Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A178EG83

Protein Details
Accession A0A178EG83    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-283YDSASRSPSRSRRRSYDDRSRSRSRSYDSRERRTRSRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-302RSRRRSYDDRSRSRSRSYDSRERRTRSRSAGELSQRSAKSRSRSRSRT
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPQFDRADAHALLDDRGYSGALIRGQNPALLFEKGVRERITESYYWKEQCFGLNAATLCDRADNLQFIGGTTGIMGKPTPFLCLAFKLLQLVPEKAIILEYLNFRGDEHDDEPEEPEQDLNAKGKLGSFKYLRCLAAFYIRLAWEPVEIYTTLEPLLTDYRKIKRRLKDSYTLTHVDQFIDDLLTKDRICATSLWKLPSRANLEDLELLEPRESPLGDEVDALDDEEMNKRSHGSAQSYRSRSYDSASRSPSRSRRRSYDDRSRSRSRSYDSRERRTRSRSAGELSQRSAKSRSRSRSRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.2
4 0.12
5 0.13
6 0.11
7 0.08
8 0.09
9 0.11
10 0.15
11 0.17
12 0.17
13 0.21
14 0.21
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.2
19 0.19
20 0.18
21 0.18
22 0.26
23 0.26
24 0.31
25 0.28
26 0.27
27 0.29
28 0.33
29 0.34
30 0.28
31 0.3
32 0.33
33 0.38
34 0.39
35 0.37
36 0.35
37 0.31
38 0.32
39 0.31
40 0.26
41 0.21
42 0.22
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.18
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.1
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.11
59 0.09
60 0.07
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.1
67 0.1
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.14
72 0.16
73 0.19
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.21
79 0.21
80 0.2
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.13
85 0.13
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.15
100 0.16
101 0.18
102 0.17
103 0.16
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.14
115 0.14
116 0.17
117 0.18
118 0.19
119 0.23
120 0.26
121 0.25
122 0.22
123 0.22
124 0.18
125 0.21
126 0.21
127 0.17
128 0.16
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.09
146 0.08
147 0.1
148 0.15
149 0.22
150 0.29
151 0.36
152 0.43
153 0.47
154 0.55
155 0.62
156 0.64
157 0.66
158 0.64
159 0.62
160 0.6
161 0.55
162 0.47
163 0.41
164 0.35
165 0.27
166 0.22
167 0.16
168 0.11
169 0.09
170 0.09
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.16
181 0.21
182 0.25
183 0.28
184 0.3
185 0.32
186 0.32
187 0.38
188 0.39
189 0.33
190 0.32
191 0.29
192 0.28
193 0.27
194 0.26
195 0.21
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.08
213 0.06
214 0.07
215 0.11
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.18
222 0.22
223 0.26
224 0.32
225 0.39
226 0.48
227 0.51
228 0.52
229 0.49
230 0.48
231 0.41
232 0.38
233 0.37
234 0.35
235 0.39
236 0.43
237 0.47
238 0.46
239 0.54
240 0.6
241 0.64
242 0.67
243 0.67
244 0.7
245 0.74
246 0.81
247 0.82
248 0.84
249 0.84
250 0.84
251 0.85
252 0.85
253 0.8
254 0.77
255 0.74
256 0.69
257 0.69
258 0.68
259 0.71
260 0.72
261 0.78
262 0.8
263 0.81
264 0.83
265 0.79
266 0.79
267 0.77
268 0.75
269 0.7
270 0.66
271 0.68
272 0.69
273 0.67
274 0.62
275 0.62
276 0.55
277 0.53
278 0.53
279 0.51
280 0.51
281 0.56
282 0.62