Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QWW1

Protein Details
Accession C4QWW1    Localization Confidence Low Confidence Score 6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSKEEKTRRRRASSIGNINLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 10, E.R. 5, nucl 3, golg 3, cyto_mito 3, mito 2.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
GO:0007009  P:plasma membrane organization  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0358  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50922  TLC  
Amino Acid Sequences MSKEEKTRRRRASSIGNINLGDNAVPSLTTRKSNAQQRKSSSARINLINKKGSSDWGLVKKIGLSLVELSSRHTWLPFLVSLVAIHGSYLLSNNHTPSNPLHKFVDLSYKIEGTNPPMYGKGWKDFCFVFYFMIFFSFYREFLMQALLKPLASKLGITRESKVRRFMEQSYSMCYYGFSGPLGLYIMAGMPLWYFNTTEFYITYPHKSHEYLFKYYYLGQAAFWSQQAVVLMLQLEKPRKDFKELVIHHIITIALIYCSYRFHFTWMGLAVYITMDISDFFLALSKTLNYVDSAYTGPAFMFFVGVWFYLRHWLNVKILWSVLTEFRTVGPFELNWITQQYKCWISQPIVFSLIFALQLVNLYWFVLILRILYRHIFLDVTKDERSDDESEEEAQVEPSKKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.76
3 0.7
4 0.62
5 0.57
6 0.5
7 0.39
8 0.28
9 0.17
10 0.12
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.13
15 0.15
16 0.19
17 0.22
18 0.29
19 0.38
20 0.49
21 0.58
22 0.63
23 0.68
24 0.72
25 0.78
26 0.75
27 0.75
28 0.72
29 0.7
30 0.66
31 0.66
32 0.68
33 0.67
34 0.69
35 0.67
36 0.59
37 0.55
38 0.5
39 0.45
40 0.4
41 0.36
42 0.37
43 0.37
44 0.4
45 0.36
46 0.36
47 0.33
48 0.3
49 0.27
50 0.2
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.18
55 0.17
56 0.19
57 0.2
58 0.21
59 0.2
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.08
78 0.11
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.17
83 0.19
84 0.21
85 0.31
86 0.29
87 0.32
88 0.31
89 0.3
90 0.31
91 0.3
92 0.36
93 0.27
94 0.28
95 0.26
96 0.25
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.2
101 0.22
102 0.21
103 0.2
104 0.2
105 0.21
106 0.24
107 0.26
108 0.27
109 0.28
110 0.28
111 0.3
112 0.29
113 0.3
114 0.29
115 0.26
116 0.21
117 0.16
118 0.15
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.08
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.17
131 0.13
132 0.13
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.15
143 0.2
144 0.22
145 0.25
146 0.31
147 0.38
148 0.4
149 0.45
150 0.41
151 0.4
152 0.43
153 0.43
154 0.42
155 0.42
156 0.4
157 0.38
158 0.38
159 0.34
160 0.29
161 0.26
162 0.21
163 0.15
164 0.14
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.13
190 0.17
191 0.14
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.18
196 0.24
197 0.27
198 0.27
199 0.28
200 0.27
201 0.27
202 0.26
203 0.27
204 0.2
205 0.15
206 0.12
207 0.11
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.08
221 0.1
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.22
226 0.23
227 0.29
228 0.3
229 0.32
230 0.4
231 0.41
232 0.45
233 0.44
234 0.42
235 0.36
236 0.34
237 0.28
238 0.17
239 0.16
240 0.09
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.04
245 0.06
246 0.07
247 0.11
248 0.1
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.14
256 0.14
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.05
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.2
300 0.23
301 0.25
302 0.27
303 0.28
304 0.22
305 0.22
306 0.2
307 0.18
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.12
319 0.15
320 0.17
321 0.17
322 0.16
323 0.19
324 0.21
325 0.2
326 0.23
327 0.24
328 0.25
329 0.26
330 0.28
331 0.29
332 0.3
333 0.34
334 0.34
335 0.32
336 0.32
337 0.3
338 0.27
339 0.23
340 0.21
341 0.16
342 0.13
343 0.1
344 0.06
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.13
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.21
366 0.22
367 0.25
368 0.26
369 0.25
370 0.25
371 0.26
372 0.3
373 0.26
374 0.25
375 0.24
376 0.25
377 0.26
378 0.26
379 0.25
380 0.2
381 0.19
382 0.22
383 0.21