Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QXR6

Protein Details
Accession C4QXR6    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
308-327KAKSNKRSQNSSSPNKKQKLHydrophilic
408-433LGAVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-224KEEKEGKKIEKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0031326  P:regulation of cellular biosynthetic process  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0693  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MSELINEAPKEQVLKYIKDYLDNIGFKNAAEAVEKQAKKEKLNLECAIEDGEYKLEQIVGNWNILVSNVSDMEIDDDSESSGNESDSESSGSSDSSDSSSSDSDSDSDSDSDSSSSSDSSSSSESESESEEEDDKEGKQEDTKDDKKEEKKEEIKESSSSSSSSSESSSSSSSDSSSASSSDTSSDSSESSSDSSDSDDEIKDEKVELLAEKKEEKEGKKIEKKDKVEEKSSEQSSPSESGSSDSSSDSTSDSESDSESSSSDSSSSSSSSSSSSSSESSSDSSSDSSSESSSESSDSESSNSDSDSKAKSNKRSQNSSSPNKKQKLHSSEPSESASDSSHTDSLSSDSKPKKEHIPAILENEEVKEGQRKHFSRIEREKISFEDGALTDNTYKGAAGTWGEKANEKLGAVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGSITLDSGSYKFSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.41
4 0.41
5 0.43
6 0.44
7 0.41
8 0.45
9 0.43
10 0.39
11 0.34
12 0.34
13 0.29
14 0.29
15 0.24
16 0.17
17 0.17
18 0.18
19 0.21
20 0.3
21 0.31
22 0.32
23 0.4
24 0.44
25 0.44
26 0.51
27 0.53
28 0.51
29 0.59
30 0.59
31 0.55
32 0.5
33 0.47
34 0.41
35 0.32
36 0.24
37 0.17
38 0.15
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.18
46 0.17
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.07
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.11
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.14
126 0.17
127 0.23
128 0.31
129 0.36
130 0.38
131 0.41
132 0.49
133 0.54
134 0.59
135 0.59
136 0.59
137 0.62
138 0.64
139 0.68
140 0.64
141 0.59
142 0.52
143 0.49
144 0.42
145 0.35
146 0.29
147 0.22
148 0.19
149 0.17
150 0.16
151 0.14
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.17
201 0.21
202 0.22
203 0.27
204 0.33
205 0.41
206 0.48
207 0.55
208 0.6
209 0.64
210 0.66
211 0.67
212 0.7
213 0.65
214 0.63
215 0.57
216 0.54
217 0.52
218 0.5
219 0.41
220 0.33
221 0.29
222 0.25
223 0.24
224 0.19
225 0.13
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.14
293 0.16
294 0.19
295 0.26
296 0.32
297 0.41
298 0.5
299 0.58
300 0.63
301 0.68
302 0.7
303 0.72
304 0.75
305 0.77
306 0.77
307 0.79
308 0.81
309 0.79
310 0.8
311 0.77
312 0.77
313 0.76
314 0.74
315 0.73
316 0.71
317 0.68
318 0.66
319 0.6
320 0.51
321 0.41
322 0.34
323 0.26
324 0.18
325 0.16
326 0.16
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.15
332 0.17
333 0.17
334 0.22
335 0.27
336 0.31
337 0.34
338 0.37
339 0.43
340 0.48
341 0.53
342 0.52
343 0.55
344 0.55
345 0.58
346 0.56
347 0.48
348 0.4
349 0.34
350 0.28
351 0.2
352 0.17
353 0.19
354 0.2
355 0.26
356 0.35
357 0.36
358 0.42
359 0.48
360 0.53
361 0.57
362 0.65
363 0.67
364 0.65
365 0.66
366 0.63
367 0.59
368 0.58
369 0.47
370 0.37
371 0.32
372 0.24
373 0.24
374 0.21
375 0.2
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.11
380 0.11
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.12
386 0.15
387 0.19
388 0.2
389 0.22
390 0.23
391 0.25
392 0.25
393 0.23
394 0.23
395 0.26
396 0.31
397 0.31
398 0.33
399 0.34
400 0.36
401 0.44
402 0.47
403 0.51
404 0.56
405 0.64
406 0.7
407 0.77
408 0.82
409 0.82
410 0.87
411 0.87
412 0.85
413 0.85
414 0.8
415 0.77
416 0.72
417 0.66
418 0.57
419 0.48
420 0.41
421 0.31
422 0.27
423 0.2
424 0.17