Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EDP0

Protein Details
Accession A0A178EDP0    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22SSMRNAVQRRNHKERAQPLERHydrophilic
28-62LEKRKDYKLRAADHREKKTKLKLLSQKARDRNPDEBasic
207-231QEAARKEERKFKKDRERAQSRTAIKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-51RAQPLERQKWGLLEKRKDYKLRAADHREKKTKLKLL
210-238ARKEERKFKKDRERAQSRTAIKLESVKKR
269-277KFKIRERKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVQRRNHKERAQPLERQKWGLLEKRKDYKLRAADHREKKTKLKLLSQKARDRNPDEFSFKMMSSKVDARGKKVADRGNKALSAEVVKLLKTQDAGYIRTMLQMARKEREELEERLILETKGRVRALRDGDGAKNGKHRVFVENEDEQQDFDPEAWFGQGKEMPGRAGSEQVEDSQEDLSEEEDEAPQPQLKTLSKKALEAQEAARKEERKFKKDRERAQSRTAIKLESVKKRERELTAAEAELDLQRAKMNNTVGGVNKHGVKFKIRERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.81
3 0.82
4 0.78
5 0.78
6 0.79
7 0.8
8 0.77
9 0.71
10 0.63
11 0.59
12 0.59
13 0.58
14 0.58
15 0.57
16 0.62
17 0.67
18 0.73
19 0.72
20 0.7
21 0.71
22 0.69
23 0.69
24 0.7
25 0.71
26 0.74
27 0.78
28 0.83
29 0.82
30 0.78
31 0.78
32 0.78
33 0.75
34 0.71
35 0.71
36 0.71
37 0.73
38 0.79
39 0.8
40 0.79
41 0.8
42 0.82
43 0.8
44 0.76
45 0.71
46 0.67
47 0.63
48 0.59
49 0.51
50 0.47
51 0.4
52 0.35
53 0.31
54 0.25
55 0.21
56 0.2
57 0.23
58 0.27
59 0.32
60 0.33
61 0.35
62 0.41
63 0.42
64 0.42
65 0.45
66 0.44
67 0.45
68 0.5
69 0.5
70 0.48
71 0.47
72 0.43
73 0.37
74 0.32
75 0.25
76 0.19
77 0.17
78 0.14
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.11
85 0.13
86 0.15
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.13
94 0.15
95 0.19
96 0.22
97 0.23
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.3
102 0.3
103 0.26
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.24
108 0.24
109 0.19
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.16
117 0.22
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.23
122 0.23
123 0.27
124 0.27
125 0.21
126 0.23
127 0.23
128 0.21
129 0.22
130 0.23
131 0.21
132 0.23
133 0.25
134 0.25
135 0.25
136 0.25
137 0.25
138 0.23
139 0.2
140 0.18
141 0.15
142 0.1
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.11
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.15
183 0.18
184 0.24
185 0.29
186 0.36
187 0.35
188 0.37
189 0.41
190 0.43
191 0.42
192 0.37
193 0.37
194 0.36
195 0.36
196 0.37
197 0.37
198 0.34
199 0.35
200 0.43
201 0.47
202 0.47
203 0.55
204 0.62
205 0.68
206 0.75
207 0.82
208 0.83
209 0.84
210 0.83
211 0.82
212 0.8
213 0.72
214 0.7
215 0.62
216 0.52
217 0.44
218 0.46
219 0.47
220 0.48
221 0.52
222 0.52
223 0.55
224 0.59
225 0.64
226 0.6
227 0.57
228 0.52
229 0.51
230 0.46
231 0.42
232 0.36
233 0.29
234 0.26
235 0.21
236 0.18
237 0.12
238 0.09
239 0.11
240 0.13
241 0.15
242 0.18
243 0.2
244 0.21
245 0.23
246 0.26
247 0.27
248 0.29
249 0.31
250 0.29
251 0.32
252 0.32
253 0.35
254 0.34
255 0.38
256 0.42
257 0.49