Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175VQB7

Protein Details
Accession A0A175VQB7    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MEPPKFKHKKIPRGPPTPPPPVMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-16KFKHKKIPRGPP
126-145AEKAGGGRRRSRTGSRSRSR
165-184RREARRERLREEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MEPPKFKHKKIPRGPPTPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWRIPPAVSLWKNSKGYTVPLDKRLAADGRSLQDVQINDKFAQFSEALFMADRHAREEVRQRAMMQQRLAEKERQQKEEHLRQLAQQARAEKAGGGRRRSRTGSRSRSRSRSYSDSESGSETDDSERERREARRERLREEERKLRQSRMGAERRAQVLAREMDRDISEKIALGLAKPTQSAEGMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDNPYDKPLFAAQDAISSIYRPRANVEDDDEAAGDQEMARIQKGSRFGEALGRGTFKGTEEAEAREGPVQFEKDTADPFNVDKFLSEVQQGTSSSKRGYGLHEEDSRQSKRSRVDDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.85
4 0.83
5 0.77
6 0.69
7 0.66
8 0.64
9 0.65
10 0.65
11 0.66
12 0.65
13 0.67
14 0.69
15 0.64
16 0.6
17 0.6
18 0.59
19 0.57
20 0.53
21 0.5
22 0.51
23 0.5
24 0.48
25 0.42
26 0.33
27 0.25
28 0.24
29 0.23
30 0.26
31 0.27
32 0.32
33 0.36
34 0.42
35 0.45
36 0.42
37 0.44
38 0.36
39 0.38
40 0.4
41 0.44
42 0.41
43 0.45
44 0.47
45 0.44
46 0.43
47 0.43
48 0.38
49 0.29
50 0.29
51 0.27
52 0.26
53 0.29
54 0.28
55 0.24
56 0.24
57 0.24
58 0.25
59 0.24
60 0.25
61 0.22
62 0.23
63 0.24
64 0.2
65 0.22
66 0.17
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.15
79 0.19
80 0.29
81 0.33
82 0.36
83 0.37
84 0.36
85 0.42
86 0.49
87 0.5
88 0.42
89 0.39
90 0.38
91 0.42
92 0.44
93 0.41
94 0.41
95 0.46
96 0.51
97 0.51
98 0.48
99 0.51
100 0.58
101 0.62
102 0.61
103 0.56
104 0.5
105 0.48
106 0.54
107 0.51
108 0.45
109 0.39
110 0.35
111 0.31
112 0.31
113 0.29
114 0.22
115 0.22
116 0.25
117 0.28
118 0.32
119 0.37
120 0.4
121 0.45
122 0.49
123 0.5
124 0.51
125 0.56
126 0.61
127 0.63
128 0.68
129 0.71
130 0.75
131 0.74
132 0.7
133 0.65
134 0.61
135 0.58
136 0.54
137 0.49
138 0.43
139 0.39
140 0.35
141 0.3
142 0.24
143 0.19
144 0.13
145 0.11
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.17
152 0.2
153 0.29
154 0.38
155 0.44
156 0.52
157 0.55
158 0.58
159 0.63
160 0.69
161 0.66
162 0.63
163 0.64
164 0.6
165 0.66
166 0.64
167 0.57
168 0.52
169 0.47
170 0.48
171 0.48
172 0.49
173 0.42
174 0.43
175 0.44
176 0.42
177 0.4
178 0.33
179 0.24
180 0.22
181 0.22
182 0.2
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.13
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.14
209 0.13
210 0.15
211 0.16
212 0.15
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.16
218 0.15
219 0.13
220 0.14
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.17
229 0.15
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.16
234 0.15
235 0.16
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.12
243 0.16
244 0.17
245 0.15
246 0.18
247 0.2
248 0.23
249 0.24
250 0.28
251 0.25
252 0.25
253 0.25
254 0.22
255 0.18
256 0.16
257 0.13
258 0.08
259 0.05
260 0.05
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.13
267 0.19
268 0.21
269 0.21
270 0.22
271 0.22
272 0.28
273 0.3
274 0.29
275 0.25
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.22
280 0.16
281 0.18
282 0.15
283 0.17
284 0.18
285 0.2
286 0.22
287 0.21
288 0.21
289 0.21
290 0.21
291 0.19
292 0.22
293 0.21
294 0.19
295 0.2
296 0.21
297 0.19
298 0.22
299 0.22
300 0.19
301 0.19
302 0.2
303 0.22
304 0.21
305 0.19
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.18
311 0.16
312 0.16
313 0.2
314 0.21
315 0.22
316 0.24
317 0.25
318 0.24
319 0.26
320 0.27
321 0.25
322 0.3
323 0.35
324 0.36
325 0.41
326 0.46
327 0.46
328 0.49
329 0.56
330 0.53
331 0.48
332 0.46
333 0.45
334 0.48
335 0.53
336 0.55