Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W3I1

Protein Details
Accession A0A175W3I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-401LTDYSMHGKKRVKKGKWKNGLEQFDEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
382-392GKKRVKKGKWK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAKGKWIDKKTATHFTLVYRPQNDPLIHDESAPPMVLNPTQRPGNSKGKGLSDLASELGSDAQSIRDNEGEAANYGIFYDDTEYDYMQHLRDLDQGSGEAVFVEANPVMNKGKGKQKGSLADALAQLDLQNQSEGLLDGDILPSKNLQKLTYQAQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAFVDEEGGEDIFQELAKDAKELNQRDFERSYDGVDDDEGWESDRTVKATREHSRDDDVPQLKEVGNNEPAEGPSHDWMEDFKKFKSDQRAGKKPRAAATPSEVQSSVWTTTTNGGRKKTRKGAMTNPSAYSMTSSSLVRTEQLGILDARFEKIEEAYSADVDDLGSVSAVSTMSTVQGPTRADFDGLLDEFLTDYSMHGKKRVKKGKWKNGLEQFDEIRKELGPPRIPSKYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.51
3 0.54
4 0.52
5 0.53
6 0.46
7 0.47
8 0.47
9 0.52
10 0.48
11 0.42
12 0.41
13 0.39
14 0.36
15 0.34
16 0.31
17 0.27
18 0.28
19 0.24
20 0.18
21 0.13
22 0.15
23 0.17
24 0.22
25 0.23
26 0.27
27 0.31
28 0.32
29 0.37
30 0.42
31 0.49
32 0.46
33 0.48
34 0.47
35 0.46
36 0.48
37 0.45
38 0.39
39 0.3
40 0.28
41 0.23
42 0.19
43 0.15
44 0.12
45 0.11
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.12
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.13
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.07
65 0.06
66 0.09
67 0.08
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.15
74 0.13
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.18
79 0.19
80 0.17
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.14
85 0.13
86 0.07
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.09
95 0.1
96 0.12
97 0.14
98 0.17
99 0.26
100 0.32
101 0.35
102 0.39
103 0.45
104 0.48
105 0.5
106 0.5
107 0.42
108 0.38
109 0.36
110 0.31
111 0.24
112 0.18
113 0.14
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.09
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.19
137 0.25
138 0.29
139 0.29
140 0.28
141 0.3
142 0.3
143 0.29
144 0.26
145 0.2
146 0.14
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.1
190 0.17
191 0.19
192 0.21
193 0.28
194 0.29
195 0.32
196 0.33
197 0.28
198 0.25
199 0.24
200 0.22
201 0.16
202 0.15
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.15
217 0.17
218 0.26
219 0.33
220 0.36
221 0.38
222 0.39
223 0.42
224 0.41
225 0.39
226 0.39
227 0.35
228 0.3
229 0.27
230 0.26
231 0.22
232 0.22
233 0.22
234 0.17
235 0.19
236 0.18
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.14
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.13
248 0.15
249 0.2
250 0.2
251 0.19
252 0.23
253 0.25
254 0.3
255 0.39
256 0.42
257 0.46
258 0.55
259 0.65
260 0.67
261 0.74
262 0.73
263 0.67
264 0.65
265 0.61
266 0.54
267 0.46
268 0.45
269 0.44
270 0.4
271 0.38
272 0.32
273 0.27
274 0.25
275 0.24
276 0.2
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.16
281 0.23
282 0.27
283 0.29
284 0.34
285 0.43
286 0.49
287 0.57
288 0.61
289 0.61
290 0.63
291 0.65
292 0.69
293 0.7
294 0.72
295 0.67
296 0.58
297 0.54
298 0.47
299 0.4
300 0.32
301 0.24
302 0.17
303 0.15
304 0.14
305 0.12
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.15
317 0.14
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.12
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.11
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.17
357 0.16
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.06
364 0.07
365 0.13
366 0.18
367 0.19
368 0.26
369 0.34
370 0.42
371 0.54
372 0.64
373 0.67
374 0.74
375 0.84
376 0.88
377 0.91
378 0.9
379 0.9
380 0.89
381 0.87
382 0.8
383 0.75
384 0.69
385 0.65
386 0.59
387 0.5
388 0.41
389 0.34
390 0.34
391 0.35
392 0.39
393 0.4
394 0.42
395 0.5