FuNGI

A0A178E554

Protein Details

Accession

A0A178E554

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
618-644	QDNIEKQMPRRVKKRRKLDDDSFEEYV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
627-634	RRVKKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, cyto 9, cyto_mito 5.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02184 HAT PF14559 TPR_19

Amino Acid Sequences

MESSRGPPRVKNKAAAPIQISAEQLLREAVDRQDEKLKAPTQRFADMEELHEFQGRKRKEFEDYVRRNRINMNNWMRYAQWELEQKEFRRARSIFERALDVDSTSVALWLRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYVYMEETLGNIDGARSVFERWVQWEPEEAAWSSYIKLEKRHGEFERARAIFERFTIVHPEPKNWIKWAKFEEENGTSDLVRDVYGTAVETLGDEFMDEKLFMAYAKFEARLKELERARAIYKFALDRMPRSKSVNLHKAFTTFEKQYGDRDGIEDVILSKRRVHYEEQVKENPKNYDAWIDFARLEETSGNQDRVRDIYERAIAQIPPTQEKRHWRRYIYLWLFYAVYEETVSRDIERTRQIYQECIRLLPHKRFTFAKVWLMFAHFEVRQAQLTSARRLLGQSIGMCPKDKLFKGYIELEMKLFEFTRCRQLYTKYIEWNGSNCQTWIKFAELERGLDDLDRARAIFELAADEPQLDMPELLWKAYIDFEEGEGEYERTRALYERLLQKTDHVKVWTSWAQFEIGVPDEDDSAAAQDDDEDQPVSASAKLRARAIFERAHKRLKEKDLKEERVALLNAWRSFEAIHGDKTDQDNIEKQMPRRVKKRRKLDDDSFEEYVDYVFPADDESAAKLAKLMANAQRWKMAQAQQKQVAEEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.67
3	0.61
4	0.55
5	0.52
6	0.47
7	0.41
8	0.32
9	0.29
10	0.22
11	0.19
12	0.16
13	0.13
14	0.12
15	0.14
16	0.15
17	0.22
18	0.23
19	0.26
20	0.33
21	0.34
22	0.36
23	0.42
24	0.45
25	0.45
26	0.49
27	0.53
28	0.49
29	0.54
30	0.52
31	0.47
32	0.48
33	0.41
34	0.4
35	0.36
36	0.33
37	0.28
38	0.32
39	0.28
40	0.26
41	0.34
42	0.35
43	0.35
44	0.39
45	0.42
46	0.45
47	0.54
48	0.6
49	0.61
50	0.68
51	0.74
52	0.78
53	0.76
54	0.7
55	0.69
56	0.68
57	0.64
58	0.65
59	0.64
60	0.61
61	0.62
62	0.61
63	0.53
64	0.47
65	0.44
66	0.35
67	0.32
68	0.33
69	0.35
70	0.41
71	0.48
72	0.46
73	0.52
74	0.53
75	0.48
76	0.5
77	0.48
78	0.47
79	0.49
80	0.55
81	0.49
82	0.47
83	0.49
84	0.41
85	0.43
86	0.36
87	0.27
88	0.2
89	0.16
90	0.14
91	0.11
92	0.1
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.08
98	0.07
99	0.08
100	0.11
101	0.13
102	0.18
103	0.2
104	0.22
105	0.25
106	0.26
107	0.34
108	0.38
109	0.4
110	0.41
111	0.46
112	0.47
113	0.47
114	0.5
115	0.43
116	0.35
117	0.31
118	0.28
119	0.24
120	0.21
121	0.18
122	0.17
123	0.17
124	0.18
125	0.18
126	0.19
127	0.22
128	0.26
129	0.33
130	0.31
131	0.32
132	0.33
133	0.35
134	0.34
135	0.3
136	0.27
137	0.19
138	0.18
139	0.17
140	0.15
141	0.12
142	0.09
143	0.08
144	0.08
145	0.07
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.1
150	0.12
151	0.13
152	0.16
153	0.21
154	0.21
155	0.21
156	0.23
157	0.24
158	0.23
159	0.24
160	0.2
161	0.16
162	0.15
163	0.15
164	0.13
165	0.13
166	0.17
167	0.16
168	0.2
169	0.26
170	0.33
171	0.36
172	0.44
173	0.43
174	0.49
175	0.5
176	0.51
177	0.54
178	0.47
179	0.44
180	0.38
181	0.38
182	0.29
183	0.26
184	0.25
185	0.16
186	0.18
187	0.23
188	0.22
189	0.28
190	0.28
191	0.29
192	0.31
193	0.35
194	0.36
195	0.34
196	0.39
197	0.34
198	0.39
199	0.42
200	0.42
201	0.4
202	0.39
203	0.41
204	0.36
205	0.36
206	0.3
207	0.27
208	0.2
209	0.19
210	0.17
211	0.11
212	0.09
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.08
238	0.09
239	0.1
240	0.12
241	0.14
242	0.17
243	0.18
244	0.25
245	0.26
246	0.3
247	0.3
248	0.31
249	0.31
250	0.29
251	0.29
252	0.22
253	0.22
254	0.18
255	0.18
256	0.21
257	0.21
258	0.23
259	0.28
260	0.3
261	0.3
262	0.33
263	0.36
264	0.36
265	0.44
266	0.49
267	0.45
268	0.44
269	0.42
270	0.39
271	0.37
272	0.33
273	0.29
274	0.2
275	0.21
276	0.22
277	0.22
278	0.23
279	0.24
280	0.22
281	0.17
282	0.17
283	0.15
284	0.12
285	0.12
286	0.09
287	0.08
288	0.1
289	0.12
290	0.12
291	0.13
292	0.15
293	0.18
294	0.21
295	0.23
296	0.28
297	0.36
298	0.41
299	0.45
300	0.49
301	0.51
302	0.5
303	0.51
304	0.44
305	0.35
306	0.3
307	0.25
308	0.24
309	0.21
310	0.21
311	0.18
312	0.18
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.1
317	0.1
318	0.08
319	0.07
320	0.11
321	0.13
322	0.14
323	0.14
324	0.14
325	0.14
326	0.15
327	0.17
328	0.13
329	0.12
330	0.14
331	0.15
332	0.15
333	0.16
334	0.17
335	0.14
336	0.14
337	0.16
338	0.14
339	0.16
340	0.18
341	0.19
342	0.21
343	0.32
344	0.39
345	0.47
346	0.52
347	0.5
348	0.52
349	0.56
350	0.62
351	0.56
352	0.51
353	0.41
354	0.36
355	0.34
356	0.29
357	0.25
358	0.14
359	0.1
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.08
365	0.07
366	0.09
367	0.09
368	0.13
369	0.17
370	0.19
371	0.19
372	0.23
373	0.24
374	0.28
375	0.3
376	0.31
377	0.27
378	0.26
379	0.25
380	0.27
381	0.32
382	0.34
383	0.4
384	0.35
385	0.38
386	0.38
387	0.42
388	0.41
389	0.4
390	0.4
391	0.32
392	0.32
393	0.3
394	0.3
395	0.26
396	0.21
397	0.2
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.14
402	0.14
403	0.14
404	0.14
405	0.17
406	0.2
407	0.22
408	0.22
409	0.21
410	0.2
411	0.2
412	0.21
413	0.15
414	0.15
415	0.13
416	0.15
417	0.18
418	0.18
419	0.18
420	0.18
421	0.19
422	0.22
423	0.22
424	0.22
425	0.21
426	0.22
427	0.26
428	0.28
429	0.31
430	0.27
431	0.27
432	0.24
433	0.22
434	0.2
435	0.17
436	0.15
437	0.11
438	0.12
439	0.13
440	0.23
441	0.23
442	0.25
443	0.27
444	0.32
445	0.38
446	0.42
447	0.45
448	0.4
449	0.42
450	0.42
451	0.4
452	0.38
453	0.35
454	0.31
455	0.26
456	0.21
457	0.22
458	0.2
459	0.21
460	0.2
461	0.18
462	0.18
463	0.18
464	0.26
465	0.24
466	0.24
467	0.23
468	0.22
469	0.19
470	0.17
471	0.17
472	0.1
473	0.1
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.11
493	0.11
494	0.11
495	0.11
496	0.1
497	0.11
498	0.12
499	0.12
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.12
508	0.1
509	0.1
510	0.1
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.11
515	0.15
516	0.21
517	0.3
518	0.34
519	0.36
520	0.35
521	0.39
522	0.45
523	0.43
524	0.42
525	0.34
526	0.33
527	0.32
528	0.39
529	0.39
530	0.32
531	0.3
532	0.26
533	0.25
534	0.23
535	0.23
536	0.18
537	0.14
538	0.13
539	0.12
540	0.12
541	0.11
542	0.11
543	0.1
544	0.08
545	0.07
546	0.06
547	0.06
548	0.05
549	0.05
550	0.08
551	0.09
552	0.1
553	0.1
554	0.09
555	0.09
556	0.1
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.17
561	0.21
562	0.23
563	0.27
564	0.28
565	0.33
566	0.35
567	0.38
568	0.39
569	0.43
570	0.52
571	0.54
572	0.61
573	0.59
574	0.62
575	0.66
576	0.69
577	0.71
578	0.66
579	0.71
580	0.73
581	0.77
582	0.74
583	0.71
584	0.61
585	0.57
586	0.52
587	0.42
588	0.38
589	0.38
590	0.35
591	0.31
592	0.29
593	0.23
594	0.23
595	0.24
596	0.25
597	0.21
598	0.22
599	0.23
600	0.24
601	0.27
602	0.31
603	0.34
604	0.28
605	0.28
606	0.3
607	0.32
608	0.39
609	0.41
610	0.4
611	0.45
612	0.52
613	0.58
614	0.63
615	0.71
616	0.73
617	0.78
618	0.87
619	0.89
620	0.9
621	0.91
622	0.91
623	0.9
624	0.87
625	0.83
626	0.73
627	0.62
628	0.52
629	0.42
630	0.32
631	0.22
632	0.15
633	0.08
634	0.07
635	0.06
636	0.08
637	0.08
638	0.09
639	0.09
640	0.11
641	0.13
642	0.13
643	0.13
644	0.12
645	0.14
646	0.16
647	0.16
648	0.21
649	0.26
650	0.35
651	0.41
652	0.42
653	0.45
654	0.44
655	0.45
656	0.46
657	0.47
658	0.47
659	0.51
660	0.59
661	0.61
662	0.63

A0A178E554

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer