Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EI97

Protein Details
Accession A0A178EI97    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-52QATVNKRQKRGGPEKEAPRRHAWHydrophilic
74-100QSVQEREEERKRKRLRKDTKPFQRGIIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-47RQKRGGPEKEAP
83-93RKRKRLRKDTK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04056  Ssl1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50234  VWFA  
Amino Acid Sequences MADSDYEFEGEGSDDEYVGSKSGDSTTRAQATVNKRQKRGGPEKEAPRRHAWETEYSRTVEKTIQAADDGTLEQSVQEREEERKRKRLRKDTKPFQRGIIRHVVLVLDLSEAMYEKDMRPNRYITMINYAQDYIREFFEQNPISQVSVLGMHDGVCIRVSELSGNPAEHVAAIQGLRSKENGKEPKGAPSLQNALELARATLYHTPSHGTREVIVVFGSLLSLDPGDIHQTVKACVRDRIRVSIIGMSARLKICGEIVSRTNAGDDSEYTIATDQEMLKELLIATTTPPVVRQAKPTARAAPASDSTAALMMMGFPSRVVEDHLTMCACHGNLTMGGYTCSRCSAKVCSLPITCPSCQLTLLLSTHLARSYHHLFPLRNWSTVSWARARQLGSKECTGCLGRFNDPPASDSVSTEKETNREVNGKGDTDDSEEQKASESGRRLDPAAIAQASGSNGDVAMHG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.08
8 0.09
9 0.13
10 0.16
11 0.18
12 0.22
13 0.29
14 0.32
15 0.32
16 0.33
17 0.37
18 0.43
19 0.5
20 0.56
21 0.57
22 0.57
23 0.63
24 0.68
25 0.71
26 0.73
27 0.72
28 0.72
29 0.74
30 0.81
31 0.85
32 0.86
33 0.81
34 0.78
35 0.73
36 0.67
37 0.64
38 0.57
39 0.57
40 0.57
41 0.58
42 0.53
43 0.5
44 0.48
45 0.42
46 0.4
47 0.33
48 0.28
49 0.25
50 0.23
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.19
55 0.17
56 0.15
57 0.12
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.13
66 0.2
67 0.31
68 0.4
69 0.45
70 0.54
71 0.64
72 0.71
73 0.8
74 0.84
75 0.85
76 0.86
77 0.91
78 0.91
79 0.93
80 0.92
81 0.83
82 0.8
83 0.78
84 0.68
85 0.63
86 0.62
87 0.51
88 0.43
89 0.41
90 0.33
91 0.24
92 0.23
93 0.17
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.17
104 0.23
105 0.26
106 0.29
107 0.31
108 0.31
109 0.34
110 0.35
111 0.29
112 0.32
113 0.3
114 0.28
115 0.27
116 0.26
117 0.21
118 0.2
119 0.21
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.23
126 0.23
127 0.2
128 0.22
129 0.21
130 0.2
131 0.19
132 0.18
133 0.1
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.15
167 0.25
168 0.31
169 0.31
170 0.38
171 0.38
172 0.45
173 0.46
174 0.45
175 0.36
176 0.34
177 0.35
178 0.28
179 0.28
180 0.2
181 0.17
182 0.17
183 0.15
184 0.11
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.1
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.18
195 0.18
196 0.15
197 0.14
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.12
220 0.16
221 0.15
222 0.2
223 0.23
224 0.28
225 0.29
226 0.32
227 0.3
228 0.28
229 0.28
230 0.25
231 0.23
232 0.17
233 0.16
234 0.12
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.11
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.1
261 0.06
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.12
277 0.17
278 0.18
279 0.23
280 0.3
281 0.35
282 0.39
283 0.42
284 0.42
285 0.39
286 0.39
287 0.35
288 0.31
289 0.27
290 0.25
291 0.22
292 0.17
293 0.15
294 0.14
295 0.12
296 0.08
297 0.06
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.05
305 0.05
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.12
310 0.14
311 0.14
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.09
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.16
331 0.2
332 0.27
333 0.32
334 0.34
335 0.37
336 0.38
337 0.39
338 0.43
339 0.43
340 0.36
341 0.33
342 0.33
343 0.27
344 0.26
345 0.25
346 0.19
347 0.18
348 0.19
349 0.16
350 0.15
351 0.15
352 0.16
353 0.18
354 0.17
355 0.13
356 0.19
357 0.24
358 0.25
359 0.3
360 0.34
361 0.32
362 0.36
363 0.47
364 0.43
365 0.39
366 0.37
367 0.33
368 0.35
369 0.39
370 0.39
371 0.34
372 0.35
373 0.36
374 0.38
375 0.4
376 0.39
377 0.42
378 0.45
379 0.43
380 0.47
381 0.46
382 0.42
383 0.44
384 0.4
385 0.33
386 0.32
387 0.31
388 0.28
389 0.3
390 0.34
391 0.35
392 0.33
393 0.34
394 0.31
395 0.34
396 0.3
397 0.28
398 0.3
399 0.27
400 0.29
401 0.3
402 0.29
403 0.26
404 0.29
405 0.31
406 0.31
407 0.33
408 0.33
409 0.36
410 0.37
411 0.36
412 0.33
413 0.31
414 0.27
415 0.28
416 0.31
417 0.28
418 0.28
419 0.27
420 0.26
421 0.26
422 0.26
423 0.23
424 0.25
425 0.27
426 0.28
427 0.33
428 0.36
429 0.35
430 0.35
431 0.35
432 0.32
433 0.33
434 0.28
435 0.23
436 0.21
437 0.21
438 0.2
439 0.18
440 0.15
441 0.09
442 0.09