Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I2GVM1

Protein Details
Accession I2GVM1    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-70EACSNKLDSKLPKKTTKRTTRHSTTKLRKLKKKRNGSGPWASWSHydrophilic
351-376AIYTFNMKPKYRRHPKKIFKGHSSAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-61LPKKTTKRTTRHSTTKLRKLKKKRN
361-367YRRHPKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7.5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG tbl:TBLA_0A03750  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MPLVEGYSSSSESEHEDKNIITSEVHEACSNKLDSKLPKKTTKRTTRHSTTKLRKLKKKRNGSGPWASWSDENDSNSDSNLDLKDDNELELMDNEEFTSKIVETSNFYGQSTKDYQGRSFLYPPIDTDIDFQKPKLSFKCFIPKTIKYKFKGHENGTTALSFFPKSGHMFLSGGNDNTLRLWDVYHERKCLRDYLGHTRALKSFSFNDDGSKFLSSSYDQTVKMWDTETGKIITKLKLHSIPNDLTFRPLNPDEYIVGLSNSTIKHFDNRVSSKQGLVQTYDHHLSSILKLQYFPDGSKFISSSEDKTVKIWENQINVPIKHISDTSQYSMPFINIHPENNYFCTQSMDNAIYTFNMKPKYRRHPKKIFKGHSSAGYAIGLTFSPDGKYICSGDIHSNVFIWDWKTNKLLKKITIPGNKPITQISWHPQETSKVLCSGNKGTIYMLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.23
4 0.23
5 0.25
6 0.26
7 0.22
8 0.18
9 0.17
10 0.23
11 0.23
12 0.24
13 0.24
14 0.23
15 0.24
16 0.29
17 0.29
18 0.24
19 0.25
20 0.31
21 0.38
22 0.48
23 0.56
24 0.59
25 0.67
26 0.74
27 0.81
28 0.86
29 0.87
30 0.86
31 0.86
32 0.88
33 0.88
34 0.89
35 0.88
36 0.89
37 0.88
38 0.89
39 0.89
40 0.89
41 0.89
42 0.9
43 0.92
44 0.91
45 0.92
46 0.91
47 0.91
48 0.9
49 0.89
50 0.88
51 0.81
52 0.76
53 0.66
54 0.58
55 0.49
56 0.41
57 0.38
58 0.32
59 0.3
60 0.26
61 0.26
62 0.25
63 0.23
64 0.22
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.14
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.14
91 0.18
92 0.23
93 0.22
94 0.22
95 0.23
96 0.21
97 0.26
98 0.26
99 0.25
100 0.25
101 0.26
102 0.27
103 0.31
104 0.34
105 0.32
106 0.3
107 0.3
108 0.29
109 0.28
110 0.28
111 0.27
112 0.24
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.23
117 0.23
118 0.22
119 0.23
120 0.24
121 0.29
122 0.32
123 0.34
124 0.33
125 0.38
126 0.49
127 0.44
128 0.5
129 0.53
130 0.54
131 0.57
132 0.63
133 0.65
134 0.59
135 0.66
136 0.63
137 0.65
138 0.67
139 0.63
140 0.61
141 0.57
142 0.55
143 0.48
144 0.43
145 0.33
146 0.25
147 0.22
148 0.14
149 0.11
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.15
158 0.19
159 0.18
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.15
171 0.23
172 0.26
173 0.3
174 0.3
175 0.32
176 0.34
177 0.34
178 0.3
179 0.27
180 0.3
181 0.36
182 0.4
183 0.42
184 0.41
185 0.4
186 0.39
187 0.36
188 0.31
189 0.24
190 0.21
191 0.19
192 0.22
193 0.2
194 0.21
195 0.19
196 0.2
197 0.18
198 0.17
199 0.14
200 0.1
201 0.12
202 0.09
203 0.11
204 0.13
205 0.15
206 0.15
207 0.15
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.18
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.26
225 0.26
226 0.27
227 0.3
228 0.29
229 0.3
230 0.32
231 0.28
232 0.25
233 0.24
234 0.21
235 0.21
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.17
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.11
244 0.1
245 0.08
246 0.07
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.13
253 0.15
254 0.18
255 0.24
256 0.29
257 0.32
258 0.36
259 0.36
260 0.33
261 0.36
262 0.36
263 0.29
264 0.27
265 0.24
266 0.21
267 0.25
268 0.25
269 0.2
270 0.17
271 0.16
272 0.15
273 0.15
274 0.2
275 0.17
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.21
280 0.21
281 0.2
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.14
288 0.17
289 0.18
290 0.18
291 0.24
292 0.26
293 0.25
294 0.25
295 0.29
296 0.28
297 0.3
298 0.33
299 0.3
300 0.32
301 0.33
302 0.38
303 0.39
304 0.35
305 0.35
306 0.3
307 0.26
308 0.23
309 0.22
310 0.18
311 0.18
312 0.21
313 0.22
314 0.23
315 0.23
316 0.23
317 0.23
318 0.21
319 0.17
320 0.15
321 0.19
322 0.17
323 0.19
324 0.21
325 0.23
326 0.25
327 0.28
328 0.29
329 0.22
330 0.21
331 0.24
332 0.21
333 0.2
334 0.21
335 0.19
336 0.17
337 0.17
338 0.17
339 0.13
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.22
344 0.25
345 0.32
346 0.41
347 0.52
348 0.61
349 0.7
350 0.76
351 0.8
352 0.88
353 0.92
354 0.94
355 0.92
356 0.89
357 0.85
358 0.79
359 0.73
360 0.66
361 0.56
362 0.46
363 0.37
364 0.29
365 0.21
366 0.18
367 0.11
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.16
379 0.18
380 0.22
381 0.26
382 0.26
383 0.24
384 0.23
385 0.22
386 0.21
387 0.21
388 0.19
389 0.2
390 0.2
391 0.22
392 0.28
393 0.34
394 0.41
395 0.47
396 0.51
397 0.52
398 0.58
399 0.64
400 0.69
401 0.72
402 0.68
403 0.69
404 0.7
405 0.67
406 0.6
407 0.54
408 0.47
409 0.41
410 0.43
411 0.41
412 0.42
413 0.41
414 0.42
415 0.42
416 0.44
417 0.44
418 0.43
419 0.39
420 0.34
421 0.35
422 0.35
423 0.38
424 0.38
425 0.41
426 0.37
427 0.35