Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W5D6

Protein Details
Accession A0A175W5D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-299AAAPAPSFKRQVKKKKDHAALLGIKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-301KRQVKKKKDHAALLGIKKKQ
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVLTKYYPPDFDPSLVGRSRKPKGAAQAGPKVQTVRLMAPFSLRCIACGEYMYRGRKFNARKETPPDERYLGIQLFRFYIRCTRCSAEIVFRTDPKNQDYVVERGAKRNTEPWKRGLADGETEETDEQRLDRLEREMMERDADADGARHLLGDERNAMAELEAKTADAKREMAVADALDEIRSRNARLERAQREGGGTLLDGLVGVGGGEEGVRVCEEAGDVGGGGRGPDEDGSGSGTAGDGADGVASASSSDSKPTTVVATGSNTVAPAAAPAPSFKRQVKKKKDHAALLGIKKKQPPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.46
3 0.41
4 0.37
5 0.35
6 0.35
7 0.35
8 0.35
9 0.42
10 0.46
11 0.48
12 0.5
13 0.49
14 0.54
15 0.62
16 0.63
17 0.62
18 0.67
19 0.64
20 0.62
21 0.58
22 0.5
23 0.41
24 0.38
25 0.33
26 0.28
27 0.29
28 0.28
29 0.27
30 0.31
31 0.31
32 0.29
33 0.33
34 0.27
35 0.23
36 0.24
37 0.25
38 0.2
39 0.21
40 0.2
41 0.2
42 0.27
43 0.32
44 0.33
45 0.34
46 0.35
47 0.42
48 0.48
49 0.51
50 0.55
51 0.56
52 0.6
53 0.66
54 0.72
55 0.73
56 0.68
57 0.63
58 0.54
59 0.48
60 0.43
61 0.39
62 0.31
63 0.25
64 0.23
65 0.2
66 0.19
67 0.19
68 0.18
69 0.15
70 0.22
71 0.23
72 0.23
73 0.27
74 0.28
75 0.29
76 0.31
77 0.32
78 0.32
79 0.34
80 0.37
81 0.35
82 0.36
83 0.36
84 0.37
85 0.38
86 0.32
87 0.3
88 0.25
89 0.26
90 0.27
91 0.27
92 0.27
93 0.31
94 0.29
95 0.32
96 0.34
97 0.32
98 0.3
99 0.34
100 0.39
101 0.41
102 0.44
103 0.42
104 0.46
105 0.46
106 0.46
107 0.42
108 0.34
109 0.27
110 0.25
111 0.23
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.15
127 0.16
128 0.16
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.08
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.06
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.14
176 0.17
177 0.21
178 0.27
179 0.36
180 0.38
181 0.43
182 0.44
183 0.39
184 0.37
185 0.33
186 0.27
187 0.18
188 0.13
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.08
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.17
256 0.15
257 0.14
258 0.13
259 0.1
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.11
265 0.16
266 0.2
267 0.27
268 0.32
269 0.42
270 0.51
271 0.62
272 0.7
273 0.76
274 0.82
275 0.87
276 0.9
277 0.88
278 0.84
279 0.83
280 0.81
281 0.8
282 0.77
283 0.71
284 0.67