Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175VRM2

Protein Details
Accession A0A175VRM2    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-49VTPSKPQSWGKVKLKRPLPKQTKPGNWKEANVHydrophilic
113-139IANCLKIKKEKAQRKKEAREARERLKEBasic
198-219LDKGKAKKKKDEPKPKVAKPKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-36KLKRPLP
118-143KIKKEKAQRKKEAREARERLKEAARE
172-219IPGKTAKKAAGKKTDVAGKKRKAEGELDKGKAKKKKDEPKPKVAKPKG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013243  SCA7_dom  
IPR037804  SGF73  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF08313  SCA7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51505  SCA7  
Amino Acid Sequences MESHEEATIKVASAKNSVTPSKPQSWGKVKLKRPLPKQTKPGNWKEANVLDDDKRKSKDGAITAASPSPVINQLDDSSRETFSSGRPVEDPPDLQQCKYCKKGVTRTAAKDHIANCLKIKKEKAQRKKEAREARERLKEAAREEEARKADEDGAGRGGDGDSDDDDEQKGGIPGKTAKKAAGKKTDVAGKKRKAEGELDKGKAKKKKDEPKPKVAKPKGPVDVERQCGVMLPNGQPCARSLTCKSHSMSAKRAVPGRSLPYDMLLMAYQKKNQAKQQKAAIDANAPLEDEDDANAGAVDSDEETAAVMSALATWNPQPVVPQPVFAPIKRQYQLARLHEQLQTATNGGRVNIFKVVGYGAQRLPDGHPGLYDYEDAPGELDTAVVGGGGDFSRRSSSFSLSGPPPRRPSVTGRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.32
4 0.35
5 0.34
6 0.39
7 0.44
8 0.48
9 0.54
10 0.55
11 0.59
12 0.64
13 0.7
14 0.72
15 0.75
16 0.75
17 0.77
18 0.81
19 0.81
20 0.82
21 0.82
22 0.83
23 0.83
24 0.85
25 0.86
26 0.87
27 0.87
28 0.88
29 0.87
30 0.8
31 0.73
32 0.7
33 0.64
34 0.55
35 0.49
36 0.43
37 0.38
38 0.42
39 0.44
40 0.44
41 0.42
42 0.43
43 0.41
44 0.43
45 0.45
46 0.42
47 0.43
48 0.4
49 0.39
50 0.39
51 0.38
52 0.32
53 0.25
54 0.2
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.2
62 0.22
63 0.24
64 0.21
65 0.21
66 0.2
67 0.19
68 0.19
69 0.18
70 0.25
71 0.22
72 0.22
73 0.23
74 0.25
75 0.28
76 0.29
77 0.29
78 0.23
79 0.33
80 0.32
81 0.31
82 0.35
83 0.37
84 0.41
85 0.44
86 0.45
87 0.41
88 0.48
89 0.58
90 0.61
91 0.65
92 0.67
93 0.68
94 0.71
95 0.69
96 0.62
97 0.56
98 0.48
99 0.47
100 0.42
101 0.37
102 0.33
103 0.35
104 0.37
105 0.38
106 0.42
107 0.42
108 0.49
109 0.58
110 0.65
111 0.71
112 0.78
113 0.83
114 0.88
115 0.89
116 0.88
117 0.85
118 0.85
119 0.82
120 0.8
121 0.78
122 0.71
123 0.65
124 0.6
125 0.56
126 0.47
127 0.45
128 0.39
129 0.35
130 0.35
131 0.37
132 0.33
133 0.31
134 0.29
135 0.25
136 0.23
137 0.2
138 0.2
139 0.14
140 0.14
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.15
161 0.2
162 0.24
163 0.24
164 0.26
165 0.32
166 0.39
167 0.44
168 0.48
169 0.45
170 0.44
171 0.47
172 0.51
173 0.48
174 0.49
175 0.51
176 0.48
177 0.51
178 0.52
179 0.51
180 0.45
181 0.47
182 0.46
183 0.46
184 0.46
185 0.43
186 0.43
187 0.44
188 0.48
189 0.47
190 0.44
191 0.43
192 0.47
193 0.55
194 0.62
195 0.71
196 0.73
197 0.79
198 0.85
199 0.82
200 0.83
201 0.79
202 0.75
203 0.68
204 0.68
205 0.64
206 0.57
207 0.53
208 0.5
209 0.5
210 0.46
211 0.41
212 0.33
213 0.27
214 0.25
215 0.22
216 0.17
217 0.13
218 0.13
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.21
225 0.19
226 0.2
227 0.21
228 0.29
229 0.32
230 0.36
231 0.36
232 0.36
233 0.42
234 0.42
235 0.44
236 0.43
237 0.44
238 0.42
239 0.46
240 0.4
241 0.37
242 0.37
243 0.36
244 0.31
245 0.28
246 0.26
247 0.22
248 0.21
249 0.18
250 0.15
251 0.11
252 0.1
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.21
257 0.26
258 0.29
259 0.37
260 0.45
261 0.48
262 0.52
263 0.58
264 0.56
265 0.57
266 0.54
267 0.48
268 0.4
269 0.34
270 0.3
271 0.22
272 0.18
273 0.13
274 0.11
275 0.1
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.06
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.13
306 0.2
307 0.19
308 0.2
309 0.19
310 0.27
311 0.3
312 0.28
313 0.33
314 0.31
315 0.4
316 0.4
317 0.43
318 0.37
319 0.42
320 0.51
321 0.5
322 0.5
323 0.45
324 0.48
325 0.46
326 0.45
327 0.38
328 0.32
329 0.26
330 0.21
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.15
335 0.18
336 0.17
337 0.18
338 0.19
339 0.19
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.19
346 0.18
347 0.19
348 0.2
349 0.21
350 0.22
351 0.26
352 0.26
353 0.22
354 0.22
355 0.22
356 0.23
357 0.23
358 0.22
359 0.15
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.08
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.06
378 0.08
379 0.13
380 0.14
381 0.18
382 0.2
383 0.25
384 0.27
385 0.29
386 0.35
387 0.36
388 0.46
389 0.48
390 0.53
391 0.55
392 0.57
393 0.59
394 0.57