387	0.25
388	0.25
389	0.22
390	0.19
391	0.19
392	0.22
393	0.2
394	0.18
395	0.14
396	0.14
397	0.14
398	0.13
399	0.14
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.08
407	0.05
408	0.06
409	0.09
410	0.09
411	0.1
412	0.1
413	0.12
414	0.12
415	0.13
416	0.14
417	0.14
418	0.17
419	0.16
420	0.15
421	0.16
422	0.18
423	0.17
424	0.16
425	0.13
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.1
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.11
438	0.15
439	0.19
440	0.19
441	0.16
442	0.18
443	0.2
444	0.23
445	0.27
446	0.24
447	0.22
448	0.23
449	0.24
450	0.21
451	0.22
452	0.22
453	0.21
454	0.26
455	0.3
456	0.34
457	0.34
458	0.34
459	0.35
460	0.33
461	0.29
462	0.26
463	0.21
464	0.17
465	0.15
466	0.16
467	0.16
468	0.15
469	0.15
470	0.14
471	0.15
472	0.18
473	0.2
474	0.22
475	0.24
476	0.27
477	0.34
478	0.39
479	0.38
480	0.35
481	0.34
482	0.33
483	0.28
484	0.27
485	0.19
486	0.14
487	0.13
488	0.12
489	0.13
490	0.13
491	0.15
492	0.15
493	0.17
494	0.19
495	0.18
496	0.19
497	0.2
498	0.21
499	0.22
500	0.22
501	0.25
502	0.25
503	0.28
504	0.31
505	0.3
506	0.33
507	0.32
508	0.32
509	0.3
510	0.3
511	0.33
512	0.34
513	0.4
514	0.36
515	0.35
516	0.33
517	0.32
518	0.32
519	0.29
520	0.28
521	0.21
522	0.21
523	0.22
524	0.21
525	0.19
526	0.17
527	0.16
528	0.12
529	0.11
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.1
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.1
538	0.12
539	0.12
540	0.14
541	0.14
542	0.14
543	0.13
544	0.13
545	0.18
546	0.18
547	0.19
548	0.21
549	0.25
550	0.27
551	0.31
552	0.4
553	0.41
554	0.45
555	0.44
556	0.47
557	0.47
558	0.48
559	0.5
560	0.41
561	0.36
562	0.32
563	0.31
564	0.27
565	0.31
566	0.28
567	0.26
568	0.32
569	0.31
570	0.31
571	0.32
572	0.32
573	0.27
574	0.28
575	0.25
576	0.22
577	0.29
578	0.28
579	0.31
580	0.32
581	0.31
582	0.3
583	0.37
584	0.37
585	0.36
586	0.42
587	0.49
588	0.51
589	0.56
590	0.56
591	0.52
592	0.51
593	0.47
594	0.42
595	0.33
596	0.27
597	0.19
598	0.19
599	0.14
600	0.13
601	0.14
602	0.11
603	0.1
604	0.09

A0A175VZQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer