Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EC05

Protein Details
Accession A0A178EC05    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
488-513IERATERHTRDRKKQEEKYQREVKKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-524RDRKKQEEKYQREVKKLEERREKETKKL
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024500  DUF3074  
IPR023393  START-like_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF11274  DUF3074  
CDD cd08864  SRPBCC_DUF3074  
Amino Acid Sequences MSELHTALECLRPKDFGDVPTDDLTKFLAEILTNAEIIANSVPPPPNGTPYESAQRTRADPTLATSAEDLTKSEVRRPAVAKKHEELQKSWGKPVKLAAKETATGMSVFKMAGHDRHGAWFARTSVHEGLGFAKWKRAMLREFPESLKVQGGPGEGNVRGIGGDQRLEDITVEGIGKLEVYQLSAQFPGPTSPREFITLLITSDTCLTDASKVGNAIPRHFMVVSIPVTHPDAPARAGMVRGFYESIEMIREIPMPSSETASDEGDETNPVEWIMVTRSDPGGGIPRFMVERSVPSSIVQDAVKFLDWACACNEPDIEILTTGEDGTVESLQVHDVDHRLSLTMSNGITAGIGTSIADRPSPALRRLSQRTMDRETANQEGVFDQLRNTVEAYVPDSINPLQRTISSSSSSTSSSVDSFASAEQFNTATEGFPSSEQSLPGTTEDNQHAREMQKIEERKQQLKEQLNQVREKQDQSLQNESQKTQKEIERATERHTRDRKKQEEKYQREVKKLEERREKETKKLLARQQKDADKNQLLKAQRERDEYKRKLTLVEEENKLLKEQVGELQRQNTALVARMGKSDFGRELLRLVKEDDMPGRARASSRASGSSGKSSGKKSKDSSDAISGLARSGTQASMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.31
4 0.33
5 0.33
6 0.35
7 0.38
8 0.38
9 0.31
10 0.27
11 0.25
12 0.19
13 0.16
14 0.13
15 0.11
16 0.09
17 0.1
18 0.14
19 0.14
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.09
27 0.09
28 0.14
29 0.15
30 0.16
31 0.22
32 0.22
33 0.27
34 0.29
35 0.34
36 0.33
37 0.36
38 0.45
39 0.43
40 0.44
41 0.42
42 0.43
43 0.4
44 0.41
45 0.4
46 0.33
47 0.29
48 0.31
49 0.33
50 0.3
51 0.29
52 0.25
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.18
57 0.16
58 0.21
59 0.21
60 0.27
61 0.3
62 0.31
63 0.37
64 0.41
65 0.45
66 0.51
67 0.58
68 0.58
69 0.56
70 0.62
71 0.63
72 0.62
73 0.55
74 0.54
75 0.55
76 0.51
77 0.55
78 0.52
79 0.46
80 0.45
81 0.5
82 0.51
83 0.46
84 0.48
85 0.45
86 0.43
87 0.43
88 0.42
89 0.35
90 0.26
91 0.22
92 0.18
93 0.14
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.18
101 0.21
102 0.21
103 0.24
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.25
108 0.22
109 0.22
110 0.23
111 0.25
112 0.23
113 0.24
114 0.22
115 0.19
116 0.21
117 0.21
118 0.24
119 0.2
120 0.23
121 0.22
122 0.24
123 0.27
124 0.31
125 0.32
126 0.37
127 0.43
128 0.43
129 0.45
130 0.44
131 0.45
132 0.4
133 0.36
134 0.3
135 0.24
136 0.19
137 0.18
138 0.18
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.05
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.15
178 0.17
179 0.18
180 0.19
181 0.22
182 0.21
183 0.19
184 0.22
185 0.2
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.12
190 0.13
191 0.12
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.16
202 0.17
203 0.18
204 0.2
205 0.19
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.13
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.16
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.07
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.12
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.15
300 0.14
301 0.1
302 0.11
303 0.1
304 0.09
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.05
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.07
347 0.12
348 0.14
349 0.16
350 0.2
351 0.23
352 0.31
353 0.36
354 0.4
355 0.42
356 0.45
357 0.48
358 0.49
359 0.49
360 0.43
361 0.39
362 0.37
363 0.33
364 0.29
365 0.23
366 0.18
367 0.15
368 0.15
369 0.13
370 0.1
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.17
386 0.16
387 0.15
388 0.14
389 0.14
390 0.18
391 0.19
392 0.21
393 0.18
394 0.18
395 0.18
396 0.19
397 0.19
398 0.17
399 0.14
400 0.13
401 0.11
402 0.12
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.11
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.13
429 0.12
430 0.15
431 0.19
432 0.21
433 0.21
434 0.21
435 0.23
436 0.22
437 0.26
438 0.23
439 0.23
440 0.28
441 0.32
442 0.36
443 0.42
444 0.47
445 0.48
446 0.51
447 0.54
448 0.55
449 0.58
450 0.6
451 0.62
452 0.63
453 0.63
454 0.62
455 0.6
456 0.58
457 0.52
458 0.48
459 0.42
460 0.41
461 0.42
462 0.43
463 0.47
464 0.43
465 0.47
466 0.47
467 0.45
468 0.45
469 0.42
470 0.41
471 0.37
472 0.38
473 0.38
474 0.38
475 0.45
476 0.47
477 0.45
478 0.47
479 0.51
480 0.5
481 0.54
482 0.61
483 0.62
484 0.63
485 0.73
486 0.77
487 0.8
488 0.86
489 0.86
490 0.88
491 0.88
492 0.88
493 0.87
494 0.82
495 0.79
496 0.71
497 0.68
498 0.68
499 0.68
500 0.68
501 0.69
502 0.67
503 0.68
504 0.77
505 0.72
506 0.7
507 0.7
508 0.68
509 0.66
510 0.71
511 0.73
512 0.72
513 0.74
514 0.75
515 0.74
516 0.75
517 0.73
518 0.71
519 0.71
520 0.68
521 0.67
522 0.62
523 0.6
524 0.54
525 0.55
526 0.57
527 0.56
528 0.55
529 0.58
530 0.6
531 0.64
532 0.71
533 0.69
534 0.68
535 0.66
536 0.61
537 0.57
538 0.54
539 0.53
540 0.5
541 0.53
542 0.48
543 0.45
544 0.47
545 0.44
546 0.41
547 0.33
548 0.26
549 0.19
550 0.18
551 0.21
552 0.24
553 0.28
554 0.3
555 0.33
556 0.33
557 0.32
558 0.3
559 0.26
560 0.21
561 0.2
562 0.21
563 0.2
564 0.19
565 0.22
566 0.22
567 0.24
568 0.24
569 0.25
570 0.22
571 0.23
572 0.24
573 0.22
574 0.24
575 0.27
576 0.28
577 0.26
578 0.26
579 0.27
580 0.27
581 0.3
582 0.3
583 0.29
584 0.29
585 0.29
586 0.28
587 0.26
588 0.26
589 0.27
590 0.3
591 0.32
592 0.33
593 0.34
594 0.35
595 0.38
596 0.4
597 0.42
598 0.39
599 0.39
600 0.41
601 0.46
602 0.52
603 0.53
604 0.58
605 0.57
606 0.62
607 0.64
608 0.64
609 0.62
610 0.6
611 0.55
612 0.48
613 0.45
614 0.36
615 0.29
616 0.24
617 0.18
618 0.12
619 0.13