Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175WBF7

Protein Details
Accession A0A175WBF7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-62TEEFRRIKRRQNKPAAPGASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01717  Sm_B  
Amino Acid Sequences MTSTNKQGKMINYRMRITLNDGRQMTGQMLAFDKHMNLVLADTEEFRRIKRRQNKPAAPGASSSAAQTVEQEEKRTLGLTIVRGSHIVSLSVESPPPADPSARLGKTAGTGIATTLTAGPGVARPAGRGAAAPISLAGPAAGVGGAAPPPFPTFPGAPGFPGRGGPAPPGFGGGFPPAGFSGAPGFTPPFPPGGAPPSGFNPPPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.49
4 0.48
5 0.46
6 0.42
7 0.44
8 0.42
9 0.41
10 0.39
11 0.39
12 0.31
13 0.26
14 0.21
15 0.15
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.12
22 0.12
23 0.11
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.24
35 0.27
36 0.37
37 0.46
38 0.56
39 0.62
40 0.73
41 0.8
42 0.77
43 0.82
44 0.75
45 0.65
46 0.56
47 0.47
48 0.38
49 0.3
50 0.24
51 0.16
52 0.14
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.17
63 0.14
64 0.1
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.12
88 0.19
89 0.18
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.17
95 0.13
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.02
130 0.02
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.11
140 0.11
141 0.14
142 0.18
143 0.18
144 0.18
145 0.2
146 0.21
147 0.18
148 0.18
149 0.17
150 0.16
151 0.16
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.17
158 0.15
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.13
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.14
173 0.14
174 0.17
175 0.17
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.23
182 0.21
183 0.23
184 0.26
185 0.31
186 0.32