Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W7S9

Protein Details
Accession A0A175W7S9    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-166AGFGGRPYKQPRRGRGGRQDDVBasic
225-249QGGHLPKRRTKCRDWEKKGYCQRGSBasic
312-333QQQPRHKGGKHPNRQRRAERAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
317-328HKGGKHPNRQRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR002483  PWI_dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045137  RBM26/27  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PF00076  RRM_1  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12257  RRM1_RBM26_like  
Amino Acid Sequences MLFPEEHSPHLKKWIVKRLENTSDADADVLADYVLALLRHDGDVKDVRKLCEEEIPDFLKEDSSVFVSDVFDAIAYRSYLPGAPPPPPKQAPLPDPAAAQPLGSFYDDIPMPQGPAYPPQPFQNGSRKRGYNDWDDPNTQNNRDAGFGGRPYKQPRRGRGGRQDDVGSVRGAAPSVPPFPPAGPLPGQGPPVPSTVGYFDPSRAMDAMFGMSLATGHPMPELLSQGGHLPKRRTKCRDWEKKGYCQRGSNCMFEHSNDPIYPLPGGPFGGMQPLPQTQAVEEYDPNNALMPGLFSAPGPLQGQQPFLPEASQQQPRHKGGKHPNRQRRAERAPFSTDGPVFDRTKSTIVVENIPEENFNENQVKDFFSQFGTILEVSMQPYKRLAIVKFDSWAAANAAYQSPKVIFDNRFVKVFWYKDDGTSLPASGVSHGHNKAKSTNGSLAGADKSGAQTEIDMDDFMKKQEERQKAFAEKTKRMEELQRQQQDLEKRQKELLAKRLEEKARLEAKLAERNGTKSGEANEGDQKPSKTEALRAQLAALEAEAREMGLDPDAVMEAPAPWSTRGGSGYMRGRGGWRGSSTYGYNPRGSYGYRGGPRGRANVHAAYAAYSLDNRPKKVILTGVDFTVSEKDETLRQYLFGIGEFTDIQSSSSSTEITFKDRKTAEKFFNSVLLNNKEIPGIEGALELTWGGSNGSSGSLPTTPGGATTTNPSTPGPMNAANGTSSGGARAAVATTATATATKPRQQVQHQQQKNLLSDDVAGSSSSDKDVHILLERPPLPPDENAQDQNMDYEVADENQWGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.62
3 0.66
4 0.71
5 0.72
6 0.74
7 0.7
8 0.64
9 0.58
10 0.5
11 0.43
12 0.35
13 0.25
14 0.18
15 0.15
16 0.11
17 0.07
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.05
23 0.06
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.12
28 0.12
29 0.16
30 0.24
31 0.26
32 0.34
33 0.36
34 0.38
35 0.41
36 0.44
37 0.4
38 0.4
39 0.42
40 0.35
41 0.38
42 0.39
43 0.33
44 0.32
45 0.3
46 0.23
47 0.2
48 0.18
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.12
57 0.1
58 0.08
59 0.07
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.2
69 0.2
70 0.27
71 0.35
72 0.39
73 0.47
74 0.48
75 0.5
76 0.51
77 0.57
78 0.55
79 0.52
80 0.52
81 0.45
82 0.44
83 0.42
84 0.38
85 0.29
86 0.24
87 0.18
88 0.14
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.1
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.15
101 0.13
102 0.19
103 0.23
104 0.25
105 0.26
106 0.3
107 0.34
108 0.34
109 0.39
110 0.43
111 0.47
112 0.49
113 0.56
114 0.55
115 0.55
116 0.6
117 0.59
118 0.57
119 0.57
120 0.6
121 0.56
122 0.56
123 0.55
124 0.56
125 0.56
126 0.48
127 0.44
128 0.38
129 0.34
130 0.31
131 0.3
132 0.25
133 0.23
134 0.25
135 0.26
136 0.28
137 0.32
138 0.4
139 0.49
140 0.56
141 0.61
142 0.65
143 0.71
144 0.76
145 0.8
146 0.83
147 0.83
148 0.77
149 0.72
150 0.65
151 0.56
152 0.5
153 0.42
154 0.31
155 0.21
156 0.18
157 0.14
158 0.13
159 0.11
160 0.1
161 0.12
162 0.15
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.19
168 0.18
169 0.19
170 0.17
171 0.18
172 0.2
173 0.21
174 0.23
175 0.21
176 0.22
177 0.2
178 0.19
179 0.19
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.13
213 0.17
214 0.2
215 0.24
216 0.28
217 0.34
218 0.43
219 0.53
220 0.57
221 0.6
222 0.68
223 0.74
224 0.79
225 0.82
226 0.84
227 0.81
228 0.84
229 0.85
230 0.83
231 0.77
232 0.73
233 0.67
234 0.66
235 0.63
236 0.56
237 0.48
238 0.43
239 0.39
240 0.33
241 0.33
242 0.26
243 0.25
244 0.21
245 0.22
246 0.18
247 0.19
248 0.17
249 0.14
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.1
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.11
274 0.09
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.13
288 0.14
289 0.16
290 0.15
291 0.17
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.12
296 0.15
297 0.18
298 0.26
299 0.28
300 0.34
301 0.41
302 0.45
303 0.51
304 0.49
305 0.53
306 0.55
307 0.63
308 0.66
309 0.7
310 0.76
311 0.79
312 0.85
313 0.82
314 0.81
315 0.79
316 0.78
317 0.72
318 0.67
319 0.63
320 0.56
321 0.51
322 0.45
323 0.35
324 0.27
325 0.25
326 0.25
327 0.2
328 0.2
329 0.19
330 0.17
331 0.18
332 0.17
333 0.16
334 0.17
335 0.17
336 0.19
337 0.18
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.16
342 0.12
343 0.13
344 0.11
345 0.13
346 0.13
347 0.12
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.13
370 0.16
371 0.15
372 0.18
373 0.21
374 0.21
375 0.21
376 0.21
377 0.19
378 0.16
379 0.16
380 0.09
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.09
391 0.12
392 0.13
393 0.18
394 0.24
395 0.24
396 0.25
397 0.24
398 0.25
399 0.25
400 0.24
401 0.2
402 0.21
403 0.2
404 0.2
405 0.22
406 0.2
407 0.18
408 0.17
409 0.15
410 0.1
411 0.1
412 0.09
413 0.08
414 0.09
415 0.08
416 0.13
417 0.15
418 0.18
419 0.19
420 0.2
421 0.22
422 0.24
423 0.24
424 0.23
425 0.24
426 0.22
427 0.22
428 0.21
429 0.2
430 0.17
431 0.15
432 0.12
433 0.09
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.11
448 0.1
449 0.16
450 0.24
451 0.32
452 0.35
453 0.39
454 0.44
455 0.46
456 0.49
457 0.49
458 0.48
459 0.46
460 0.47
461 0.46
462 0.42
463 0.4
464 0.43
465 0.46
466 0.49
467 0.53
468 0.52
469 0.49
470 0.48
471 0.51
472 0.51
473 0.51
474 0.51
475 0.44
476 0.41
477 0.42
478 0.45
479 0.47
480 0.46
481 0.46
482 0.43
483 0.42
484 0.43
485 0.49
486 0.48
487 0.44
488 0.4
489 0.39
490 0.37
491 0.36
492 0.34
493 0.31
494 0.34
495 0.37
496 0.36
497 0.32
498 0.28
499 0.3
500 0.31
501 0.28
502 0.23
503 0.18
504 0.2
505 0.21
506 0.2
507 0.21
508 0.25
509 0.25
510 0.27
511 0.28
512 0.26
513 0.23
514 0.25
515 0.25
516 0.19
517 0.23
518 0.28
519 0.3
520 0.32
521 0.3
522 0.28
523 0.26
524 0.25
525 0.2
526 0.13
527 0.08
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.04
536 0.05
537 0.04
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.05
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.09
550 0.11
551 0.11
552 0.12
553 0.13
554 0.18
555 0.22
556 0.24
557 0.24
558 0.23
559 0.24
560 0.25
561 0.27
562 0.24
563 0.21
564 0.21
565 0.22
566 0.24
567 0.24
568 0.28
569 0.33
570 0.34
571 0.34
572 0.31
573 0.31
574 0.31
575 0.3
576 0.28
577 0.24
578 0.28
579 0.29
580 0.34
581 0.34
582 0.38
583 0.41
584 0.42
585 0.39
586 0.36
587 0.37
588 0.35
589 0.33
590 0.28
591 0.25
592 0.2
593 0.19
594 0.15
595 0.1
596 0.09
597 0.11
598 0.18
599 0.22
600 0.22
601 0.24
602 0.25
603 0.26
604 0.28
605 0.31
606 0.26
607 0.29
608 0.29
609 0.27
610 0.26
611 0.25
612 0.23
613 0.2
614 0.18
615 0.12
616 0.11
617 0.12
618 0.14
619 0.16
620 0.19
621 0.16
622 0.16
623 0.16
624 0.17
625 0.17
626 0.14
627 0.13
628 0.1
629 0.11
630 0.11
631 0.1
632 0.1
633 0.09
634 0.1
635 0.09
636 0.1
637 0.09
638 0.1
639 0.1
640 0.09
641 0.14
642 0.14
643 0.21
644 0.26
645 0.25
646 0.32
647 0.34
648 0.41
649 0.44
650 0.51
651 0.52
652 0.53
653 0.55
654 0.49
655 0.53
656 0.47
657 0.43
658 0.43
659 0.38
660 0.34
661 0.33
662 0.32
663 0.26
664 0.25
665 0.23
666 0.17
667 0.13
668 0.11
669 0.1
670 0.1
671 0.09
672 0.09
673 0.07
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.05
680 0.05
681 0.07
682 0.06
683 0.07
684 0.09
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.11
689 0.1
690 0.11
691 0.12
692 0.11
693 0.11
694 0.16
695 0.2
696 0.19
697 0.21
698 0.21
699 0.22
700 0.23
701 0.25
702 0.24
703 0.22
704 0.24
705 0.24
706 0.25
707 0.21
708 0.2
709 0.18
710 0.15
711 0.12
712 0.11
713 0.09
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.07
719 0.07
720 0.06
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.08
725 0.08
726 0.15
727 0.21
728 0.28
729 0.32
730 0.37
731 0.45
732 0.53
733 0.63
734 0.67
735 0.72
736 0.72
737 0.74
738 0.74
739 0.72
740 0.68
741 0.6
742 0.49
743 0.39
744 0.34
745 0.28
746 0.24
747 0.18
748 0.14
749 0.12
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.12
754 0.11
755 0.12
756 0.13
757 0.15
758 0.17
759 0.19
760 0.2
761 0.29
762 0.3
763 0.3
764 0.31
765 0.33
766 0.31
767 0.31
768 0.34
769 0.32
770 0.37
771 0.39
772 0.39
773 0.37
774 0.34
775 0.34
776 0.28
777 0.22
778 0.15
779 0.14
780 0.13
781 0.13
782 0.13