Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EK01

Protein Details
Accession A0A178EK01    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
244-264IAHNPDPKKWPQRRHDIMNFVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 8, nucl 6.5, cyto_nucl 6, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037381  RFWD3  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MDRAFETQFHAAETCIVCTDAFNATHQPVALPCNHIFGYECIKKWIKDGRGNTNACPTCRHAIVNVPRPPHAFSAPSLWALVCELPPERLEMLMLNLWTGIQELWQQKPDGVFSVKELLSRVVLKGLETTGQAQWTPSDDQDTILDCYNFVISTWSSLGRPDSPSGLAIPFVRLARLMSSASSTLPKWLTKNAHTNLLIWKANACLGLTETTIDWRHVMEAAYLEDPQYFPLLQLYTLLVSRSIAHNPDPKKWPQRRHDIMNFVVERCCVKVGSIFSGGRPSNHFKELLVVVYEELRRYQHEKGCQAFKGSQDEEDVVSGLWALAKWDVRQGRLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.15
3 0.16
4 0.14
5 0.14
6 0.15
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.18
11 0.19
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.16
16 0.19
17 0.2
18 0.21
19 0.21
20 0.24
21 0.24
22 0.23
23 0.24
24 0.23
25 0.3
26 0.3
27 0.3
28 0.32
29 0.36
30 0.36
31 0.41
32 0.47
33 0.46
34 0.5
35 0.56
36 0.6
37 0.66
38 0.68
39 0.64
40 0.65
41 0.6
42 0.52
43 0.49
44 0.43
45 0.38
46 0.38
47 0.36
48 0.28
49 0.34
50 0.42
51 0.48
52 0.48
53 0.46
54 0.47
55 0.48
56 0.49
57 0.42
58 0.36
59 0.28
60 0.24
61 0.28
62 0.27
63 0.26
64 0.23
65 0.19
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.05
88 0.04
89 0.1
90 0.14
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.2
96 0.2
97 0.18
98 0.17
99 0.15
100 0.14
101 0.19
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.15
106 0.15
107 0.16
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.1
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.13
129 0.15
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.07
139 0.05
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.19
176 0.23
177 0.26
178 0.35
179 0.34
180 0.39
181 0.38
182 0.38
183 0.36
184 0.37
185 0.33
186 0.24
187 0.23
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.12
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.08
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.07
217 0.06
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.12
231 0.13
232 0.17
233 0.24
234 0.27
235 0.33
236 0.38
237 0.44
238 0.53
239 0.6
240 0.65
241 0.67
242 0.75
243 0.76
244 0.8
245 0.8
246 0.76
247 0.7
248 0.69
249 0.62
250 0.52
251 0.45
252 0.36
253 0.29
254 0.23
255 0.22
256 0.13
257 0.12
258 0.15
259 0.17
260 0.2
261 0.25
262 0.24
263 0.23
264 0.31
265 0.31
266 0.28
267 0.31
268 0.34
269 0.33
270 0.36
271 0.35
272 0.28
273 0.32
274 0.32
275 0.28
276 0.22
277 0.18
278 0.16
279 0.19
280 0.2
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.19
285 0.23
286 0.3
287 0.33
288 0.41
289 0.47
290 0.53
291 0.58
292 0.56
293 0.57
294 0.53
295 0.5
296 0.5
297 0.44
298 0.39
299 0.35
300 0.34
301 0.3
302 0.27
303 0.23
304 0.14
305 0.13
306 0.11
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.1
312 0.13
313 0.14
314 0.22
315 0.26