Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EBV1

Protein Details
Accession A0A178EBV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-30SSSFFTTPASQRKRKRTEGASSAPKRRNTHydrophilic
196-222NITPRRTPKRLLWRKGNKNKKGDRGFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-42RKRKRTEGASSAPKRRNTDANSSRPARPSR
199-217PRRTPKRLLWRKGNKNKKG
Subcellular Location(s) mito 14.5, nucl 9.5, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSSSFFTTPASQRKRKRTEGASSAPKRRNTDANSSRPARPSRRIEREESISGSDVSDDEGEDIFDAEDGDSETSDNENETAAEKRLRLAERYLENIRNEVEEEVGFDAAQIDKDLIAERLKEDVAETKGKIYRSIARELDFENAPHVAGFSGLQKSTTGCALKLPYAWTISKELVVEKWEIADPKSYAPDPSRPSNITPRRTPKRLLWRKGNKNKKGDRGFLGHTGEIISIAISDSGKYLATGDKHARLIVWDAETLTPRHLFTRHRDAVMSLSFRRGTEQLFSGGADRAVIVWSAPESAYIETLVGHQDVVVGVAGGLEVNQETCISVGARDRTARLWRVVEENQLVFQGGGTARQKGLEKLRKGRFGKNVDTDENPDESKANGIEDEDEDPPIAYAEGSIDCVALLDASLFVTASDNGALSLWSTNRKKPLFTYPLTHGRDPRLTPEQMSANDDAVVSAKPGPRLPRYVTALTTVPFADLILTASWDGWIRAWKVSDNKRAIEPVGKIGRVPVESDLDMDGQKPEDTALIRGIVNGLSVQERGDRGKDGLCIVAAVGREPRLARWMSGKVKNGIYVFEVPRKALTNGQADDGDSADEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.83
3 0.85
4 0.83
5 0.84
6 0.84
7 0.84
8 0.84
9 0.84
10 0.84
11 0.82
12 0.79
13 0.74
14 0.7
15 0.7
16 0.65
17 0.67
18 0.67
19 0.69
20 0.71
21 0.71
22 0.71
23 0.69
24 0.72
25 0.69
26 0.68
27 0.7
28 0.72
29 0.77
30 0.78
31 0.77
32 0.76
33 0.75
34 0.69
35 0.62
36 0.54
37 0.45
38 0.39
39 0.32
40 0.25
41 0.18
42 0.15
43 0.12
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.07
51 0.06
52 0.07
53 0.05
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.1
67 0.12
68 0.14
69 0.17
70 0.17
71 0.19
72 0.26
73 0.28
74 0.29
75 0.31
76 0.35
77 0.36
78 0.42
79 0.45
80 0.44
81 0.43
82 0.42
83 0.38
84 0.32
85 0.29
86 0.24
87 0.19
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.08
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.13
110 0.16
111 0.19
112 0.22
113 0.21
114 0.25
115 0.28
116 0.29
117 0.3
118 0.28
119 0.32
120 0.32
121 0.39
122 0.36
123 0.35
124 0.36
125 0.36
126 0.36
127 0.29
128 0.25
129 0.19
130 0.16
131 0.15
132 0.12
133 0.11
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.18
145 0.15
146 0.13
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.17
153 0.2
154 0.2
155 0.19
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.19
160 0.18
161 0.16
162 0.17
163 0.16
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.16
170 0.15
171 0.16
172 0.19
173 0.18
174 0.19
175 0.21
176 0.28
177 0.28
178 0.32
179 0.36
180 0.35
181 0.38
182 0.46
183 0.51
184 0.5
185 0.54
186 0.6
187 0.64
188 0.66
189 0.66
190 0.65
191 0.68
192 0.72
193 0.72
194 0.73
195 0.75
196 0.82
197 0.88
198 0.9
199 0.87
200 0.87
201 0.86
202 0.85
203 0.81
204 0.75
205 0.68
206 0.63
207 0.57
208 0.52
209 0.46
210 0.36
211 0.29
212 0.24
213 0.2
214 0.15
215 0.12
216 0.06
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.08
228 0.09
229 0.13
230 0.16
231 0.18
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.16
236 0.17
237 0.15
238 0.13
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.14
249 0.17
250 0.22
251 0.32
252 0.33
253 0.33
254 0.33
255 0.32
256 0.32
257 0.31
258 0.28
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.17
263 0.19
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.02
305 0.02
306 0.02
307 0.02
308 0.02
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.08
317 0.1
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.16
322 0.2
323 0.22
324 0.22
325 0.22
326 0.21
327 0.26
328 0.26
329 0.27
330 0.24
331 0.22
332 0.2
333 0.18
334 0.17
335 0.12
336 0.1
337 0.08
338 0.06
339 0.1
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.14
344 0.15
345 0.17
346 0.27
347 0.31
348 0.36
349 0.45
350 0.51
351 0.58
352 0.61
353 0.64
354 0.63
355 0.61
356 0.62
357 0.6
358 0.58
359 0.51
360 0.49
361 0.46
362 0.39
363 0.35
364 0.28
365 0.21
366 0.17
367 0.15
368 0.14
369 0.11
370 0.09
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.09
381 0.08
382 0.07
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.07
411 0.08
412 0.16
413 0.19
414 0.23
415 0.32
416 0.34
417 0.35
418 0.37
419 0.46
420 0.45
421 0.45
422 0.46
423 0.45
424 0.53
425 0.56
426 0.55
427 0.48
428 0.46
429 0.49
430 0.45
431 0.44
432 0.41
433 0.37
434 0.36
435 0.36
436 0.36
437 0.32
438 0.35
439 0.29
440 0.23
441 0.22
442 0.21
443 0.17
444 0.13
445 0.11
446 0.09
447 0.11
448 0.13
449 0.15
450 0.18
451 0.24
452 0.27
453 0.32
454 0.36
455 0.4
456 0.44
457 0.44
458 0.42
459 0.4
460 0.37
461 0.32
462 0.29
463 0.21
464 0.15
465 0.12
466 0.11
467 0.08
468 0.07
469 0.08
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.13
479 0.14
480 0.17
481 0.18
482 0.23
483 0.32
484 0.41
485 0.49
486 0.49
487 0.5
488 0.5
489 0.51
490 0.48
491 0.45
492 0.38
493 0.37
494 0.38
495 0.36
496 0.33
497 0.33
498 0.34
499 0.29
500 0.29
501 0.22
502 0.21
503 0.21
504 0.22
505 0.2
506 0.18
507 0.17
508 0.16
509 0.15
510 0.12
511 0.12
512 0.11
513 0.1
514 0.12
515 0.13
516 0.14
517 0.14
518 0.15
519 0.15
520 0.15
521 0.16
522 0.13
523 0.12
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.1
529 0.12
530 0.14
531 0.17
532 0.19
533 0.2
534 0.21
535 0.23
536 0.25
537 0.23
538 0.22
539 0.19
540 0.17
541 0.15
542 0.15
543 0.12
544 0.12
545 0.14
546 0.13
547 0.16
548 0.17
549 0.18
550 0.22
551 0.24
552 0.24
553 0.28
554 0.36
555 0.42
556 0.49
557 0.54
558 0.53
559 0.54
560 0.57
561 0.51
562 0.44
563 0.4
564 0.4
565 0.38
566 0.4
567 0.39
568 0.35
569 0.37
570 0.39
571 0.36
572 0.34
573 0.36
574 0.38
575 0.37
576 0.4
577 0.37
578 0.34
579 0.33
580 0.28