Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175WDX2

Protein Details
Accession A0A175WDX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-221VQVRMLVPKKRDKRRATPDEAKEVFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-163GKDGIKYGKKKREPR
205-210KKRDKR
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 11.5, cyto 4.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036788  T_IF-3_C_sf  
IPR001288  Translation_initiation_fac_3  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Amino Acid Sequences MRGSQCLLNSAAALRMVFVSSAFAPEVPVRLLLPTVARSSQLSFPLRRAFSTQHVVRFRNSRPIPNAGKSPASGPMRNFDITYPYVQIRGHDNRLAEPERTNTILRQLDLARNDLVLVAHPRRDPSAKGPEYPICIIEDRRAKAAEQAGKDGIKYGKKKREPRIIEKELEVNWAIAPNDLRTRMKQLKTFLSKGYKVQVRMLVPKKRDKRRATPDEAKEVFRIVQETIAEVPGTTNYKPMEGNVGQMVTMFLQGPTGGGPSAPKETATVQVTEEATVKEAGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.1
4 0.1
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.13
21 0.14
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.18
26 0.21
27 0.24
28 0.28
29 0.31
30 0.3
31 0.34
32 0.41
33 0.4
34 0.38
35 0.39
36 0.35
37 0.36
38 0.44
39 0.43
40 0.44
41 0.49
42 0.5
43 0.5
44 0.53
45 0.49
46 0.51
47 0.5
48 0.49
49 0.47
50 0.54
51 0.56
52 0.53
53 0.55
54 0.47
55 0.46
56 0.39
57 0.36
58 0.35
59 0.34
60 0.33
61 0.28
62 0.29
63 0.31
64 0.31
65 0.3
66 0.22
67 0.22
68 0.21
69 0.21
70 0.2
71 0.16
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.22
76 0.25
77 0.28
78 0.28
79 0.28
80 0.27
81 0.33
82 0.34
83 0.28
84 0.24
85 0.23
86 0.22
87 0.24
88 0.23
89 0.18
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.22
94 0.21
95 0.23
96 0.23
97 0.25
98 0.18
99 0.16
100 0.16
101 0.13
102 0.11
103 0.09
104 0.12
105 0.11
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.22
113 0.31
114 0.3
115 0.31
116 0.34
117 0.33
118 0.34
119 0.33
120 0.27
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.18
125 0.22
126 0.19
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.21
131 0.26
132 0.25
133 0.21
134 0.22
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.18
140 0.2
141 0.25
142 0.32
143 0.4
144 0.48
145 0.58
146 0.64
147 0.72
148 0.74
149 0.78
150 0.8
151 0.76
152 0.69
153 0.61
154 0.55
155 0.45
156 0.4
157 0.3
158 0.2
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.12
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.25
170 0.32
171 0.36
172 0.39
173 0.41
174 0.47
175 0.52
176 0.53
177 0.5
178 0.49
179 0.47
180 0.45
181 0.48
182 0.43
183 0.38
184 0.4
185 0.39
186 0.35
187 0.43
188 0.49
189 0.48
190 0.5
191 0.58
192 0.64
193 0.69
194 0.76
195 0.75
196 0.77
197 0.81
198 0.85
199 0.85
200 0.85
201 0.81
202 0.81
203 0.75
204 0.66
205 0.56
206 0.47
207 0.38
208 0.29
209 0.25
210 0.15
211 0.16
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.14
221 0.13
222 0.16
223 0.15
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.23
228 0.2
229 0.23
230 0.21
231 0.21
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.08
247 0.11
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.17
252 0.19
253 0.26
254 0.27
255 0.25
256 0.22
257 0.26
258 0.26
259 0.25
260 0.25
261 0.18
262 0.18