FuNGI

A0A178EPD8

Protein Details

Accession

A0A178EPD8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
265-284	LNQAKPFKRKAKKTAPEPKQ	Hydrophilic
432-451	AGSTPKKVRRPFKIGGKGKS	Basic
501-532	PEEKAERKRAELKRKNDEAAKKQAQSKKKKRF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
271-277	FKRKAKK
437-450	KKVRRPFKIGGKGK
504-532	KAERKRAELKRKNDEAAKKQAQSKKKKRF

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MACWRVLELSDQPDGRHVPQLLVKPVFHATSYTVHLTDLSNIWSEELALDGIVDRASTEQSPIEVSKQDTSQLPILLDNVRRSLDLSDDAACRLAQSDDDGVTLHSTISLPEPLDSLTWKFRLEKRTSTVLKNELILPLLISSHIQHERITRLISAITDKDKALTRLIDQYESSNLDLAAAFPSMGVSKPGRRMIKREQAARHVPALQPFREETWRKETEQLQDPSVTTLELFHEALAQSTAHVPAQLKSKEQSNAWWTMIPSQLNQAKPFKRKAKKTAPEPKQVIVGSSDDETEDEFEIHENFKTRDFPPKSATSPRHPPPVQNGKPENGDESTDDEDDLDRPIKSQSQSQKHSHIIQNSSPQARSPSPQDLPAPELETQPEATSKRKVFRIGGKTKDVIREPSPPASQQDNVAAEKDTVSSPPQQVPEEAGSTPKKVRRPFKIGGKGKSANIGGQEEEDSVTIANQKTTNQSPKAQPESLPRPRAVKDATPEKTHEETPEEKAERKRAELKRKNDEAAKKQAQSKKKKRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.32
3	0.34
4	0.31
5	0.29
6	0.34
7	0.4
8	0.43
9	0.43
10	0.41
11	0.37
12	0.4
13	0.37
14	0.32
15	0.27
16	0.22
17	0.21
18	0.26
19	0.25
20	0.22
21	0.21
22	0.22
23	0.21
24	0.21
25	0.19
26	0.17
27	0.15
28	0.15
29	0.15
30	0.14
31	0.13
32	0.1
33	0.1
34	0.08
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.06
41	0.05
42	0.06
43	0.08
44	0.09
45	0.1
46	0.1
47	0.11
48	0.14
49	0.15
50	0.17
51	0.18
52	0.21
53	0.23
54	0.23
55	0.25
56	0.24
57	0.27
58	0.27
59	0.26
60	0.24
61	0.21
62	0.22
63	0.24
64	0.26
65	0.25
66	0.24
67	0.23
68	0.22
69	0.23
70	0.22
71	0.2
72	0.18
73	0.18
74	0.19
75	0.19
76	0.19
77	0.19
78	0.17
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.08
83	0.1
84	0.12
85	0.11
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.11
90	0.11
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.09
96	0.11
97	0.1
98	0.1
99	0.11
100	0.11
101	0.12
102	0.13
103	0.14
104	0.16
105	0.18
106	0.19
107	0.24
108	0.29
109	0.37
110	0.41
111	0.45
112	0.46
113	0.54
114	0.57
115	0.56
116	0.57
117	0.53
118	0.49
119	0.43
120	0.39
121	0.3
122	0.26
123	0.21
124	0.15
125	0.11
126	0.09
127	0.08
128	0.07
129	0.07
130	0.12
131	0.15
132	0.15
133	0.16
134	0.2
135	0.22
136	0.24
137	0.24
138	0.19
139	0.17
140	0.17
141	0.16
142	0.16
143	0.16
144	0.17
145	0.17
146	0.17
147	0.18
148	0.2
149	0.21
150	0.2
151	0.19
152	0.18
153	0.24
154	0.25
155	0.24
156	0.22
157	0.22
158	0.22
159	0.22
160	0.21
161	0.14
162	0.12
163	0.11
164	0.11
165	0.1
166	0.08
167	0.06
168	0.06
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.06
173	0.08
174	0.09
175	0.13
176	0.18
177	0.26
178	0.32
179	0.34
180	0.41
181	0.48
182	0.56
183	0.58
184	0.6
185	0.58
186	0.59
187	0.63
188	0.58
189	0.51
190	0.43
191	0.39
192	0.37
193	0.37
194	0.29
195	0.26
196	0.24
197	0.24
198	0.3
199	0.31
200	0.28
201	0.33
202	0.35
203	0.34
204	0.39
205	0.41
206	0.4
207	0.46
208	0.44
209	0.37
210	0.35
211	0.34
212	0.29
213	0.25
214	0.18
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.07
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.06
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.17
234	0.17
235	0.18
236	0.19
237	0.23
238	0.24
239	0.24
240	0.26
241	0.23
242	0.25
243	0.24
244	0.24
245	0.2
246	0.2
247	0.22
248	0.18
249	0.15
250	0.17
251	0.21
252	0.21
253	0.24
254	0.28
255	0.31
256	0.36
257	0.44
258	0.48
259	0.53
260	0.59
261	0.66
262	0.71
263	0.73
264	0.79
265	0.81
266	0.79
267	0.8
268	0.75
269	0.66
270	0.59
271	0.51
272	0.41
273	0.31
274	0.24
275	0.16
276	0.13
277	0.13
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.06
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.11
292	0.14
293	0.15
294	0.25
295	0.28
296	0.3
297	0.33
298	0.37
299	0.4
300	0.45
301	0.49
302	0.45
303	0.5
304	0.51
305	0.56
306	0.52
307	0.51
308	0.52
309	0.59
310	0.56
311	0.56
312	0.55
313	0.48
314	0.5
315	0.48
316	0.4
317	0.3
318	0.26
319	0.19
320	0.19
321	0.19
322	0.16
323	0.15
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.12
328	0.11
329	0.08
330	0.09
331	0.1
332	0.14
333	0.15
334	0.22
335	0.3
336	0.37
337	0.44
338	0.48
339	0.53
340	0.53
341	0.58
342	0.56
343	0.52
344	0.47
345	0.44
346	0.47
347	0.46
348	0.44
349	0.38
350	0.35
351	0.33
352	0.31
353	0.3
354	0.28
355	0.3
356	0.29
357	0.32
358	0.33
359	0.31
360	0.31
361	0.3
362	0.28
363	0.21
364	0.21
365	0.18
366	0.17
367	0.16
368	0.14
369	0.16
370	0.15
371	0.18
372	0.24
373	0.28
374	0.32
375	0.36
376	0.4
377	0.42
378	0.49
379	0.57
380	0.58
381	0.6
382	0.59
383	0.59
384	0.57
385	0.58
386	0.51
387	0.46
388	0.4
389	0.41
390	0.4
391	0.43
392	0.42
393	0.38
394	0.39
395	0.38
396	0.35
397	0.3
398	0.32
399	0.29
400	0.28
401	0.27
402	0.24
403	0.2
404	0.19
405	0.18
406	0.13
407	0.11
408	0.13
409	0.17
410	0.19
411	0.23
412	0.25
413	0.25
414	0.25
415	0.28
416	0.28
417	0.26
418	0.23
419	0.25
420	0.24
421	0.26
422	0.31
423	0.33
424	0.38
425	0.44
426	0.53
427	0.57
428	0.64
429	0.69
430	0.74
431	0.8
432	0.81
433	0.78
434	0.78
435	0.72
436	0.64
437	0.62
438	0.52
439	0.43
440	0.38
441	0.34
442	0.25
443	0.22
444	0.22
445	0.17
446	0.16
447	0.14
448	0.11
449	0.09
450	0.09
451	0.12
452	0.12
453	0.14
454	0.15
455	0.17
456	0.23
457	0.31
458	0.39
459	0.39
460	0.45
461	0.5
462	0.58
463	0.64
464	0.6
465	0.57
466	0.58
467	0.64
468	0.67
469	0.65
470	0.58
471	0.56
472	0.56
473	0.58
474	0.54
475	0.5
476	0.49
477	0.54
478	0.56
479	0.55
480	0.56
481	0.56
482	0.54
483	0.5
484	0.44
485	0.4
486	0.39
487	0.4
488	0.47
489	0.44
490	0.46
491	0.51
492	0.57
493	0.55
494	0.58
495	0.63
496	0.63
497	0.71
498	0.75
499	0.77
500	0.79
501	0.82
502	0.82
503	0.81
504	0.81
505	0.78
506	0.79
507	0.78
508	0.73
509	0.75
510	0.76
511	0.77
512	0.79

A0A178EPD8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer