Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175VNK8

Protein Details
Accession A0A175VNK8    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-109IDGETTKKPKEGRRPKKRARGNEDDVGEBasic
159-181MDNALKNPTKRRRKKDEIDLEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-102KAAKRKRIDGETTKKPKEGRRPKKRARG
114-132ERRPRKARATDGERRAARK
163-173LKNPTKRRRKK
424-431KGKGGGRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDADSPVDSPAEPTQHRDDESPADLQDSGAGGDAGSDKDSDLLSEIDEDQFDDYDPTLEERPVEIDENIAKTLKAAKRKRIDGETTKKPKEGRRPKKRARGNEDDVGEAADIERRPRKARATDGERRAARKEAAEEDQANEENLTPEERRRRALQRAMDNALKNPTKRRRKKDEIDLEEEIDDQIANLKVAIEKACVADNEARDKQMAATHKLKLLPQVTALLNRTAVQDAVLDPETNFLQSVKYLLEPLNDGSLPAYNIQRDIFNALAKLPVNKDVLLSSGIGKVVFFYTKSKRPEAGIKRIAERLVGEWSRPILKRTDDYKKRQIETRDFDFVAAKIAQRQEAAVSGSQMTLTQRPAGKSLFELERERLLAPETKSNRAQPAGLPASYTIAPRSTFDATRSADYRPIGSGGMEAFRKMTQKGKGGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.35
3 0.38
4 0.4
5 0.39
6 0.39
7 0.37
8 0.39
9 0.36
10 0.29
11 0.26
12 0.24
13 0.22
14 0.19
15 0.14
16 0.11
17 0.09
18 0.09
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.13
49 0.15
50 0.16
51 0.17
52 0.14
53 0.16
54 0.18
55 0.19
56 0.2
57 0.18
58 0.16
59 0.15
60 0.24
61 0.26
62 0.33
63 0.39
64 0.48
65 0.56
66 0.64
67 0.7
68 0.69
69 0.73
70 0.73
71 0.75
72 0.76
73 0.77
74 0.73
75 0.7
76 0.68
77 0.67
78 0.68
79 0.7
80 0.71
81 0.72
82 0.8
83 0.87
84 0.92
85 0.93
86 0.92
87 0.9
88 0.89
89 0.84
90 0.8
91 0.71
92 0.62
93 0.52
94 0.42
95 0.32
96 0.22
97 0.15
98 0.11
99 0.1
100 0.14
101 0.19
102 0.21
103 0.25
104 0.3
105 0.38
106 0.41
107 0.49
108 0.55
109 0.59
110 0.66
111 0.69
112 0.72
113 0.68
114 0.64
115 0.58
116 0.51
117 0.43
118 0.37
119 0.34
120 0.3
121 0.3
122 0.31
123 0.29
124 0.27
125 0.28
126 0.25
127 0.22
128 0.17
129 0.14
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.1
134 0.16
135 0.24
136 0.26
137 0.29
138 0.34
139 0.41
140 0.47
141 0.54
142 0.56
143 0.55
144 0.59
145 0.6
146 0.58
147 0.52
148 0.45
149 0.44
150 0.39
151 0.33
152 0.37
153 0.43
154 0.5
155 0.59
156 0.67
157 0.71
158 0.78
159 0.85
160 0.87
161 0.87
162 0.83
163 0.79
164 0.71
165 0.61
166 0.51
167 0.42
168 0.31
169 0.2
170 0.13
171 0.06
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.12
187 0.13
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.18
197 0.21
198 0.22
199 0.25
200 0.26
201 0.26
202 0.27
203 0.25
204 0.2
205 0.17
206 0.19
207 0.17
208 0.19
209 0.19
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.11
215 0.1
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.14
259 0.12
260 0.15
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.14
265 0.15
266 0.14
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.13
278 0.19
279 0.26
280 0.31
281 0.34
282 0.34
283 0.37
284 0.47
285 0.5
286 0.54
287 0.54
288 0.52
289 0.52
290 0.53
291 0.5
292 0.41
293 0.33
294 0.24
295 0.25
296 0.22
297 0.19
298 0.18
299 0.2
300 0.25
301 0.25
302 0.25
303 0.21
304 0.24
305 0.3
306 0.37
307 0.46
308 0.5
309 0.57
310 0.65
311 0.69
312 0.69
313 0.69
314 0.7
315 0.69
316 0.67
317 0.65
318 0.61
319 0.53
320 0.5
321 0.45
322 0.36
323 0.31
324 0.24
325 0.19
326 0.17
327 0.19
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.15
332 0.16
333 0.18
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.18
344 0.21
345 0.22
346 0.26
347 0.26
348 0.25
349 0.23
350 0.28
351 0.27
352 0.28
353 0.3
354 0.29
355 0.32
356 0.32
357 0.31
358 0.26
359 0.24
360 0.25
361 0.24
362 0.32
363 0.32
364 0.37
365 0.41
366 0.45
367 0.48
368 0.45
369 0.44
370 0.36
371 0.42
372 0.41
373 0.36
374 0.32
375 0.27
376 0.28
377 0.27
378 0.26
379 0.18
380 0.17
381 0.18
382 0.18
383 0.22
384 0.23
385 0.24
386 0.25
387 0.31
388 0.31
389 0.35
390 0.36
391 0.33
392 0.34
393 0.33
394 0.33
395 0.27
396 0.26
397 0.21
398 0.19
399 0.19
400 0.15
401 0.19
402 0.18
403 0.17
404 0.17
405 0.19
406 0.22
407 0.23
408 0.28
409 0.31
410 0.38
411 0.45