Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EG26

Protein Details
Accession A0A178EG26    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-119LYQARQRPTQQRPPVPHASKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 5, mito 4, pero 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTSGPRDVAHSRNAPGFGQHDAFAGLGGGASDDDAIDFEETYDGLGNQLDDADDVLNDDTFGSGPATQQSIGRDFDFAGQTSKVANTLQEEQMLYQARQRPTQQRPPVPHASKPNRTGYESYQDPEYIPQLEARADIWGLKPKQPSAQKYPERQPSPAAQQPQPARKLMSLDEVEAMMRSQSIGTPPAHQVPHQGLPPQLHHQQFPQGQIPFPGMPAGGPGQFAPQILQRPQQPQQQQQGTPRQQQIRAELPGQSVQNQPPQHPTILQRQRPQQNESSPQQPLQQRQTPQQAQVQAQAQGPPSQPRQILQNPNRLAGQGQPISQPGPQAHRGQAPGHNRGPSFPGMVITHPEQLLQLSEAERAAFLEEDAKRAKRNHKIALLAKDNGLMTPQDKNFITRIQLQQLMTATGNLDEKGPEAAIAEDFYYQVFSQIRGAPRQNPQQPASQFAQTYLFQTNNRFGARRQGRGGDNHMQRMEQQIQRAVEAAKARPKAKQLVVEGSLGKIAFSNSKTPRPLLNLKRPETSDKHPKHHKSSIADRKEALRNIENIYFILMQMEDHERALPPPIHENSSPEAIQAHMEWRSKIETLHKQLWQATKIMEPINPHGTTAHPFISILAHAKGKKAIPRLFRHIDEQERITVVTMIVVHLDQLAVVGHAIATPEEPLSAAIREEVELFSQTVTPPLFAHISESPLNIIIGLLGLLLDRTNLHVVTRSKIGLTLLTILISRAELLKQAAPEMSPDWEQWTELYNRLFDTIEPVLPVIFPGSINDTDDMYIWQFLAAMGVGASPEQQQRLVIGVKDRVMETVSVSKALPADMASARLANVNLFMRAIGLDVELLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.34
4 0.35
5 0.39
6 0.41
7 0.38
8 0.37
9 0.34
10 0.31
11 0.28
12 0.25
13 0.21
14 0.2
15 0.19
16 0.15
17 0.13
18 0.08
19 0.06
20 0.05
21 0.05
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.04
26 0.04
27 0.05
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.09
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.09
58 0.11
59 0.13
60 0.13
61 0.15
62 0.18
63 0.2
64 0.23
65 0.22
66 0.21
67 0.2
68 0.24
69 0.24
70 0.21
71 0.2
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.21
81 0.22
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.27
86 0.28
87 0.24
88 0.25
89 0.31
90 0.32
91 0.37
92 0.44
93 0.49
94 0.55
95 0.66
96 0.69
97 0.71
98 0.76
99 0.78
100 0.82
101 0.76
102 0.74
103 0.74
104 0.74
105 0.74
106 0.72
107 0.73
108 0.67
109 0.66
110 0.64
111 0.58
112 0.56
113 0.5
114 0.45
115 0.38
116 0.34
117 0.31
118 0.29
119 0.26
120 0.19
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.21
132 0.23
133 0.28
134 0.31
135 0.32
136 0.4
137 0.47
138 0.52
139 0.52
140 0.61
141 0.64
142 0.69
143 0.76
144 0.78
145 0.73
146 0.67
147 0.63
148 0.58
149 0.58
150 0.56
151 0.53
152 0.45
153 0.49
154 0.55
155 0.59
156 0.56
157 0.49
158 0.46
159 0.41
160 0.42
161 0.36
162 0.35
163 0.28
164 0.26
165 0.24
166 0.22
167 0.2
168 0.17
169 0.16
170 0.08
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.12
177 0.13
178 0.16
179 0.19
180 0.24
181 0.25
182 0.24
183 0.26
184 0.28
185 0.31
186 0.3
187 0.3
188 0.27
189 0.29
190 0.33
191 0.34
192 0.36
193 0.34
194 0.33
195 0.32
196 0.38
197 0.38
198 0.38
199 0.39
200 0.33
201 0.31
202 0.31
203 0.33
204 0.24
205 0.22
206 0.18
207 0.12
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.17
220 0.19
221 0.23
222 0.26
223 0.32
224 0.37
225 0.44
226 0.47
227 0.5
228 0.57
229 0.6
230 0.6
231 0.61
232 0.66
233 0.65
234 0.66
235 0.65
236 0.61
237 0.58
238 0.57
239 0.54
240 0.5
241 0.45
242 0.39
243 0.34
244 0.31
245 0.3
246 0.28
247 0.25
248 0.23
249 0.23
250 0.28
251 0.27
252 0.27
253 0.29
254 0.31
255 0.29
256 0.29
257 0.3
258 0.34
259 0.43
260 0.48
261 0.48
262 0.55
263 0.62
264 0.64
265 0.65
266 0.61
267 0.58
268 0.59
269 0.56
270 0.53
271 0.46
272 0.43
273 0.44
274 0.42
275 0.41
276 0.42
277 0.45
278 0.42
279 0.47
280 0.56
281 0.52
282 0.51
283 0.49
284 0.46
285 0.41
286 0.43
287 0.38
288 0.31
289 0.29
290 0.28
291 0.24
292 0.23
293 0.23
294 0.23
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.22
299 0.28
300 0.33
301 0.42
302 0.44
303 0.51
304 0.48
305 0.49
306 0.48
307 0.41
308 0.34
309 0.26
310 0.26
311 0.19
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.19
316 0.19
317 0.19
318 0.14
319 0.17
320 0.2
321 0.22
322 0.23
323 0.25
324 0.27
325 0.27
326 0.32
327 0.33
328 0.36
329 0.36
330 0.37
331 0.33
332 0.32
333 0.33
334 0.27
335 0.23
336 0.16
337 0.16
338 0.13
339 0.14
340 0.16
341 0.14
342 0.15
343 0.13
344 0.13
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.1
360 0.1
361 0.13
362 0.15
363 0.16
364 0.19
365 0.24
366 0.32
367 0.35
368 0.42
369 0.46
370 0.48
371 0.54
372 0.56
373 0.59
374 0.55
375 0.47
376 0.4
377 0.35
378 0.31
379 0.23
380 0.18
381 0.11
382 0.08
383 0.12
384 0.12
385 0.14
386 0.14
387 0.16
388 0.16
389 0.17
390 0.19
391 0.19
392 0.22
393 0.22
394 0.25
395 0.23
396 0.24
397 0.22
398 0.21
399 0.16
400 0.14
401 0.11
402 0.08
403 0.09
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.1
425 0.13
426 0.15
427 0.18
428 0.2
429 0.23
430 0.29
431 0.37
432 0.39
433 0.41
434 0.41
435 0.44
436 0.43
437 0.42
438 0.39
439 0.32
440 0.27
441 0.23
442 0.24
443 0.18
444 0.19
445 0.16
446 0.16
447 0.15
448 0.17
449 0.19
450 0.19
451 0.2
452 0.19
453 0.17
454 0.26
455 0.3
456 0.32
457 0.31
458 0.33
459 0.34
460 0.36
461 0.42
462 0.41
463 0.39
464 0.38
465 0.37
466 0.32
467 0.3
468 0.32
469 0.32
470 0.25
471 0.24
472 0.24
473 0.24
474 0.24
475 0.25
476 0.2
477 0.17
478 0.17
479 0.18
480 0.2
481 0.24
482 0.25
483 0.26
484 0.3
485 0.33
486 0.34
487 0.37
488 0.34
489 0.35
490 0.35
491 0.35
492 0.31
493 0.25
494 0.23
495 0.17
496 0.14
497 0.09
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.18
502 0.21
503 0.26
504 0.28
505 0.29
506 0.31
507 0.35
508 0.43
509 0.44
510 0.51
511 0.55
512 0.56
513 0.58
514 0.58
515 0.58
516 0.53
517 0.52
518 0.52
519 0.5
520 0.55
521 0.61
522 0.66
523 0.68
524 0.69
525 0.68
526 0.64
527 0.68
528 0.7
529 0.66
530 0.61
531 0.54
532 0.53
533 0.53
534 0.49
535 0.42
536 0.35
537 0.31
538 0.33
539 0.33
540 0.28
541 0.22
542 0.22
543 0.17
544 0.14
545 0.12
546 0.09
547 0.07
548 0.08
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.1
554 0.11
555 0.15
556 0.15
557 0.14
558 0.2
559 0.21
560 0.24
561 0.24
562 0.27
563 0.26
564 0.27
565 0.26
566 0.19
567 0.18
568 0.15
569 0.15
570 0.12
571 0.13
572 0.14
573 0.16
574 0.16
575 0.17
576 0.19
577 0.19
578 0.2
579 0.26
580 0.3
581 0.35
582 0.42
583 0.42
584 0.43
585 0.47
586 0.5
587 0.43
588 0.36
589 0.3
590 0.26
591 0.27
592 0.26
593 0.23
594 0.2
595 0.23
596 0.28
597 0.27
598 0.25
599 0.22
600 0.23
601 0.24
602 0.24
603 0.2
604 0.14
605 0.14
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.13
610 0.13
611 0.16
612 0.16
613 0.18
614 0.21
615 0.24
616 0.28
617 0.34
618 0.39
619 0.43
620 0.5
621 0.57
622 0.59
623 0.58
624 0.58
625 0.56
626 0.56
627 0.51
628 0.46
629 0.39
630 0.34
631 0.32
632 0.27
633 0.21
634 0.14
635 0.11
636 0.1
637 0.08
638 0.08
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.06
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.04
651 0.04
652 0.04
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.1
666 0.1
667 0.09
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.12
674 0.12
675 0.12
676 0.11
677 0.13
678 0.14
679 0.13
680 0.17
681 0.15
682 0.19
683 0.19
684 0.2
685 0.18
686 0.17
687 0.17
688 0.12
689 0.11
690 0.07
691 0.05
692 0.05
693 0.04
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.03
698 0.04
699 0.04
700 0.06
701 0.09
702 0.09
703 0.1
704 0.17
705 0.19
706 0.22
707 0.25
708 0.23
709 0.22
710 0.23
711 0.23
712 0.18
713 0.17
714 0.17
715 0.14
716 0.14
717 0.13
718 0.12
719 0.12
720 0.1
721 0.09
722 0.07
723 0.08
724 0.09
725 0.12
726 0.14
727 0.14
728 0.16
729 0.16
730 0.15
731 0.17
732 0.16
733 0.17
734 0.16
735 0.16
736 0.19
737 0.19
738 0.2
739 0.18
740 0.21
741 0.2
742 0.23
743 0.25
744 0.21
745 0.21
746 0.23
747 0.22
748 0.18
749 0.21
750 0.19
751 0.18
752 0.17
753 0.17
754 0.15
755 0.15
756 0.15
757 0.1
758 0.08
759 0.07
760 0.08
761 0.13
762 0.14
763 0.16
764 0.16
765 0.16
766 0.16
767 0.16
768 0.16
769 0.13
770 0.13
771 0.11
772 0.1
773 0.09
774 0.08
775 0.09
776 0.07
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.05
782 0.06
783 0.09
784 0.12
785 0.13
786 0.14
787 0.14
788 0.15
789 0.19
790 0.22
791 0.21
792 0.24
793 0.27
794 0.29
795 0.3
796 0.3
797 0.27
798 0.25
799 0.23
800 0.21
801 0.23
802 0.22
803 0.21
804 0.21
805 0.22
806 0.21
807 0.21
808 0.17
809 0.11
810 0.14
811 0.14
812 0.16
813 0.15
814 0.15
815 0.15
816 0.17
817 0.17
818 0.13
819 0.16
820 0.16
821 0.16
822 0.16
823 0.15
824 0.13
825 0.13
826 0.13
827 0.09
828 0.08