Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DTV2

Protein Details
Accession A0A178DTV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-86KNVDALRRKRIKRLGVKHKGAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-84RRKRIKRLGVKHKG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MAGPSDKARFYLEHSATELNELERKKIFSREEISSIAKKRSDFEHIINARGSHPSDYMRYIEFEKNVDALRRKRIKRLGVKHKGAGQRTIYLLYNRATRKFSGDLALWMQYIDFARKDKAYKRLNDIFTSVARLHPTKPDIWVLAAHYFMDTQADITNARSYMQRGLRFCKNSEYLWLEYAKLETIYVGKIAGRRKILGLDIDRTKQQTEEDEDMLALPQVTAEDVNPSLNQDDGVDELALQNLAQAPVLTGAIPLAVFDSGMKQFQGKPSLAVKFFDMFTEFDQLPCIPRILQHVLDYLENNSPSVVETAICRFRVQLFGRNPTDPEFPSALGNALDLISSAIQQYPSEGGRVSEVAVRQLLSLSRLFADADPALQKVLRVALRKYVRTLEDGQGSGDKVASLVRALQEEGKREDAVALVRLSIKYWAANAELQRAYAALDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.34
4 0.35
5 0.3
6 0.22
7 0.25
8 0.23
9 0.24
10 0.25
11 0.29
12 0.3
13 0.36
14 0.38
15 0.41
16 0.46
17 0.47
18 0.48
19 0.48
20 0.5
21 0.5
22 0.5
23 0.48
24 0.46
25 0.41
26 0.41
27 0.41
28 0.44
29 0.42
30 0.41
31 0.46
32 0.44
33 0.47
34 0.45
35 0.42
36 0.35
37 0.34
38 0.31
39 0.23
40 0.23
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.27
45 0.24
46 0.25
47 0.27
48 0.3
49 0.28
50 0.27
51 0.25
52 0.26
53 0.26
54 0.31
55 0.34
56 0.34
57 0.43
58 0.52
59 0.54
60 0.61
61 0.68
62 0.71
63 0.74
64 0.8
65 0.81
66 0.81
67 0.84
68 0.79
69 0.78
70 0.75
71 0.68
72 0.63
73 0.55
74 0.47
75 0.43
76 0.41
77 0.35
78 0.29
79 0.3
80 0.25
81 0.3
82 0.29
83 0.32
84 0.32
85 0.3
86 0.34
87 0.33
88 0.32
89 0.29
90 0.26
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.2
95 0.17
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.18
104 0.24
105 0.28
106 0.37
107 0.43
108 0.46
109 0.53
110 0.59
111 0.6
112 0.57
113 0.53
114 0.45
115 0.38
116 0.36
117 0.28
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.23
123 0.25
124 0.22
125 0.24
126 0.25
127 0.23
128 0.22
129 0.22
130 0.19
131 0.17
132 0.16
133 0.14
134 0.11
135 0.11
136 0.09
137 0.09
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.18
150 0.23
151 0.27
152 0.28
153 0.34
154 0.4
155 0.42
156 0.42
157 0.41
158 0.38
159 0.34
160 0.36
161 0.35
162 0.29
163 0.28
164 0.27
165 0.21
166 0.19
167 0.19
168 0.14
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.1
178 0.14
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.2
187 0.21
188 0.22
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.22
193 0.18
194 0.17
195 0.15
196 0.17
197 0.19
198 0.18
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.15
203 0.12
204 0.07
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.1
253 0.14
254 0.19
255 0.17
256 0.19
257 0.23
258 0.28
259 0.27
260 0.27
261 0.24
262 0.21
263 0.21
264 0.19
265 0.16
266 0.12
267 0.12
268 0.16
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.13
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.09
277 0.11
278 0.17
279 0.19
280 0.21
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.23
285 0.22
286 0.18
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.09
295 0.06
296 0.07
297 0.12
298 0.16
299 0.17
300 0.16
301 0.17
302 0.18
303 0.26
304 0.27
305 0.31
306 0.33
307 0.41
308 0.44
309 0.45
310 0.45
311 0.4
312 0.41
313 0.33
314 0.32
315 0.25
316 0.22
317 0.22
318 0.21
319 0.18
320 0.14
321 0.13
322 0.09
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.15
358 0.13
359 0.14
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.13
365 0.11
366 0.17
367 0.19
368 0.22
369 0.23
370 0.32
371 0.39
372 0.41
373 0.44
374 0.44
375 0.42
376 0.43
377 0.46
378 0.42
379 0.4
380 0.38
381 0.36
382 0.32
383 0.31
384 0.26
385 0.21
386 0.15
387 0.1
388 0.11
389 0.1
390 0.08
391 0.1
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.21
396 0.24
397 0.29
398 0.32
399 0.33
400 0.31
401 0.3
402 0.29
403 0.24
404 0.23
405 0.22
406 0.18
407 0.16
408 0.19
409 0.19
410 0.19
411 0.19
412 0.18
413 0.16
414 0.17
415 0.18
416 0.18
417 0.23
418 0.24
419 0.29
420 0.28
421 0.27
422 0.26
423 0.24