Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2H0V0

Protein Details
Accession I2H0V0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-411FGNHPDPATRHRRKRRIKRRKQYDSMIPDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-402RHRRKRRIKRRK
Subcellular Location(s) plas 11, nucl 6, mito 3, cyto_nucl 3, E.R. 3, golg 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019049  Nucleoporin_prot_Ndc1/Nup  
Gene Ontology GO:0031965  C:nuclear membrane  
GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG tbl:TBLA_0C01890  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09531  Ndc1_Nup  
Amino Acid Sequences MLEKPIPLSSAYCYNTIFTDVLRKRFNNLGTRLLLVLSILGSMVITLFSKTTSVWYEFLIKLPVRIISLYVCSLILIITRKNYIRIESYNGKNWNPIRSIYYEFISKRNIIYQVIYIIDNLLLTFVFKDLVSIKNLISGFHDNFLFWYYMAFLLPVAYNIMHNLIDIDYLKFDHQLTNEKPQQFIRKNLLDQVIIRSIKFLIVMMVFIEPLNQIVLRWVDYKSNRLSWKLIIIINAMVLVMSLILNSINLLFNSHMMMGCLYKNIPISNLSSTPMETLINGLQSEKKFTKLTAFQELSFRCNHADIKYRRPIYETRYKNGHIWNIILNECFKVLNESNDGVVKYMEMIEEKLSLKDAYDNSLMTLNRRSRFEDDGTEGKMLFGNHPDPATRHRRKRRIKRRKQYDSMIPDDMGKVSLNADDSQTYKLFKNEKFLRKQYSLMKKNRVQNYLRDQNSINGPILTRKLYVVEKLQDFVQELREFLSGLLYTDSSNHTLRNGRKSNMTIIEAWLLNKKRESDKLIPTYQINYHIILSLNGILNKAINEDPKGRIISTVGEILKIFERSIVKLGKFTEWEMGEEESTKIVHQIDNVFVIYELIIDSFLEIILNYNEILNDVYLDREVIRLGRWVLDMCN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.27
4 0.24
5 0.17
6 0.25
7 0.29
8 0.35
9 0.42
10 0.42
11 0.43
12 0.5
13 0.56
14 0.55
15 0.54
16 0.54
17 0.48
18 0.49
19 0.45
20 0.38
21 0.31
22 0.21
23 0.17
24 0.1
25 0.07
26 0.05
27 0.05
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.05
33 0.05
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.12
39 0.15
40 0.18
41 0.18
42 0.2
43 0.26
44 0.26
45 0.28
46 0.3
47 0.26
48 0.24
49 0.25
50 0.25
51 0.2
52 0.2
53 0.19
54 0.15
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.2
67 0.21
68 0.26
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.33
73 0.38
74 0.42
75 0.46
76 0.5
77 0.53
78 0.5
79 0.51
80 0.51
81 0.5
82 0.44
83 0.41
84 0.36
85 0.36
86 0.4
87 0.35
88 0.34
89 0.34
90 0.33
91 0.35
92 0.35
93 0.32
94 0.28
95 0.3
96 0.31
97 0.26
98 0.26
99 0.24
100 0.22
101 0.23
102 0.21
103 0.16
104 0.14
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.05
115 0.07
116 0.09
117 0.12
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.19
122 0.2
123 0.18
124 0.21
125 0.24
126 0.22
127 0.23
128 0.24
129 0.18
130 0.19
131 0.21
132 0.17
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.21
163 0.24
164 0.33
165 0.39
166 0.38
167 0.4
168 0.42
169 0.51
170 0.46
171 0.5
172 0.48
173 0.47
174 0.48
175 0.51
176 0.49
177 0.4
178 0.36
179 0.34
180 0.33
181 0.28
182 0.26
183 0.22
184 0.19
185 0.18
186 0.17
187 0.13
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.17
207 0.19
208 0.24
209 0.25
210 0.31
211 0.32
212 0.33
213 0.34
214 0.29
215 0.3
216 0.29
217 0.26
218 0.21
219 0.19
220 0.17
221 0.15
222 0.13
223 0.1
224 0.06
225 0.05
226 0.03
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.1
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.11
270 0.11
271 0.16
272 0.15
273 0.17
274 0.17
275 0.17
276 0.23
277 0.25
278 0.28
279 0.32
280 0.33
281 0.3
282 0.36
283 0.36
284 0.32
285 0.27
286 0.24
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.14
291 0.23
292 0.25
293 0.32
294 0.39
295 0.41
296 0.39
297 0.41
298 0.42
299 0.39
300 0.45
301 0.41
302 0.37
303 0.4
304 0.41
305 0.42
306 0.42
307 0.38
308 0.29
309 0.26
310 0.25
311 0.22
312 0.21
313 0.18
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.1
320 0.1
321 0.12
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.11
328 0.1
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.08
337 0.09
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.12
343 0.12
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.17
349 0.17
350 0.14
351 0.21
352 0.23
353 0.25
354 0.27
355 0.3
356 0.29
357 0.34
358 0.34
359 0.31
360 0.29
361 0.29
362 0.29
363 0.26
364 0.22
365 0.19
366 0.18
367 0.15
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.2
376 0.3
377 0.36
378 0.46
379 0.55
380 0.65
381 0.76
382 0.86
383 0.9
384 0.91
385 0.93
386 0.94
387 0.95
388 0.95
389 0.92
390 0.88
391 0.86
392 0.81
393 0.75
394 0.66
395 0.54
396 0.44
397 0.37
398 0.29
399 0.2
400 0.13
401 0.09
402 0.07
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.14
413 0.19
414 0.25
415 0.25
416 0.34
417 0.41
418 0.5
419 0.56
420 0.61
421 0.64
422 0.59
423 0.64
424 0.63
425 0.65
426 0.65
427 0.65
428 0.69
429 0.68
430 0.74
431 0.76
432 0.74
433 0.65
434 0.65
435 0.66
436 0.66
437 0.61
438 0.55
439 0.49
440 0.45
441 0.46
442 0.4
443 0.3
444 0.21
445 0.2
446 0.21
447 0.22
448 0.2
449 0.16
450 0.14
451 0.17
452 0.18
453 0.21
454 0.23
455 0.27
456 0.26
457 0.26
458 0.26
459 0.24
460 0.24
461 0.22
462 0.23
463 0.18
464 0.17
465 0.18
466 0.17
467 0.16
468 0.15
469 0.16
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.13
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.16
481 0.23
482 0.29
483 0.38
484 0.41
485 0.41
486 0.46
487 0.48
488 0.52
489 0.49
490 0.46
491 0.37
492 0.33
493 0.34
494 0.29
495 0.27
496 0.27
497 0.25
498 0.25
499 0.27
500 0.3
501 0.32
502 0.38
503 0.45
504 0.46
505 0.53
506 0.58
507 0.58
508 0.57
509 0.53
510 0.51
511 0.45
512 0.43
513 0.35
514 0.28
515 0.25
516 0.24
517 0.23
518 0.19
519 0.18
520 0.16
521 0.16
522 0.16
523 0.15
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.15
528 0.15
529 0.15
530 0.18
531 0.22
532 0.24
533 0.28
534 0.3
535 0.27
536 0.26
537 0.24
538 0.23
539 0.21
540 0.25
541 0.2
542 0.2
543 0.19
544 0.2
545 0.22
546 0.2
547 0.18
548 0.16
549 0.18
550 0.19
551 0.26
552 0.3
553 0.28
554 0.3
555 0.33
556 0.33
557 0.33
558 0.32
559 0.33
560 0.28
561 0.29
562 0.27
563 0.27
564 0.23
565 0.22
566 0.21
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.13
573 0.15
574 0.18
575 0.19
576 0.21
577 0.21
578 0.19
579 0.17
580 0.17
581 0.13
582 0.1
583 0.08
584 0.06
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.07
593 0.07
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.1
600 0.08
601 0.09
602 0.09
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.1
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.12
611 0.15
612 0.17
613 0.18
614 0.2