Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I3EFL4

Protein Details
Accession I3EFL4    Localization Confidence Low Confidence Score 5.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-104DGVAPRAKMNQQRERRFRPKDVSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18, cyto 6, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPSLFRWIAKRYPKSINAASGQEVDNLYLDLNGIIHPCCHPRNREPPGSEEEMFREIFKTVDHLVSIVRPKHLLYIAVDGVAPRAKMNQQRERRFRPKDVSDGHVEGGFDPNTITPGTPFMYRLHCAIIRYIEQRQSAGINGWKQLAVIYSGCDVPGEGEHKVYDFVRSIKGTGVRHAICGLDADLIFLSLATHEKSFKVLREDVFFLEKEERSTCKLCKKEGHSTGNCNPNTFPPYIYLDIDIIRRYLYTDFSTAINARFDFERILDDWIFVCFFVGNDFLPSIPSMDIKVAAIETITTSYINNLLTRRQYLTEDSKINIAELSVLMDTLGETEEKLLRAKLAGYVKNAKRRGEAPREEDLKVKLYEEKGRLEYYSSKMHANSPEDITNGCVEYLRGLSWILQYYYKGCPSWNWYYPLHFAPLAQDIADTLKKMPHLSFDFSKGAARKPLEQVMAVLPPSSASSIPEGLYPIFNEMPENYPDEVKIDMFGKTQAWQGVALLPFFDCDKLVSLVREHSRNLPLDEIYRNVEGCDLLFLPTANKNYATAETLYTNFTKTSNVKIMGKFYSGRATIHSSASMPGDSQRLIEEAKNYVVKSISVVFVPIKKQIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.65
3 0.69
4 0.69
5 0.67
6 0.62
7 0.57
8 0.53
9 0.47
10 0.41
11 0.36
12 0.3
13 0.24
14 0.19
15 0.16
16 0.14
17 0.1
18 0.1
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.1
25 0.12
26 0.18
27 0.24
28 0.31
29 0.38
30 0.46
31 0.56
32 0.64
33 0.71
34 0.68
35 0.67
36 0.68
37 0.66
38 0.58
39 0.49
40 0.44
41 0.38
42 0.35
43 0.3
44 0.24
45 0.17
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.15
54 0.2
55 0.27
56 0.26
57 0.25
58 0.25
59 0.25
60 0.3
61 0.31
62 0.28
63 0.23
64 0.26
65 0.24
66 0.24
67 0.23
68 0.18
69 0.19
70 0.18
71 0.16
72 0.1
73 0.13
74 0.19
75 0.27
76 0.37
77 0.45
78 0.54
79 0.65
80 0.74
81 0.81
82 0.86
83 0.86
84 0.84
85 0.84
86 0.8
87 0.79
88 0.73
89 0.68
90 0.64
91 0.57
92 0.5
93 0.41
94 0.35
95 0.26
96 0.25
97 0.2
98 0.14
99 0.12
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.07
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.15
110 0.2
111 0.21
112 0.21
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.25
117 0.26
118 0.25
119 0.28
120 0.32
121 0.32
122 0.31
123 0.31
124 0.29
125 0.26
126 0.23
127 0.23
128 0.23
129 0.2
130 0.21
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.15
136 0.13
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.07
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.14
156 0.17
157 0.18
158 0.18
159 0.2
160 0.25
161 0.24
162 0.26
163 0.31
164 0.27
165 0.27
166 0.27
167 0.24
168 0.18
169 0.18
170 0.15
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.12
186 0.15
187 0.17
188 0.22
189 0.24
190 0.25
191 0.28
192 0.3
193 0.28
194 0.28
195 0.25
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.22
203 0.25
204 0.28
205 0.32
206 0.36
207 0.39
208 0.44
209 0.49
210 0.55
211 0.6
212 0.65
213 0.6
214 0.64
215 0.66
216 0.67
217 0.6
218 0.51
219 0.42
220 0.37
221 0.37
222 0.3
223 0.24
224 0.18
225 0.22
226 0.23
227 0.22
228 0.19
229 0.16
230 0.17
231 0.18
232 0.15
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.18
302 0.23
303 0.25
304 0.25
305 0.24
306 0.25
307 0.23
308 0.22
309 0.17
310 0.12
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.04
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.12
332 0.17
333 0.18
334 0.22
335 0.31
336 0.35
337 0.43
338 0.47
339 0.43
340 0.4
341 0.42
342 0.48
343 0.48
344 0.5
345 0.47
346 0.51
347 0.53
348 0.52
349 0.49
350 0.42
351 0.36
352 0.3
353 0.26
354 0.21
355 0.21
356 0.26
357 0.26
358 0.28
359 0.26
360 0.27
361 0.26
362 0.25
363 0.26
364 0.23
365 0.26
366 0.24
367 0.23
368 0.23
369 0.27
370 0.29
371 0.29
372 0.28
373 0.25
374 0.25
375 0.24
376 0.23
377 0.2
378 0.16
379 0.13
380 0.11
381 0.08
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.09
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.14
395 0.17
396 0.18
397 0.17
398 0.15
399 0.17
400 0.23
401 0.3
402 0.32
403 0.33
404 0.32
405 0.35
406 0.38
407 0.37
408 0.32
409 0.25
410 0.2
411 0.19
412 0.2
413 0.17
414 0.14
415 0.12
416 0.1
417 0.13
418 0.13
419 0.12
420 0.1
421 0.11
422 0.13
423 0.15
424 0.15
425 0.19
426 0.21
427 0.26
428 0.27
429 0.3
430 0.31
431 0.29
432 0.33
433 0.28
434 0.28
435 0.29
436 0.29
437 0.28
438 0.31
439 0.35
440 0.32
441 0.31
442 0.29
443 0.25
444 0.25
445 0.21
446 0.17
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.08
453 0.1
454 0.11
455 0.12
456 0.12
457 0.13
458 0.12
459 0.13
460 0.12
461 0.14
462 0.13
463 0.12
464 0.13
465 0.13
466 0.16
467 0.16
468 0.19
469 0.17
470 0.17
471 0.17
472 0.17
473 0.17
474 0.14
475 0.14
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.15
486 0.15
487 0.18
488 0.18
489 0.16
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.12
494 0.12
495 0.07
496 0.07
497 0.1
498 0.12
499 0.14
500 0.15
501 0.17
502 0.24
503 0.29
504 0.31
505 0.3
506 0.34
507 0.38
508 0.39
509 0.39
510 0.35
511 0.31
512 0.32
513 0.33
514 0.29
515 0.27
516 0.25
517 0.23
518 0.2
519 0.2
520 0.16
521 0.14
522 0.14
523 0.11
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.13
528 0.18
529 0.2
530 0.19
531 0.2
532 0.19
533 0.22
534 0.23
535 0.24
536 0.2
537 0.2
538 0.21
539 0.21
540 0.23
541 0.21
542 0.2
543 0.18
544 0.17
545 0.21
546 0.21
547 0.27
548 0.32
549 0.36
550 0.41
551 0.43
552 0.48
553 0.44
554 0.46
555 0.4
556 0.35
557 0.37
558 0.33
559 0.31
560 0.29
561 0.34
562 0.33
563 0.33
564 0.32
565 0.25
566 0.26
567 0.27
568 0.24
569 0.17
570 0.17
571 0.18
572 0.17
573 0.17
574 0.16
575 0.16
576 0.18
577 0.2
578 0.2
579 0.2
580 0.25
581 0.28
582 0.27
583 0.28
584 0.27
585 0.24
586 0.24
587 0.24
588 0.2
589 0.16
590 0.19
591 0.2
592 0.23
593 0.26