Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178DQI0

Protein Details
Accession A0A178DQI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-176ERIPSKLLGASKKRRKVKRRAVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-176GASKKRRKVKRRAV
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MRIKTPQSALLSNHEVLLHMQTEDAEYSGTDGTHRARNTSQGLTHMLRDCITYLTHADNPLTEITALHPTRPKTLYKGPHSLFRALAPTYRLNKAEYLQLYNLRPATQVMLELVIEEAGSRFSEDQLYEILLIIHRVFGEEEAGIPEGVEDQVMERIPSKLLGASKKRRKVKRRAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.23
4 0.22
5 0.16
6 0.11
7 0.11
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.1
12 0.08
13 0.06
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.09
19 0.12
20 0.17
21 0.18
22 0.2
23 0.21
24 0.27
25 0.31
26 0.32
27 0.31
28 0.27
29 0.32
30 0.3
31 0.33
32 0.3
33 0.26
34 0.23
35 0.22
36 0.2
37 0.16
38 0.15
39 0.12
40 0.11
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.14
48 0.12
49 0.09
50 0.07
51 0.08
52 0.16
53 0.16
54 0.17
55 0.2
56 0.21
57 0.25
58 0.27
59 0.27
60 0.24
61 0.32
62 0.39
63 0.41
64 0.49
65 0.46
66 0.5
67 0.51
68 0.47
69 0.4
70 0.32
71 0.29
72 0.21
73 0.21
74 0.16
75 0.19
76 0.2
77 0.22
78 0.22
79 0.2
80 0.21
81 0.21
82 0.23
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.21
87 0.21
88 0.22
89 0.22
90 0.17
91 0.16
92 0.14
93 0.14
94 0.1
95 0.1
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.05
138 0.05
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.12
147 0.14
148 0.19
149 0.28
150 0.37
151 0.47
152 0.57
153 0.66
154 0.75
155 0.82
156 0.86