FuNGI

A0A175VZJ5

Protein Details

Accession

A0A175VZJ5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-43	DNDGPSHPSSKRRRDQQSTKSKHAENKPDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MGSKRNYNAVFANDNDGPSHPSSKRRRDQQSTKSKHAENKPDPTYGQRAAFPGLDDDDAQLTDDDLEFEEHGDALAYLRSVRQEASTVPNVLVAPKAGPQLPLHLQTTNDDTAIDRSLYDNGVGDSRGYYQDGAYTAVPDPDPSIASSPEEGEEEDEEGEYRPGTPPDSSTNPDVIARNSAALRKAYYASLTAQFLRLRALLHRAPPPDLVASLPRENGTEVGSFGARSWTFRVWTKRIRHTDPLPAQVAALDRQSVLKLLRVILGGKFIRRGYELRERTSRWLWALLARLPDRGELDYTEVGWVRELGKRAVLMMVSIAQMAALREEVGEGVIDDGGEGEEEDDEEEDGEYIGEIAVDDDEVEEGSGGASGETGLKSRDDEAGPPAGASAISKPAADVPVVDEDGNGEMDMDLDDGEISDEPTAAKGNQDIEAEIAAAKARLLARLAEPTDTEQNEQAATAVEPGADEQEEENGEEQTAFDETRARVNMRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFRDPFPAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.3
3	0.28
4	0.26
5	0.25
6	0.31
7	0.29
8	0.37
9	0.47
10	0.57
11	0.65
12	0.71
13	0.79
14	0.82
15	0.89
16	0.9
17	0.91
18	0.89
19	0.89
20	0.87
21	0.82
22	0.81
23	0.8
24	0.8
25	0.78
26	0.79
27	0.73
28	0.69
29	0.64
30	0.61
31	0.58
32	0.52
33	0.47
34	0.39
35	0.37
36	0.36
37	0.35
38	0.3
39	0.25
40	0.21
41	0.2
42	0.17
43	0.16
44	0.15
45	0.14
46	0.14
47	0.11
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.08
55	0.09
56	0.09
57	0.08
58	0.08
59	0.08
60	0.07
61	0.06
62	0.07
63	0.06
64	0.06
65	0.08
66	0.09
67	0.1
68	0.11
69	0.12
70	0.13
71	0.15
72	0.22
73	0.25
74	0.25
75	0.23
76	0.25
77	0.24
78	0.23
79	0.2
80	0.14
81	0.11
82	0.12
83	0.15
84	0.14
85	0.16
86	0.15
87	0.21
88	0.24
89	0.27
90	0.27
91	0.26
92	0.25
93	0.25
94	0.3
95	0.25
96	0.21
97	0.17
98	0.16
99	0.16
100	0.17
101	0.15
102	0.11
103	0.11
104	0.12
105	0.12
106	0.12
107	0.1
108	0.09
109	0.1
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.1
114	0.11
115	0.11
116	0.11
117	0.1
118	0.12
119	0.12
120	0.13
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.13
125	0.13
126	0.11
127	0.11
128	0.1
129	0.11
130	0.1
131	0.11
132	0.1
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.08
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.12
154	0.17
155	0.21
156	0.23
157	0.24
158	0.24
159	0.24
160	0.25
161	0.24
162	0.2
163	0.19
164	0.16
165	0.15
166	0.15
167	0.17
168	0.17
169	0.16
170	0.16
171	0.15
172	0.16
173	0.15
174	0.15
175	0.14
176	0.14
177	0.16
178	0.16
179	0.15
180	0.17
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.14
185	0.13
186	0.13
187	0.18
188	0.17
189	0.21
190	0.26
191	0.26
192	0.27
193	0.26
194	0.26
195	0.21
196	0.19
197	0.16
198	0.14
199	0.16
200	0.15
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.14
205	0.14
206	0.13
207	0.09
208	0.08
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.11
214	0.09
215	0.1
216	0.12
217	0.13
218	0.15
219	0.2
220	0.26
221	0.29
222	0.37
223	0.43
224	0.5
225	0.56
226	0.59
227	0.61
228	0.57
229	0.61
230	0.57
231	0.54
232	0.46
233	0.39
234	0.33
235	0.28
236	0.25
237	0.16
238	0.13
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.07
245	0.08
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.1
250	0.11
251	0.1
252	0.15
253	0.13
254	0.13
255	0.15
256	0.14
257	0.14
258	0.15
259	0.16
260	0.17
261	0.27
262	0.3
263	0.32
264	0.36
265	0.37
266	0.4
267	0.41
268	0.37
269	0.28
270	0.26
271	0.22
272	0.2
273	0.21
274	0.19
275	0.21
276	0.2
277	0.2
278	0.18
279	0.19
280	0.17
281	0.15
282	0.14
283	0.1
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.09
292	0.08
293	0.1
294	0.12
295	0.11
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.1
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.05
307	0.04
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.03
319	0.04
320	0.04
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.08
365	0.1
366	0.13
367	0.13
368	0.15
369	0.17
370	0.19
371	0.19
372	0.18
373	0.16
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.12
383	0.13
384	0.13
385	0.11
386	0.1
387	0.13
388	0.14
389	0.14
390	0.12
391	0.11
392	0.12
393	0.12
394	0.1
395	0.06
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.06
409	0.06
410	0.07
411	0.08
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.15
417	0.15
418	0.15
419	0.14
420	0.14
421	0.13
422	0.11
423	0.1
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.13
432	0.15
433	0.21
434	0.23
435	0.21
436	0.21
437	0.24
438	0.3
439	0.3
440	0.29
441	0.24
442	0.24
443	0.23
444	0.22
445	0.18
446	0.12
447	0.11
448	0.1
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.09
454	0.08
455	0.09
456	0.08
457	0.1
458	0.11
459	0.12
460	0.13
461	0.11
462	0.12
463	0.11
464	0.11
465	0.09
466	0.1
467	0.09
468	0.09
469	0.14
470	0.14
471	0.21
472	0.25
473	0.25
474	0.27
475	0.3
476	0.37
477	0.35
478	0.37
479	0.33
480	0.33
481	0.32
482	0.29
483	0.26
484	0.18
485	0.16
486	0.12
487	0.1
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.11
493	0.1
494	0.1
495	0.12
496	0.14
497	0.16
498	0.24
499	0.23
500	0.21

A0A175VZJ5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer