Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178E5K1

Protein Details
Accession A0A178E5K1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-66NLVTNNNRRKRRILAHRPRRVPNRNPPVFGHHydrophilic
147-172GDNYYRGDDRRQRRRNDDFGRGRRYEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-57RRKRRILAHRPRRVP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 9.5, cyto 9.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MEMMDLDDDGARTPGPEARQDSRAQALAEAPDRNDNLVTNNNRRKRRILAHRPRRVPNRNPPVFGHQPTGQYWDHDKERVPASSTPNNRRRDNSRSGDWSARAQSGKYPETLGADMADTDIKEENGDRRDRGGYRGGNNKRRRDDDGDNYYRGDDRRQRRRNDDFGRGRRYEEPPHAKLRRMLLNIASSTKLPQDEAIEIAKCLGENFDDERLVSEFFDVFVQLVIEQPFKIPFIAAIAFYGNDVKPEITIEAMKQVGERAQAALKAGDWKDFKLLLRFFACLQGLYEGDGVFTFLGQLFDTVVDLQSANENDVVGIELVKIILLTIPYALVASGSRFHEQAQELLKSTGIVAANMVPIEGLISSYVGDFESKPVEYHSVIGLLQAQLTSEAENGFELRCLPRFDPEALRMAKAEDDALPTAPQTHAFPTFKIPSPVNPGPRPVFPESYFSLFADQDVATVPKTTDVASSLVRDAIVDTINQLDFNRDAVAKFLVEVDCYWSIDIFAKRGAAFDVFKESTGDKIQYKSEDMIIDAIFSQLFKLPSAEHKLVYYHSLITQCCKIAPAAIAPSLGRAIRTIFKNLPMMDLELGYRFLDWFTHHLSNFEFRWRWTEWIDILELTNLHPNKAFILAVLDKEIRLSFAKRIRSTLPEPMHSLIPERLDADNSPDFKYDNPNTPYFEEGQKLLAQFRKKATAEEIQVTIDKIHEKAIEQGITEVLVPSTDAFVTAICRLGAKSLSHVLSCIERGKDRLLEISQNEVARRQIVASVVEYWKDQPGVAVRIIDILLNYTILAPMTVVQWVFGSHMGAGEALTESWVFEMVSNTVAKVTNRNRQIASARLQKRLAAEQVEMVEATLAKDRDNARELFKYIEDSTRGVASGAADGLIEKQTNGTLTEEEVELIKSWGKRWHTVFIRKAQVEESVVGEEAVEARTKLLAAEEADEEEEIVKMEVEVEEVRAEDGVNGDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.23
4 0.29
5 0.33
6 0.38
7 0.4
8 0.42
9 0.43
10 0.43
11 0.36
12 0.31
13 0.29
14 0.3
15 0.32
16 0.3
17 0.27
18 0.29
19 0.29
20 0.3
21 0.28
22 0.23
23 0.23
24 0.3
25 0.37
26 0.42
27 0.51
28 0.59
29 0.66
30 0.7
31 0.72
32 0.73
33 0.75
34 0.76
35 0.77
36 0.8
37 0.83
38 0.89
39 0.91
40 0.91
41 0.91
42 0.9
43 0.89
44 0.89
45 0.89
46 0.85
47 0.81
48 0.76
49 0.74
50 0.72
51 0.65
52 0.6
53 0.53
54 0.49
55 0.47
56 0.48
57 0.39
58 0.35
59 0.37
60 0.38
61 0.38
62 0.38
63 0.38
64 0.38
65 0.43
66 0.42
67 0.41
68 0.39
69 0.42
70 0.48
71 0.56
72 0.6
73 0.63
74 0.68
75 0.69
76 0.71
77 0.71
78 0.7
79 0.71
80 0.68
81 0.68
82 0.67
83 0.67
84 0.67
85 0.61
86 0.59
87 0.52
88 0.5
89 0.43
90 0.37
91 0.37
92 0.37
93 0.37
94 0.32
95 0.3
96 0.27
97 0.29
98 0.29
99 0.24
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.13
104 0.12
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.12
111 0.18
112 0.23
113 0.27
114 0.27
115 0.29
116 0.35
117 0.36
118 0.38
119 0.4
120 0.4
121 0.43
122 0.52
123 0.59
124 0.63
125 0.71
126 0.76
127 0.76
128 0.75
129 0.75
130 0.73
131 0.72
132 0.72
133 0.73
134 0.7
135 0.63
136 0.58
137 0.52
138 0.48
139 0.4
140 0.38
141 0.37
142 0.42
143 0.52
144 0.6
145 0.67
146 0.74
147 0.81
148 0.83
149 0.82
150 0.82
151 0.82
152 0.82
153 0.83
154 0.74
155 0.69
156 0.65
157 0.62
158 0.59
159 0.59
160 0.59
161 0.55
162 0.64
163 0.64
164 0.61
165 0.6
166 0.59
167 0.57
168 0.51
169 0.49
170 0.42
171 0.44
172 0.42
173 0.39
174 0.33
175 0.25
176 0.24
177 0.24
178 0.2
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.18
184 0.19
185 0.17
186 0.16
187 0.16
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.09
194 0.12
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.14
202 0.12
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.06
209 0.07
210 0.05
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.12
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.17
254 0.17
255 0.21
256 0.2
257 0.2
258 0.22
259 0.25
260 0.25
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.26
265 0.26
266 0.24
267 0.26
268 0.25
269 0.18
270 0.18
271 0.15
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.08
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.12
326 0.17
327 0.17
328 0.2
329 0.21
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.2
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.12
363 0.11
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.08
371 0.08
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.07
386 0.09
387 0.12
388 0.12
389 0.15
390 0.17
391 0.2
392 0.22
393 0.22
394 0.27
395 0.25
396 0.25
397 0.22
398 0.2
399 0.18
400 0.15
401 0.14
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.14
414 0.15
415 0.16
416 0.2
417 0.23
418 0.23
419 0.25
420 0.24
421 0.21
422 0.29
423 0.33
424 0.34
425 0.32
426 0.35
427 0.34
428 0.35
429 0.37
430 0.31
431 0.31
432 0.26
433 0.28
434 0.26
435 0.27
436 0.27
437 0.22
438 0.2
439 0.16
440 0.15
441 0.13
442 0.11
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.12
491 0.12
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.14
502 0.13
503 0.13
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.15
508 0.17
509 0.13
510 0.14
511 0.16
512 0.16
513 0.17
514 0.16
515 0.16
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.11
520 0.1
521 0.08
522 0.08
523 0.06
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.08
531 0.13
532 0.2
533 0.21
534 0.19
535 0.19
536 0.2
537 0.2
538 0.21
539 0.17
540 0.11
541 0.12
542 0.15
543 0.14
544 0.16
545 0.17
546 0.15
547 0.14
548 0.14
549 0.12
550 0.1
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.11
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.1
560 0.08
561 0.07
562 0.08
563 0.13
564 0.15
565 0.19
566 0.19
567 0.21
568 0.25
569 0.24
570 0.24
571 0.2
572 0.19
573 0.15
574 0.14
575 0.12
576 0.09
577 0.1
578 0.08
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.09
585 0.14
586 0.17
587 0.17
588 0.18
589 0.19
590 0.22
591 0.22
592 0.25
593 0.21
594 0.18
595 0.23
596 0.23
597 0.25
598 0.23
599 0.25
600 0.2
601 0.2
602 0.2
603 0.16
604 0.15
605 0.13
606 0.11
607 0.09
608 0.14
609 0.13
610 0.12
611 0.13
612 0.13
613 0.13
614 0.14
615 0.13
616 0.07
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.14
621 0.13
622 0.12
623 0.13
624 0.13
625 0.1
626 0.11
627 0.13
628 0.17
629 0.22
630 0.3
631 0.31
632 0.34
633 0.35
634 0.4
635 0.41
636 0.44
637 0.42
638 0.37
639 0.39
640 0.37
641 0.36
642 0.3
643 0.29
644 0.21
645 0.19
646 0.17
647 0.16
648 0.15
649 0.15
650 0.15
651 0.18
652 0.2
653 0.21
654 0.21
655 0.2
656 0.2
657 0.19
658 0.28
659 0.26
660 0.3
661 0.32
662 0.34
663 0.36
664 0.37
665 0.38
666 0.32
667 0.31
668 0.23
669 0.2
670 0.2
671 0.18
672 0.18
673 0.2
674 0.22
675 0.23
676 0.26
677 0.28
678 0.34
679 0.33
680 0.34
681 0.35
682 0.37
683 0.37
684 0.36
685 0.34
686 0.27
687 0.27
688 0.26
689 0.21
690 0.16
691 0.13
692 0.11
693 0.13
694 0.12
695 0.12
696 0.17
697 0.21
698 0.2
699 0.19
700 0.19
701 0.17
702 0.16
703 0.16
704 0.11
705 0.06
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.07
715 0.08
716 0.09
717 0.08
718 0.09
719 0.08
720 0.1
721 0.13
722 0.12
723 0.15
724 0.19
725 0.2
726 0.2
727 0.2
728 0.19
729 0.18
730 0.2
731 0.21
732 0.18
733 0.18
734 0.21
735 0.24
736 0.25
737 0.24
738 0.26
739 0.25
740 0.27
741 0.27
742 0.31
743 0.3
744 0.3
745 0.29
746 0.26
747 0.25
748 0.21
749 0.2
750 0.15
751 0.13
752 0.13
753 0.14
754 0.14
755 0.17
756 0.17
757 0.18
758 0.18
759 0.17
760 0.18
761 0.17
762 0.15
763 0.13
764 0.17
765 0.2
766 0.2
767 0.19
768 0.17
769 0.18
770 0.18
771 0.15
772 0.1
773 0.09
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.07
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.05
782 0.05
783 0.06
784 0.07
785 0.07
786 0.07
787 0.07
788 0.08
789 0.09
790 0.09
791 0.09
792 0.07
793 0.08
794 0.08
795 0.08
796 0.07
797 0.06
798 0.06
799 0.05
800 0.06
801 0.05
802 0.05
803 0.05
804 0.06
805 0.05
806 0.06
807 0.08
808 0.08
809 0.1
810 0.1
811 0.1
812 0.12
813 0.14
814 0.14
815 0.22
816 0.29
817 0.36
818 0.41
819 0.46
820 0.45
821 0.48
822 0.52
823 0.49
824 0.5
825 0.52
826 0.52
827 0.53
828 0.53
829 0.5
830 0.49
831 0.48
832 0.45
833 0.38
834 0.33
835 0.3
836 0.3
837 0.28
838 0.24
839 0.18
840 0.14
841 0.11
842 0.11
843 0.13
844 0.12
845 0.12
846 0.18
847 0.2
848 0.25
849 0.3
850 0.31
851 0.31
852 0.36
853 0.37
854 0.35
855 0.33
856 0.32
857 0.3
858 0.33
859 0.3
860 0.27
861 0.27
862 0.24
863 0.24
864 0.19
865 0.17
866 0.13
867 0.12
868 0.1
869 0.09
870 0.07
871 0.08
872 0.09
873 0.1
874 0.1
875 0.08
876 0.09
877 0.1
878 0.12
879 0.13
880 0.14
881 0.12
882 0.13
883 0.15
884 0.15
885 0.14
886 0.13
887 0.13
888 0.12
889 0.12
890 0.15
891 0.14
892 0.18
893 0.25
894 0.29
895 0.35
896 0.39
897 0.48
898 0.54
899 0.62
900 0.67
901 0.68
902 0.74
903 0.67
904 0.64
905 0.56
906 0.51
907 0.43
908 0.37
909 0.3
910 0.21
911 0.21
912 0.19
913 0.17
914 0.13
915 0.11
916 0.11
917 0.09
918 0.08
919 0.08
920 0.09
921 0.09
922 0.09
923 0.1
924 0.12
925 0.12
926 0.15
927 0.15
928 0.16
929 0.17
930 0.16
931 0.15
932 0.12
933 0.11
934 0.09
935 0.08
936 0.07
937 0.06
938 0.07
939 0.07
940 0.09
941 0.09
942 0.1
943 0.1
944 0.11
945 0.11
946 0.1
947 0.1
948 0.09