Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A175W374

Protein Details
Accession A0A175W374    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MRQVHAKRFHKKNPVHPFEDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-279RKR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MRQVHAKRFHKKNPVHPFEDASSLCFFSEKNDCSLLLFGSSSKKRPHTITFARTFDYKILDMLEFYLDAETFRSIAQFKTDKVPVGTRPLMVFAGTAFESPVPNAFTMAKSMLLDFFRGETSDKIDVEGLRYVVVVTADEPISSETGAAAAAANSDDPASKPVLRLRVYTIRTKRSGQKLPRVELEEHGPRMDFRLGRIQEPDEAMLKEAMRKAKTTEERTKKNISTDVMGDKIGRIHMGKLDLSQLQTRKMKGLKRERDQGDGDEEETVVDDEPKRKRKAQI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.8
3 0.73
4 0.69
5 0.6
6 0.59
7 0.48
8 0.39
9 0.33
10 0.28
11 0.25
12 0.2
13 0.18
14 0.15
15 0.24
16 0.23
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.26
21 0.27
22 0.23
23 0.15
24 0.14
25 0.12
26 0.2
27 0.23
28 0.27
29 0.33
30 0.37
31 0.4
32 0.46
33 0.51
34 0.52
35 0.59
36 0.62
37 0.64
38 0.61
39 0.59
40 0.54
41 0.49
42 0.41
43 0.35
44 0.26
45 0.19
46 0.18
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.13
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.23
67 0.25
68 0.25
69 0.27
70 0.3
71 0.27
72 0.32
73 0.32
74 0.27
75 0.25
76 0.25
77 0.23
78 0.19
79 0.16
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.08
108 0.11
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.1
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.05
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.05
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.13
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.26
154 0.32
155 0.34
156 0.41
157 0.45
158 0.44
159 0.46
160 0.49
161 0.51
162 0.52
163 0.59
164 0.58
165 0.62
166 0.62
167 0.63
168 0.64
169 0.6
170 0.52
171 0.44
172 0.43
173 0.38
174 0.32
175 0.29
176 0.24
177 0.2
178 0.22
179 0.24
180 0.18
181 0.15
182 0.24
183 0.25
184 0.26
185 0.29
186 0.28
187 0.26
188 0.27
189 0.26
190 0.19
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.18
197 0.22
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.32
202 0.4
203 0.46
204 0.53
205 0.57
206 0.64
207 0.68
208 0.74
209 0.67
210 0.64
211 0.6
212 0.52
213 0.45
214 0.42
215 0.4
216 0.33
217 0.3
218 0.26
219 0.21
220 0.2
221 0.17
222 0.15
223 0.12
224 0.13
225 0.15
226 0.18
227 0.18
228 0.17
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.27
233 0.26
234 0.31
235 0.35
236 0.35
237 0.39
238 0.43
239 0.47
240 0.51
241 0.6
242 0.63
243 0.67
244 0.76
245 0.72
246 0.72
247 0.69
248 0.62
249 0.58
250 0.49
251 0.41
252 0.32
253 0.28
254 0.21
255 0.19
256 0.16
257 0.1
258 0.11
259 0.14
260 0.2
261 0.3
262 0.39
263 0.45