Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E0Q6

Protein Details
Accession A0A178E0Q6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-55ANPIPAPKKRKAKATPTSPPSQTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-45PAPKKRKAK
84-86KRR
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 13.5, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSLRRSTRVASTKALENDKAQVPNNIAKYEKAANPIPAPKKRKAKATPTSPPSQTTQDESSSKILPTPDLPFAVPVLPATPVRKRRKAASESPVKPPPFTPTPSGVGLITSSVGPGDHMLDNLGSSKPRPAEPHATNAPLSTPGGSRVVAYQSSPAQGSQEEGPSSQQSPVKKRKAKEVVPPDVGAIPAASTDIDHLLEEAEAFLISVDPKFKVLVEKHHCKVFNPEGLREVVDPFTALSSGIIGQQVSGQAAASIRKKFTALFPETHPAFPSPAQVIAKDLPTLRTAGLSQRKAEYISGLAEKFSNGELTAQMLVNASDEELIEKLVAVRGLGRWSVEMFACFGLKRMDVFSTGDLGVQRGMATYMGRDTNKLKAKGGKWKYMSESEMLDIASRFSPYRSLFMWYMWRIEDVDLSVMQTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.51
3 0.45
4 0.47
5 0.46
6 0.47
7 0.41
8 0.38
9 0.38
10 0.42
11 0.44
12 0.4
13 0.36
14 0.32
15 0.35
16 0.37
17 0.36
18 0.35
19 0.35
20 0.37
21 0.41
22 0.49
23 0.54
24 0.57
25 0.6
26 0.64
27 0.7
28 0.71
29 0.76
30 0.77
31 0.78
32 0.79
33 0.83
34 0.84
35 0.8
36 0.83
37 0.74
38 0.68
39 0.61
40 0.57
41 0.49
42 0.44
43 0.41
44 0.38
45 0.37
46 0.37
47 0.36
48 0.32
49 0.3
50 0.27
51 0.24
52 0.21
53 0.23
54 0.24
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.21
59 0.21
60 0.2
61 0.16
62 0.12
63 0.1
64 0.11
65 0.13
66 0.17
67 0.24
68 0.34
69 0.43
70 0.51
71 0.54
72 0.61
73 0.68
74 0.72
75 0.73
76 0.73
77 0.75
78 0.7
79 0.75
80 0.74
81 0.65
82 0.58
83 0.49
84 0.46
85 0.4
86 0.4
87 0.37
88 0.33
89 0.36
90 0.36
91 0.35
92 0.28
93 0.23
94 0.2
95 0.15
96 0.11
97 0.08
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.09
113 0.13
114 0.14
115 0.17
116 0.21
117 0.26
118 0.34
119 0.36
120 0.43
121 0.42
122 0.42
123 0.4
124 0.36
125 0.3
126 0.22
127 0.2
128 0.14
129 0.11
130 0.1
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.12
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.17
155 0.2
156 0.29
157 0.38
158 0.47
159 0.51
160 0.52
161 0.59
162 0.66
163 0.67
164 0.68
165 0.68
166 0.65
167 0.62
168 0.6
169 0.5
170 0.41
171 0.35
172 0.25
173 0.15
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.12
201 0.13
202 0.23
203 0.3
204 0.37
205 0.39
206 0.43
207 0.43
208 0.38
209 0.44
210 0.4
211 0.38
212 0.33
213 0.32
214 0.29
215 0.29
216 0.29
217 0.22
218 0.18
219 0.12
220 0.1
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.09
241 0.13
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.2
248 0.26
249 0.25
250 0.26
251 0.28
252 0.35
253 0.35
254 0.35
255 0.32
256 0.24
257 0.22
258 0.2
259 0.2
260 0.14
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.18
265 0.17
266 0.18
267 0.17
268 0.16
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.18
276 0.26
277 0.27
278 0.28
279 0.29
280 0.3
281 0.3
282 0.3
283 0.23
284 0.16
285 0.16
286 0.17
287 0.15
288 0.15
289 0.14
290 0.14
291 0.13
292 0.12
293 0.1
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.08
318 0.09
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.17
339 0.16
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.15
345 0.13
346 0.12
347 0.1
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.12
354 0.17
355 0.17
356 0.2
357 0.22
358 0.3
359 0.39
360 0.4
361 0.42
362 0.45
363 0.52
364 0.59
365 0.65
366 0.65
367 0.61
368 0.65
369 0.65
370 0.63
371 0.59
372 0.5
373 0.44
374 0.36
375 0.33
376 0.27
377 0.22
378 0.17
379 0.16
380 0.15
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.2
385 0.2
386 0.24
387 0.24
388 0.29
389 0.28
390 0.31
391 0.39
392 0.34
393 0.35
394 0.32
395 0.32
396 0.28
397 0.27
398 0.26
399 0.18
400 0.19
401 0.16