Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EHQ8

Protein Details
Accession A0A178EHQ8    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MPKFVPRQRKHKALARRKHSEPQDDABasic
51-78VREAQGKISGKKKKRLDKYIDTKLRKEEBasic
220-243DDSGKPIIQIRKRRKGQDKPVAVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-18RQRKHKALARRK
56-66GKISGKKKKRL
232-233RR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17982  DEXHc_DHX37  
cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MPKFVPRQRKHKALARRKHSEPQDDANSSEILPQEERDRLEKKAVLKEELVREAQGKISGKKKKRLDKYIDTKLRKEENLALLKKLATQKVDTSLFQSSKKLGSGAGTKRETLRRALAESRAGIDVEKNEGLLLQKREVKEKETDTDSDDNSVTEPIAQPTPRKANKSTLVARKRSVSPDDSIHADDTKSPVSAVPSGSSGLFQTSGLFGSGLKRPLEVDDSGKPIIQIRKRRKGQDKPVAVEEEVEWEGFSSTEEADNSEMEEDDSEQVSSDADSEDVDVHGQVEEEEEEEDGSSRSGSEESDGSEEEESEEDSDEESDTSMDEDKKIARKERTSAFKAWATQQRNEAVGFVPTNNLTYAVAPKPANFQPRAPEQDPLPPELETNTSTDAIRKAFSVIVERSDTIQESRMQLPIVAEEQKIMEAIHNNDVVVVWGATGSGKTTQVPQFLYEAGYGAADGPTPGMIGVTQPRRVAAVSMSKRVGDELSKHGSKVAYQIRFDTSTNAKTAIKFMTDGVLLREITQDFVLTKYSAIVIDEAHERSVNTDILIGMLSRIVDLRAQMAKEDPQQKPLKLIIMSATLRISDFTENKRLFRSEPPPLIKAEGRQYTVTNHFARRTERDYVEEMYRKVCRGHRKLPKGGMLIFLTGQYEISRLAKRLREAFSSTQGHEAKIGKVLVSAAETPLETEDIEFGTKDQEYQDDDGSDSEGSIILGIDDEDDKEFQIEDEKPEETVMKVHVLPLYSQLPTNQQLRVFEPPPDGSRLIVLATNVAETSLTIPGIRYVFDCGRAKEKKYDLVTGVQSFEIGWISKASANQRAGRAGRTGPGHCYRLYSSAVFERDFDEYAAPEISRTPLEGVVLQLKSMGAPVINFPFPTPPDQESLQKAENLLSYLGALSSDGKVTKLGHELSLYPLNPRFARMVAMGVAQNLTAETIALVASLSVPELIISENKLGLRDPPKTATSDIRTEEDNLAAEERSRLRKSYNAAQAKLALNAKHSDCIKLSNAVCAYAYETDTQRFCDDMFLNAKAMNEATQLRHQLTNIVRAHRPIAISAYAPKLPAFTERSINLLTQICAAGFIDQIAMRADLAPVPPVLARKPKSAIDVPYLPLFSAQSDAHSDDDPAAQCVFLHPSSLLARTPPAKMPGYIIYAHLQRASSSSVLDARAPKTRMHALTPVTRPQIINIAVNTPLLGVSKPQGKVVELGKGKRECEVEMSLVGEKGRVGWGLGVRKVVQRKEGGGWVIEKIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.85
4 0.82
5 0.83
6 0.83
7 0.81
8 0.77
9 0.75
10 0.74
11 0.68
12 0.62
13 0.54
14 0.46
15 0.37
16 0.33
17 0.26
18 0.19
19 0.18
20 0.19
21 0.22
22 0.25
23 0.28
24 0.31
25 0.33
26 0.33
27 0.39
28 0.41
29 0.44
30 0.49
31 0.51
32 0.48
33 0.5
34 0.54
35 0.53
36 0.54
37 0.48
38 0.41
39 0.38
40 0.34
41 0.32
42 0.31
43 0.29
44 0.3
45 0.38
46 0.47
47 0.54
48 0.63
49 0.7
50 0.75
51 0.81
52 0.85
53 0.86
54 0.87
55 0.88
56 0.9
57 0.91
58 0.86
59 0.81
60 0.79
61 0.77
62 0.67
63 0.62
64 0.58
65 0.57
66 0.61
67 0.58
68 0.51
69 0.45
70 0.44
71 0.45
72 0.44
73 0.39
74 0.33
75 0.34
76 0.36
77 0.41
78 0.44
79 0.39
80 0.36
81 0.39
82 0.38
83 0.37
84 0.36
85 0.31
86 0.31
87 0.31
88 0.28
89 0.22
90 0.23
91 0.31
92 0.35
93 0.41
94 0.4
95 0.41
96 0.47
97 0.52
98 0.5
99 0.47
100 0.47
101 0.42
102 0.45
103 0.48
104 0.47
105 0.45
106 0.43
107 0.4
108 0.33
109 0.3
110 0.25
111 0.22
112 0.19
113 0.19
114 0.18
115 0.16
116 0.14
117 0.15
118 0.18
119 0.22
120 0.24
121 0.25
122 0.3
123 0.32
124 0.4
125 0.42
126 0.43
127 0.44
128 0.46
129 0.46
130 0.46
131 0.46
132 0.43
133 0.45
134 0.41
135 0.36
136 0.31
137 0.25
138 0.21
139 0.2
140 0.15
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.17
145 0.19
146 0.21
147 0.29
148 0.39
149 0.44
150 0.48
151 0.49
152 0.54
153 0.59
154 0.65
155 0.66
156 0.67
157 0.7
158 0.69
159 0.69
160 0.65
161 0.63
162 0.6
163 0.56
164 0.5
165 0.44
166 0.43
167 0.43
168 0.4
169 0.37
170 0.33
171 0.28
172 0.24
173 0.22
174 0.21
175 0.2
176 0.16
177 0.15
178 0.14
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.16
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.11
198 0.15
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.18
203 0.2
204 0.24
205 0.22
206 0.23
207 0.22
208 0.26
209 0.27
210 0.26
211 0.24
212 0.26
213 0.32
214 0.36
215 0.42
216 0.49
217 0.59
218 0.67
219 0.77
220 0.82
221 0.84
222 0.88
223 0.88
224 0.86
225 0.8
226 0.78
227 0.71
228 0.6
229 0.51
230 0.4
231 0.33
232 0.25
233 0.2
234 0.14
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.15
314 0.22
315 0.27
316 0.33
317 0.37
318 0.41
319 0.47
320 0.54
321 0.59
322 0.57
323 0.56
324 0.53
325 0.49
326 0.47
327 0.48
328 0.49
329 0.45
330 0.43
331 0.44
332 0.42
333 0.4
334 0.37
335 0.31
336 0.23
337 0.2
338 0.18
339 0.13
340 0.12
341 0.11
342 0.12
343 0.11
344 0.11
345 0.09
346 0.09
347 0.14
348 0.13
349 0.17
350 0.17
351 0.17
352 0.22
353 0.26
354 0.32
355 0.29
356 0.31
357 0.32
358 0.39
359 0.46
360 0.42
361 0.4
362 0.35
363 0.4
364 0.4
365 0.37
366 0.31
367 0.23
368 0.22
369 0.21
370 0.21
371 0.15
372 0.15
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.15
379 0.15
380 0.13
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.17
385 0.16
386 0.17
387 0.19
388 0.19
389 0.19
390 0.19
391 0.19
392 0.14
393 0.16
394 0.15
395 0.17
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.17
400 0.16
401 0.15
402 0.15
403 0.14
404 0.12
405 0.11
406 0.12
407 0.11
408 0.11
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.12
413 0.15
414 0.15
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.13
419 0.1
420 0.08
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.07
430 0.12
431 0.15
432 0.18
433 0.18
434 0.19
435 0.18
436 0.18
437 0.19
438 0.14
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.11
455 0.14
456 0.16
457 0.17
458 0.17
459 0.18
460 0.18
461 0.17
462 0.15
463 0.21
464 0.22
465 0.26
466 0.26
467 0.26
468 0.25
469 0.25
470 0.23
471 0.15
472 0.15
473 0.17
474 0.22
475 0.22
476 0.22
477 0.23
478 0.22
479 0.21
480 0.26
481 0.28
482 0.26
483 0.26
484 0.28
485 0.29
486 0.31
487 0.31
488 0.27
489 0.23
490 0.21
491 0.21
492 0.22
493 0.2
494 0.18
495 0.21
496 0.17
497 0.14
498 0.13
499 0.12
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.1
504 0.11
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.09
512 0.07
513 0.08
514 0.08
515 0.07
516 0.07
517 0.06
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.05
523 0.07
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.11
531 0.1
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.07
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.12
552 0.18
553 0.26
554 0.24
555 0.3
556 0.34
557 0.34
558 0.36
559 0.35
560 0.32
561 0.24
562 0.24
563 0.18
564 0.19
565 0.19
566 0.16
567 0.15
568 0.12
569 0.11
570 0.11
571 0.11
572 0.1
573 0.12
574 0.14
575 0.23
576 0.24
577 0.25
578 0.26
579 0.26
580 0.25
581 0.29
582 0.33
583 0.31
584 0.37
585 0.4
586 0.39
587 0.38
588 0.39
589 0.33
590 0.29
591 0.29
592 0.25
593 0.24
594 0.23
595 0.23
596 0.24
597 0.27
598 0.29
599 0.25
600 0.24
601 0.24
602 0.26
603 0.28
604 0.29
605 0.3
606 0.3
607 0.29
608 0.29
609 0.29
610 0.29
611 0.31
612 0.29
613 0.25
614 0.23
615 0.23
616 0.21
617 0.22
618 0.24
619 0.3
620 0.35
621 0.44
622 0.51
623 0.58
624 0.63
625 0.64
626 0.65
627 0.57
628 0.51
629 0.44
630 0.35
631 0.27
632 0.21
633 0.17
634 0.11
635 0.09
636 0.08
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.08
641 0.09
642 0.1
643 0.14
644 0.17
645 0.19
646 0.24
647 0.26
648 0.26
649 0.3
650 0.3
651 0.34
652 0.34
653 0.32
654 0.33
655 0.32
656 0.29
657 0.27
658 0.27
659 0.2
660 0.2
661 0.2
662 0.13
663 0.12
664 0.12
665 0.09
666 0.09
667 0.09
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.06
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.07
686 0.09
687 0.11
688 0.12
689 0.11
690 0.11
691 0.11
692 0.11
693 0.1
694 0.07
695 0.06
696 0.05
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.03
701 0.03
702 0.03
703 0.03
704 0.03
705 0.04
706 0.04
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.09
713 0.09
714 0.11
715 0.13
716 0.13
717 0.13
718 0.13
719 0.14
720 0.1
721 0.1
722 0.09
723 0.1
724 0.09
725 0.11
726 0.11
727 0.11
728 0.11
729 0.14
730 0.14
731 0.13
732 0.13
733 0.13
734 0.16
735 0.19
736 0.21
737 0.19
738 0.19
739 0.2
740 0.22
741 0.27
742 0.24
743 0.23
744 0.23
745 0.23
746 0.23
747 0.25
748 0.23
749 0.17
750 0.16
751 0.15
752 0.13
753 0.11
754 0.1
755 0.07
756 0.07
757 0.07
758 0.06
759 0.06
760 0.05
761 0.04
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.05
766 0.06
767 0.08
768 0.08
769 0.09
770 0.08
771 0.11
772 0.12
773 0.18
774 0.21
775 0.2
776 0.29
777 0.32
778 0.35
779 0.37
780 0.39
781 0.41
782 0.41
783 0.43
784 0.36
785 0.37
786 0.37
787 0.31
788 0.3
789 0.22
790 0.19
791 0.15
792 0.14
793 0.1
794 0.07
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.09
799 0.11
800 0.14
801 0.2
802 0.24
803 0.27
804 0.28
805 0.33
806 0.32
807 0.31
808 0.3
809 0.24
810 0.25
811 0.25
812 0.25
813 0.26
814 0.29
815 0.3
816 0.28
817 0.29
818 0.27
819 0.26
820 0.28
821 0.22
822 0.19
823 0.22
824 0.24
825 0.22
826 0.21
827 0.19
828 0.18
829 0.18
830 0.16
831 0.12
832 0.1
833 0.11
834 0.11
835 0.09
836 0.08
837 0.08
838 0.09
839 0.08
840 0.09
841 0.09
842 0.08
843 0.09
844 0.1
845 0.1
846 0.14
847 0.14
848 0.13
849 0.12
850 0.12
851 0.11
852 0.11
853 0.1
854 0.04
855 0.05
856 0.07
857 0.1
858 0.11
859 0.11
860 0.11
861 0.14
862 0.15
863 0.18
864 0.2
865 0.19
866 0.22
867 0.24
868 0.27
869 0.28
870 0.31
871 0.29
872 0.26
873 0.25
874 0.23
875 0.22
876 0.19
877 0.15
878 0.1
879 0.09
880 0.08
881 0.08
882 0.06
883 0.05
884 0.05
885 0.06
886 0.07
887 0.07
888 0.08
889 0.09
890 0.1
891 0.12
892 0.15
893 0.16
894 0.16
895 0.16
896 0.17
897 0.19
898 0.24
899 0.22
900 0.21
901 0.22
902 0.25
903 0.24
904 0.25
905 0.22
906 0.18
907 0.2
908 0.17
909 0.17
910 0.13
911 0.15
912 0.13
913 0.12
914 0.12
915 0.09
916 0.08
917 0.07
918 0.06
919 0.04
920 0.04
921 0.03
922 0.04
923 0.03
924 0.03
925 0.03
926 0.03
927 0.03
928 0.03
929 0.04
930 0.03
931 0.03
932 0.03
933 0.04
934 0.05
935 0.06
936 0.07
937 0.08
938 0.1
939 0.1
940 0.11
941 0.11
942 0.17
943 0.22
944 0.25
945 0.27
946 0.3
947 0.31
948 0.33
949 0.36
950 0.36
951 0.35
952 0.37
953 0.36
954 0.34
955 0.33
956 0.34
957 0.32
958 0.26
959 0.21
960 0.16
961 0.15
962 0.13
963 0.13
964 0.13
965 0.17
966 0.23
967 0.24
968 0.25
969 0.26
970 0.31
971 0.36
972 0.43
973 0.49
974 0.49
975 0.49
976 0.49
977 0.51
978 0.48
979 0.46
980 0.4
981 0.31
982 0.26
983 0.29
984 0.28
985 0.28
986 0.28
987 0.26
988 0.23
989 0.27
990 0.26
991 0.29
992 0.28
993 0.29
994 0.29
995 0.27
996 0.26
997 0.22
998 0.23
999 0.17
1000 0.18
1001 0.14
1002 0.16
1003 0.19
1004 0.19
1005 0.21
1006 0.19
1007 0.18
1008 0.17
1009 0.2
1010 0.19
1011 0.21
1012 0.24
1013 0.23
1014 0.23
1015 0.23
1016 0.23
1017 0.18
1018 0.18
1019 0.14
1020 0.13
1021 0.14
1022 0.17
1023 0.21
1024 0.24
1025 0.25
1026 0.26
1027 0.26
1028 0.3
1029 0.3
1030 0.36
1031 0.35
1032 0.37
1033 0.36
1034 0.37
1035 0.39
1036 0.34
1037 0.32
1038 0.24
1039 0.23
1040 0.2
1041 0.2
1042 0.22
1043 0.24
1044 0.22
1045 0.22
1046 0.2
1047 0.18
1048 0.17
1049 0.21
1050 0.23
1051 0.22
1052 0.26
1053 0.26
1054 0.29
1055 0.3
1056 0.29
1057 0.28
1058 0.24
1059 0.22
1060 0.18
1061 0.18
1062 0.14
1063 0.13
1064 0.13
1065 0.1
1066 0.08
1067 0.08
1068 0.08
1069 0.08
1070 0.09
1071 0.09
1072 0.09
1073 0.09
1074 0.09
1075 0.1
1076 0.1
1077 0.1
1078 0.11
1079 0.09
1080 0.1
1081 0.11
1082 0.14
1083 0.18
1084 0.26
1085 0.28
1086 0.33
1087 0.37
1088 0.39
1089 0.44
1090 0.48
1091 0.47
1092 0.45
1093 0.46
1094 0.43
1095 0.42
1096 0.39
1097 0.32
1098 0.28
1099 0.24
1100 0.17
1101 0.17
1102 0.14
1103 0.13
1104 0.16
1105 0.18
1106 0.19
1107 0.19
1108 0.19
1109 0.16
1110 0.2
1111 0.19
1112 0.17
1113 0.16
1114 0.14
1115 0.13
1116 0.14
1117 0.18
1118 0.14
1119 0.15
1120 0.13
1121 0.16
1122 0.18
1123 0.21
1124 0.2
1125 0.17
1126 0.22
1127 0.23
1128 0.26
1129 0.27
1130 0.3
1131 0.31
1132 0.3
1133 0.33
1134 0.32
1135 0.33
1136 0.31
1137 0.29
1138 0.28
1139 0.28
1140 0.29
1141 0.27
1142 0.23
1143 0.2
1144 0.21
1145 0.22
1146 0.18
1147 0.16
1148 0.17
1149 0.18
1150 0.19
1151 0.23
1152 0.26
1153 0.26
1154 0.33
1155 0.34
1156 0.33
1157 0.37
1158 0.44
1159 0.42
1160 0.42
1161 0.46
1162 0.43
1163 0.5
1164 0.54
1165 0.55
1166 0.51
1167 0.51
1168 0.46
1169 0.42
1170 0.44
1171 0.37
1172 0.36
1173 0.3
1174 0.28
1175 0.26
1176 0.26
1177 0.23
1178 0.16
1179 0.14
1180 0.11
1181 0.1
1182 0.1
1183 0.14
1184 0.21
1185 0.22
1186 0.26
1187 0.27
1188 0.27
1189 0.32
1190 0.33
1191 0.37
1192 0.36
1193 0.4
1194 0.45
1195 0.47
1196 0.47
1197 0.47
1198 0.46
1199 0.38
1200 0.37
1201 0.37
1202 0.31
1203 0.27
1204 0.29
1205 0.25
1206 0.25
1207 0.23
1208 0.18
1209 0.14
1210 0.13
1211 0.14
1212 0.12
1213 0.11
1214 0.14
1215 0.2
1216 0.26
1217 0.28
1218 0.31
1219 0.31
1220 0.38
1221 0.45
1222 0.45
1223 0.46
1224 0.43
1225 0.45
1226 0.47
1227 0.5
1228 0.46
1229 0.41
1230 0.38