Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W3L9

Protein Details
Accession A0A175W3L9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-405ERYSHLPEIRRIRRHRHLPKVVKKAGEBasic
411-445LAAIKRREENERKHSDKKFQKRKGEREKAILAKQQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-439RRIRRHRHLPKVVKKAGEIKREELAAIKRREENERKHSDKKFQKRKGEREKA
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007287  Sof1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKIKALSRSISAQQAPGSEAQRAPRNLAPEIHPFERAREYQRALNAVKLERMFAKPFLSQLGNGHVQGVYSMCKDKNSLSSVASGSGDGVVKVWDLTTRDEAWRTAAHSNIVRGLTFTNDKKLLSCGTDGIKLWDPYNTPNDTTPIATWQEGGPYTSLSYHRTGNVFAASSGAGCIRVWDLEHSTAAQTIQWPSFTDTITDVCFNQVETSIIGSVATDRSIILFDLRTNMPVIKTVLHFAANRIVFNPMEAMNMAVASEDHNIYVFDARNFDKAQNIQKGHVAAVMDVEFSPTGEELVSGSYDRTIRIWRRDHGHSRDIYHTKRMQRVFRALWTMDSKYLLTGSDDGNVRLWRANASERSGVKSTKQRQALEYNQALTERYSHLPEIRRIRRHRHLPKVVKKAGEIKREELAAIKRREENERKHSDKKFQKRKGEREKAILAKQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.32
4 0.3
5 0.26
6 0.27
7 0.31
8 0.37
9 0.37
10 0.4
11 0.38
12 0.41
13 0.4
14 0.41
15 0.39
16 0.4
17 0.45
18 0.42
19 0.45
20 0.41
21 0.42
22 0.46
23 0.45
24 0.43
25 0.44
26 0.46
27 0.45
28 0.49
29 0.52
30 0.46
31 0.46
32 0.45
33 0.39
34 0.4
35 0.36
36 0.33
37 0.3
38 0.33
39 0.32
40 0.28
41 0.3
42 0.25
43 0.26
44 0.28
45 0.26
46 0.24
47 0.23
48 0.27
49 0.26
50 0.25
51 0.25
52 0.2
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.12
57 0.12
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.19
62 0.22
63 0.27
64 0.29
65 0.29
66 0.26
67 0.28
68 0.28
69 0.28
70 0.25
71 0.18
72 0.15
73 0.14
74 0.13
75 0.09
76 0.09
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.1
83 0.13
84 0.17
85 0.19
86 0.21
87 0.23
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.23
92 0.21
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.23
97 0.24
98 0.23
99 0.2
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.21
104 0.21
105 0.23
106 0.24
107 0.24
108 0.24
109 0.26
110 0.25
111 0.21
112 0.2
113 0.17
114 0.18
115 0.2
116 0.2
117 0.22
118 0.24
119 0.23
120 0.22
121 0.22
122 0.21
123 0.22
124 0.27
125 0.25
126 0.22
127 0.22
128 0.24
129 0.23
130 0.23
131 0.19
132 0.18
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.14
154 0.12
155 0.11
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.11
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.18
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.15
257 0.16
258 0.16
259 0.17
260 0.21
261 0.28
262 0.33
263 0.33
264 0.31
265 0.33
266 0.33
267 0.29
268 0.27
269 0.19
270 0.12
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.07
275 0.08
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.17
293 0.22
294 0.31
295 0.35
296 0.38
297 0.44
298 0.52
299 0.6
300 0.6
301 0.61
302 0.56
303 0.55
304 0.59
305 0.6
306 0.54
307 0.52
308 0.52
309 0.52
310 0.56
311 0.59
312 0.57
313 0.57
314 0.62
315 0.57
316 0.55
317 0.54
318 0.47
319 0.45
320 0.43
321 0.38
322 0.31
323 0.29
324 0.25
325 0.2
326 0.2
327 0.15
328 0.13
329 0.12
330 0.11
331 0.15
332 0.16
333 0.16
334 0.19
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.18
339 0.15
340 0.17
341 0.24
342 0.24
343 0.28
344 0.34
345 0.33
346 0.38
347 0.39
348 0.38
349 0.37
350 0.44
351 0.47
352 0.49
353 0.56
354 0.53
355 0.55
356 0.62
357 0.63
358 0.62
359 0.57
360 0.51
361 0.45
362 0.42
363 0.38
364 0.3
365 0.25
366 0.2
367 0.19
368 0.2
369 0.21
370 0.27
371 0.32
372 0.39
373 0.48
374 0.53
375 0.6
376 0.65
377 0.73
378 0.77
379 0.82
380 0.85
381 0.85
382 0.87
383 0.88
384 0.91
385 0.92
386 0.88
387 0.8
388 0.74
389 0.73
390 0.7
391 0.68
392 0.62
393 0.55
394 0.53
395 0.5
396 0.46
397 0.42
398 0.42
399 0.42
400 0.42
401 0.43
402 0.45
403 0.48
404 0.58
405 0.62
406 0.63
407 0.65
408 0.7
409 0.73
410 0.77
411 0.81
412 0.81
413 0.82
414 0.84
415 0.84
416 0.84
417 0.88
418 0.89
419 0.93
420 0.94
421 0.94
422 0.9
423 0.88
424 0.87
425 0.85