Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175VSP9

Protein Details
Accession A0A175VSP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-367IPVLVEWQRRQKQKERGDGPRRRVKQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-365RQKQKERGDGPRRRVK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001441  UPP_synth-like  
IPR018520  UPP_synth-like_CS  
IPR036424  UPP_synth-like_sf  
Gene Ontology GO:0016765  F:transferase activity, transferring alkyl or aryl (other than methyl) groups  
GO:0019408  P:dolichol biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01255  Prenyltransf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01066  UPP_SYNTHASE  
CDD cd00475  Cis_IPPS  
Amino Acid Sequences MSDLYLSRIRSWLRSSPPAEWAANRLRETLIGSLSQGPIPRHVAFEMDGNRRYARSHKIETVEGHHHGFEALARILEVCYKCGVEVVTVYAFSLENFHRPKYEVDGLMQLAKLKLEQLMQHGDILDRYGASVRVLGQLDRIPPDVFEVVRRAVTATRHNTDCVLNICFPYTSREEITTAIRTTVEEYSTTPRPHSTAFSQSRIYQKIMSSQGREPDILPSITETTPSPPPDQPDELAPPSTPGQSDDQDEAVSTSSTLHSDSASHKVGDGETVAIYPNAESITPETIDRHMYTAGCPPLDIFVRTSGVERLSDFMLWQCHQDTQIFFLKCLWPDFDLWHFIPVLVEWQRRQKQKERGDGPRRRVKQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.51
4 0.54
5 0.54
6 0.51
7 0.44
8 0.44
9 0.43
10 0.46
11 0.43
12 0.39
13 0.35
14 0.34
15 0.35
16 0.31
17 0.24
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.2
22 0.21
23 0.22
24 0.2
25 0.23
26 0.27
27 0.26
28 0.25
29 0.25
30 0.25
31 0.22
32 0.27
33 0.31
34 0.32
35 0.33
36 0.34
37 0.34
38 0.33
39 0.35
40 0.34
41 0.36
42 0.38
43 0.42
44 0.46
45 0.49
46 0.52
47 0.53
48 0.53
49 0.49
50 0.44
51 0.39
52 0.33
53 0.29
54 0.24
55 0.21
56 0.16
57 0.14
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.16
64 0.15
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.08
80 0.11
81 0.1
82 0.16
83 0.19
84 0.2
85 0.21
86 0.23
87 0.24
88 0.28
89 0.32
90 0.26
91 0.26
92 0.28
93 0.27
94 0.26
95 0.25
96 0.19
97 0.14
98 0.13
99 0.11
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.14
105 0.18
106 0.18
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.11
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.11
121 0.12
122 0.11
123 0.12
124 0.14
125 0.15
126 0.16
127 0.17
128 0.13
129 0.12
130 0.14
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.15
141 0.21
142 0.24
143 0.27
144 0.27
145 0.28
146 0.28
147 0.27
148 0.26
149 0.21
150 0.18
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.16
163 0.18
164 0.17
165 0.15
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.12
171 0.1
172 0.08
173 0.1
174 0.14
175 0.18
176 0.19
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.19
183 0.24
184 0.28
185 0.3
186 0.31
187 0.33
188 0.37
189 0.36
190 0.35
191 0.27
192 0.24
193 0.27
194 0.32
195 0.32
196 0.3
197 0.3
198 0.32
199 0.31
200 0.31
201 0.25
202 0.21
203 0.2
204 0.17
205 0.15
206 0.12
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.17
213 0.19
214 0.2
215 0.19
216 0.23
217 0.27
218 0.28
219 0.26
220 0.25
221 0.27
222 0.26
223 0.25
224 0.21
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.15
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.16
236 0.16
237 0.14
238 0.11
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.09
248 0.12
249 0.17
250 0.18
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.18
255 0.16
256 0.14
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.11
270 0.11
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.17
280 0.22
281 0.23
282 0.2
283 0.19
284 0.18
285 0.2
286 0.21
287 0.21
288 0.16
289 0.16
290 0.18
291 0.18
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.15
302 0.18
303 0.17
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.21
308 0.24
309 0.22
310 0.22
311 0.3
312 0.28
313 0.27
314 0.29
315 0.32
316 0.3
317 0.32
318 0.3
319 0.23
320 0.24
321 0.28
322 0.27
323 0.29
324 0.28
325 0.27
326 0.24
327 0.22
328 0.21
329 0.18
330 0.22
331 0.23
332 0.27
333 0.29
334 0.4
335 0.48
336 0.56
337 0.63
338 0.66
339 0.7
340 0.75
341 0.82
342 0.81
343 0.84
344 0.86
345 0.88
346 0.89
347 0.89