Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2H6D4

Protein Details
Accession I2H6D4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-407EAFAKQDQKMKEKRERRMRNKQKVRMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-375R
384-407AKQDQKMKEKRERRMRNKQKVRMG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.333, cyto 4, cyto_mito 3.333, pero 3, mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG tbl:TBLA_0F04030  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MSMIIQPLANLLQKFDDMNLHYYSTPYEELKAMSTFERIQLYNWTFEMGIACLLMFIYFIHWGGNRINVTRANRLFNSLQDFFSKDLQFSKVGFIENEKPKSYHSENQNTWFTTFATGRSTIESVTVKAHMYARSNPVSLIMESILGWFFSSLVVKDLDEFVEIVIKPNGIYVANENSTINNSSKDILKNYKFVTSVVNKTYMNTSRRDYYFLSCTHVTDNEILPVDYVFMSDVNQLNSFIPTYSKKSFITETLTNAVDLLQFVSFTDLPTGHPNSDKKFTADSISRAIIRTNIPKSKKDVETLQQVISAVIEIYDNCTRELTQNGSSALITPEILKKTNNFRSQELAKIVKEMKKIEMEDLKEKKLEAERELRRANKDSEAFAKQDQKMKEKRERRMRNKQKVRMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.22
4 0.2
5 0.24
6 0.24
7 0.25
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.21
12 0.22
13 0.19
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.22
18 0.21
19 0.19
20 0.18
21 0.2
22 0.19
23 0.21
24 0.25
25 0.22
26 0.22
27 0.3
28 0.31
29 0.31
30 0.29
31 0.27
32 0.23
33 0.23
34 0.23
35 0.14
36 0.12
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.05
43 0.04
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.09
48 0.09
49 0.12
50 0.13
51 0.19
52 0.19
53 0.2
54 0.24
55 0.28
56 0.32
57 0.39
58 0.41
59 0.41
60 0.4
61 0.44
62 0.41
63 0.39
64 0.42
65 0.35
66 0.33
67 0.29
68 0.3
69 0.27
70 0.31
71 0.28
72 0.22
73 0.22
74 0.24
75 0.24
76 0.22
77 0.24
78 0.2
79 0.2
80 0.2
81 0.22
82 0.29
83 0.35
84 0.38
85 0.36
86 0.35
87 0.35
88 0.42
89 0.43
90 0.41
91 0.43
92 0.49
93 0.51
94 0.57
95 0.6
96 0.54
97 0.48
98 0.42
99 0.33
100 0.27
101 0.24
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.14
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.17
118 0.19
119 0.22
120 0.26
121 0.28
122 0.28
123 0.26
124 0.25
125 0.24
126 0.21
127 0.17
128 0.12
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.08
133 0.06
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.13
166 0.15
167 0.13
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.14
172 0.16
173 0.18
174 0.23
175 0.25
176 0.28
177 0.28
178 0.3
179 0.27
180 0.26
181 0.28
182 0.25
183 0.27
184 0.24
185 0.26
186 0.23
187 0.23
188 0.27
189 0.28
190 0.26
191 0.24
192 0.25
193 0.27
194 0.28
195 0.3
196 0.28
197 0.25
198 0.27
199 0.25
200 0.27
201 0.23
202 0.23
203 0.21
204 0.19
205 0.17
206 0.15
207 0.15
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.08
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.08
228 0.1
229 0.11
230 0.17
231 0.18
232 0.21
233 0.21
234 0.23
235 0.25
236 0.25
237 0.28
238 0.24
239 0.25
240 0.25
241 0.24
242 0.22
243 0.2
244 0.18
245 0.12
246 0.1
247 0.08
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.15
258 0.17
259 0.15
260 0.21
261 0.24
262 0.27
263 0.32
264 0.32
265 0.29
266 0.29
267 0.29
268 0.3
269 0.3
270 0.28
271 0.26
272 0.27
273 0.26
274 0.24
275 0.23
276 0.21
277 0.21
278 0.27
279 0.31
280 0.37
281 0.4
282 0.43
283 0.49
284 0.54
285 0.53
286 0.5
287 0.49
288 0.47
289 0.52
290 0.51
291 0.45
292 0.38
293 0.35
294 0.31
295 0.24
296 0.18
297 0.09
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.09
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.2
309 0.2
310 0.21
311 0.23
312 0.23
313 0.23
314 0.23
315 0.22
316 0.19
317 0.15
318 0.12
319 0.11
320 0.15
321 0.17
322 0.19
323 0.19
324 0.23
325 0.33
326 0.42
327 0.48
328 0.47
329 0.47
330 0.53
331 0.55
332 0.56
333 0.52
334 0.48
335 0.4
336 0.43
337 0.46
338 0.44
339 0.45
340 0.41
341 0.4
342 0.41
343 0.42
344 0.43
345 0.44
346 0.44
347 0.49
348 0.52
349 0.5
350 0.45
351 0.44
352 0.42
353 0.43
354 0.43
355 0.4
356 0.45
357 0.49
358 0.56
359 0.64
360 0.63
361 0.62
362 0.63
363 0.6
364 0.59
365 0.55
366 0.51
367 0.5
368 0.49
369 0.45
370 0.46
371 0.51
372 0.47
373 0.51
374 0.52
375 0.55
376 0.59
377 0.66
378 0.71
379 0.72
380 0.78
381 0.82
382 0.88
383 0.89
384 0.92
385 0.93
386 0.94
387 0.95